1.建立和健全會計機構
會計機構是企業負責組織和從事會計工作的職能部門。在建築施工企業裏，一般都必須單獨設置會計機構，配備必要的專職會計人員。因為會計和財務工作是緊密聯係、難以分割的兩項經濟管理工作，所以在建築施工企業裏，大都設置會計科（組）、財務科（組）或財務會計科（組）。
為了更好地把會計工作組織起來，並促使企業各個職能部門和所屬各施工單位施工經營的各個環節講求經濟效益，加強經濟核算，大中型建築施工企業還應設置總會計師，建立總會計師的經濟責任製。總會計師是企業經濟工作的負責人，領導財務會計工作，編製和執行財務收支預算、信貸計劃，擬訂資金籌措和使用方案，開辟財源，有效地使用資金；進行成本費用預測、計劃、控製、核算、分析和考核，督促企業有關單位降低消耗，節約費用，提高經濟效益；建立、健全經濟核算製度，利用財務會計資料進行經濟活動分析。在沒有設總會計師的小型建築施工企業，可指定一名企業領導人行使總會計師的職責。
在企業會計機構內部，要根據業務的繁簡程度進行合理分工，建立崗位責任製。對於各種會計憑證、財務報表的填製、登記、審核、保管以及報表的編製和分析，都要有明確的分工，使各種核算工作有專人負責。這樣，能更好地發揮每個會計人員的積極性和主動性。
為了充分發揮各級會計機構的作用，要貫徹統一領導、分級管理、分級核算的原則，根據企業的施工規模和管理工作的實際需要，正確處理各級權責關係，建立相應的核算體製。建築施工企業的核算體製，應與企業施工管理體製相適應。在一般情況下，公司為獨立核算單位，它獨立核算企業盈虧，全麵核算企業各項技術經濟指標。公司所屬的工程處（或分公司、工區）、加工廠為內部獨立核算單位。它在公司統籌下核撥施工生產所需的資金，並單獨計算盈虧。工程處所屬的施工隊（或項目經理部）為內部核算單位。這樣，就使企業各級單位的核算，組成完整的核算體係。對企業生產經營活動進行經常的、全麵的核算，既有利於各單位及時掌握本單位的經濟活動情況，又有利於因地製宜地解決存在的問題，不斷改善施工生產經營管理，提高經濟效益。
2.製定合理的會計製度
會計製度是組織和從事會計工作時必須遵循的規範。為了正確地組織建築施工企業的會計工作，必須有一套完整的、科學的會計製度。
製定會計製度，必須遵循統一領導、分級管理的原則。全國性的會計製度，必須由國家統一製定。會計的基本原則、會計核算的指標體係和核算方法等，都必須在全國範圍內統一起來。我國統一的會計製度是由財政部製定頒發的，有些重要的會計製度如《企業會計準則》，要通過國務院批準發布。