大會開始後，毛澤東因故未到會，但給大會發來了電報：
……當此抗戰周年，全國上下精誠團結，再接再勵，誓驅強冠，而敵人進攻，亦正有加無減之際，國民參政會恰於此時開幕，國人同慶。
澤東備員一席，因齒病及瑣務羈身，未能親聆諸公參論宏議，就管見所及，凡有利於抗戰建國諸大端，已托其他同誌，並案詳陳，效其綿薄。
寇深禍亟，神州有陸沉之憂；民眾奮起，大難有轉旋之望。轉旋之術多端，竊謂以三言為最切，一曰，堅持抗戰；二曰，堅持統一戰線；三曰，堅持持久戰。誠能循序猛進，勿餒勿輟，則勝利屬我，決然無疑。值茲本會開幕之日，謹電馳陳，並向諸兄致民族革命敬禮！
毛澤東
國民黨臨時代表大會，也在一定程度上轉變了“老子黨”的惡劣作風，尊稱共產黨人為有誌之士，並發表了對共產黨的宣言書，“禱祝”國共兩大黨和各黨各派團結禦侮，共赴國難。
不久，國民黨軍委會政治部成立，陳誠、周恩來分任正、副部長，主管政治宣傳的第三廳廳長由郭沫若擔任，三廳的人員大都是共產黨員，陳誠對三廳的工作給予了一定支持，郭沫若找陳誠要活動經費，陳誠開口就給了80萬，80萬元相當於一個軍的經費……
周恩來曾將毛澤東的《論持久戰》的基本精神向副總參謀長白崇禧介紹過，白崇禧將此精神摘成兩句話：“積小勝為大勝，以空間換時間。”征得周恩來的同意，白崇禧向蔣介石進行了轉述，蔣介石非常感興趣，由軍委會通令全軍作為對日作戰的最高戰略方針。毛澤東的《論持久戰》在武漢印成了小冊子，發給長江方麵和戰場的國民黨軍隊，一些部隊還自由選擇《論持久戰》為政治教材，組織官兵學習、領會。
1938年9月底，周恩來從延安飛抵武漢，風塵仆仆去見蔣介石，將毛澤東的一封親筆信，交給了蔣介石。
雄才大略的毛澤東寫道：
介石先生惠鑒：
恩來諸同誌回延安稱述先生盛德，欽佩無餘。先生指導全民族進行空前偉大的民族革命戰爭，凡我國人無不崇仰。十五個月之抗戰，愈挫愈奮，再接再勵，雖頑寇尚未消其凶鋒，然勝利之始基，業已奠定，前途之光明，希望無窮。此次，敝黨中央六次全會，一致認為抗戰形勢有漸漸進入一新階段之趨勢。此階段之特點，將使一方麵更加困難；然又一方麵必更加進步，而其任務在於團結全民，鞏固與擴大抗日陣線，堅持持久戰爭，動員新生力量，克服困難，準備反攻。在此過程中，敵人必利用歐洲事變與吾國弱點，策動各種不利於全國統一團結之破壞陰謀。因此，同人認為此時期中之統一團結，比任何時期為重要。唯一領導之下，嚴防與擊破敵人之破壞陰謀，清洗國人之悲觀情緒，提高民族覺悟及勝利信心，並施行新階段中的戰時政策，方能達到停止敵人之進攻，準備我之反攻之目的。因武漢緊張，故欲恩來同誌不待會議完華，即行返漢，晉謁先生，商承一切，未盡之意，慨托恩來麵陳。此時此際，國共兩黨，休戚與共，亦即長期戰爭與長期團結之重要關頭。澤東堅決相信，國共兩黨必能於長期的艱苦奮鬥中，克服困難，準備力量，實行反攻，驅逐頑寇，而使自己雄立於東亞。此物此誌，知先生必有同心也。敬祝健康！
並致
民族革命之禮
毛澤東謹啟
民國十七年九月二十九日
毛澤東寫給蔣介石的這封熱情洋溢的親筆信，對於武漢大會戰，國民政府內意見不一，汪精衛等主和派甚囂塵上，處境並不妙的蔣介石來說，無疑是一種莫大的信任和支持。
看完毛澤東的親筆信，蔣介石為他這個老對手的坦蕩襟懷所感動，他高興得連連點頭。