7月，林徽因同梁思成、莫宗江、紀玉堂赴五台山考察古建築，
林徽因意外地發現榆次宋代的雨花宮及唐代佛光寺的建築年代。
7月12日，林徽因一行到代縣，得知發生“盧溝橋事變”，於是匆匆返回北平。
8月，林徽因一家從天津乘船去煙台，又從濟南乘火車經徐州、鄭州、武漢南下，9月中旬抵長沙。
11月下旬，日機轟炸長沙，林徽因一家險些喪生。不久，他們離開長沙，經常德、晃縣、貴陽、鎮寧、普安、曲靖到昆明。
1938 年34歲
1月，林徽因一家住昆明翠湖前市長巡律街住宅，不久，莫宗江，陳明達、劉誌平、劉敦楨也到昆明，經與中美庚款基金會聯係，組建營造學社西南小分隊。
是年，作詩《昆明即景：一、茶鋪，二、小樓》。
1939 年35歲
年初，因日機轟炸，林徽因一家搬至郊區龍泉鎮麥地村。
2月5日，發表散文《彼此》。
6月28日，發表詩《除夕看花》。
冬，梁思成、劉敦楨等去雲南、四川、陝西、西康等地作古建築考察，林徽因為雲南大學設計女生宿舍。
1940年36歲
初冬，營造學社隨史語所入川，林徽因一家亦迀四川南溪縣李莊鎮上壩村。不久，林徽因肺病複發，從此抱病臥床四年。
1941年37歲
在李莊鎮。
春，三弟恒在對日作戰中身亡。
1942年38歲
在李莊鎮。
春，作詩《一天》。
是年，梁思成接受國立編譯館委托，編寫《中國建築史》，林徽因為寫作《中國建築史》抱病閱讀二十四史，作資料準備。她寫了該書的第七章，五代、宋、遼、金部分，並承擔了全部書稿的校閱和補充工作。
11月4日，費正清、陶孟和從重慶溯江而上，去李莊訪問林徽因、梁思成。
1944年40歲
在李莊鎮。
是年，作詩《十一月的小村》、《憂鬱》、《哭三弟恒》。
是年，費慰梅到李莊訪問林徽因。
1945年41歲
在李莊鎮。
8月，日本侵略者宣布無條件投降。
是年，梁思成陪林徽因到重慶檢查身體，大夫告訴思成，徽因將不久於人世。
1946年42歲
2月，林徽因在費慰梅陪同下乘機去昆明拜會西南聯大校長梅貽琦，建議清華大學增設建築係，住唐繼堯後山祖居一座花園別墅，與張奚若、錢端升、金嶽霖等舊友重聚。
7月31日，同西南聯大教工由重慶乘機返回北平。為清華大學設計勝因院教師住宅。
10月，梁思成應聘赴美耶魯大學作訪問教授。
11月24日，發表散文《一片陽光》。
作詩《對殘枝》、《對北門街園子》。
1947年43歲
夏，飽經歐戰浸染的蕭乾，由上海來清華園探望林徽因，二人長談七年來各自的經曆。
作詩《給秋天》、《人生》、《展緩》、《病中雜詩·小詩（一）、小詩（二）、寫給我的大姊、惡劣的心緒》。