與胡拜爾爆炸事件和伊朗相關的什葉派自首和被捕的人數不斷增加，許多被捕的人都是“沙特真主黨”的成員。據說，沙特真主黨的領袖謝赫加法爾·穆巴拉克也因胡拜爾爆炸事件被捕。然而，胡拜爾爆炸事件以後被捕的人並非都與爆炸事件有關聯，這次爆炸事件實際上為沙特當局拘捕什葉派反對派提供了一個大好機會。1996年9月初，沙特阿拉伯的什葉派活動家公開指責沙特當局逮捕了他們的同胞。“希賈茲歐萊瑪組織”抗議沙特政府逮捕來自哈薩的什葉派活動家胡加特·伊斯蘭·哈希姆·穆罕默德·謝克斯，並且列出最近被捕的另外23名什葉派宗教人士的名單。另一個組織“希賈茲保衛人權委員會”也頒布了一份類似的宣告。同時，“阿拉伯半島伊斯蘭改革運動”和一位不知名的沙特官員還說，許多沙特的遜尼派伊斯蘭主義者也因為胡拜爾爆炸事件而被捕。1996年11中旬，“沙特真主黨”發表聲明，威脅說如果沙特當局傷害了被拘留的“遜尼派和什葉派”，他們將發起對美國和沙特的攻擊。“伊斯蘭改革運動”組織在11月末也發布了一份類似的威脅。然而，沙特當局加緊拘捕更多的反對派，以防止王國再次發生恐怖襲擊事件。
1997年1月，根據沙特情報機構首領特爾其·本·費薩爾親王提供給美國的信息，胡拜爾爆炸事件的幕後策劃人是一名沙特什葉派穆斯林阿哈馬德·穆賈斯勒，據說他躲藏在伊朗。1997年3月，加拿大警方逮捕了哈尼·阿卜杜勒·拉希姆·薩伊。他是一名來自沙特阿拉伯東方省城鎮薩哈特的什葉派，安全機構懷疑他參與了胡拜爾爆炸攻擊事件。據加拿大安全機構的調查，哈尼·阿卜杜勒·拉希姆·薩伊是一名“沙特真主黨”成員，是胡拜爾爆炸事件的直接參與者，阿哈馬德·穆賈斯勒是爆炸事件的幕後策劃人。然而，根據“阿拉伯半島伊斯蘭改革運動”的信息，胡拜爾爆炸事件的真正罪犯實際上是7名在阿富汗接受訓練的沙特遜尼派伊斯蘭主義者。1998年5月，沙特內政部長納伊夫親王宣布，胡拜爾炸彈事件是由國內的沙特公民實施而沒有外國的參與。沙特政府還否認這次爆炸是來自沙特阿拉伯中心地區的遜尼派人士實施的可能。然而，胡拜爾爆炸事件中表現出來的激進主義行動方式和宗教政治動機，以及具體實施爆炸行動的組織性和實踐技能，都與2001年9月11日之後的恐怖主義事件，以及與受歐薩瑪·本·拉登影響的沙特遜尼派伊斯蘭主義者有諸多類似的地方。
胡拜爾炸彈事件以後，沙特阿拉伯又出現了許多次反對美國和沙特政權的爆炸行動，但大都以失敗告終。這些行動中有一部分是由歐薩瑪·本·拉登的追隨者策劃的。其中1996年對政府人員的攻擊獲得了成功，至少殺死了8名沙特內政部人員。但這次暴力事件的真相完全被沙特政府掩蓋，沒有任何相關的信息泄露給沙特公眾或者國外媒體。不論這種暴力攻擊事件是否真正與歐薩瑪·本·拉登有關，沙特聖戰派伊斯蘭主義者的確是大多數這種暴力攻擊事件的幕後人物。
1996年11月，至少有3次針對沙特政府和美國的炸彈襲擊事件，其攻擊對象還包括“國王法赫德的私人住宅”。1998年3月，沙特政府逮捕了60名參加過阿富汗戰爭的沙特聖戰派成員，並且在王國中專門設置了關押“阿拉伯阿富汗人”的秘密牢房。