這時，長寶道楊炳堃和總兵英俊奉令來到新寧鎮壓起義軍，打算調鎮筸兵來增援。江忠源極力反對。他的意思是，對付這一點起義軍，不值得興師動眾。他還說，外來的兵將不可靠，如果小有所失，雷再浩的勢力會更加強盛。
楊炳堃逼問江忠源：“你能獨自擔此重任嗎？”
江忠源回答：“能！”
楊炳堃不再言語。江忠源回到住處，上書論述調兵之難，以及對付雷再浩的容易。他把自己的規劃說得十分明白，於是大家再也不提請求援兵之事。
雷再浩打算轉移到全州、興安和城步三縣交界的五排地區，據險固守。起義軍分為兩支隊伍。雷再浩率領所部與全州人蕭立三的瑤族武裝會合，於10月30日攻克瓜嶺，進占五排，在周邊的軍事要地分兵駐紮。
11月3日，雷再浩所部在小池大敗廣西清軍，擊斃千總劉春林和外委陳國熊，以及四十多名兵丁。李世德所部起義軍，則於11月9日在鄧家衝被江忠源所部擊敗，李世德自盡。
雷再浩收拾餘部，放棄五排，向廣西境內轉移，於10月19日抵達火把市，突然與清軍遭遇，鏖戰多時，擊斃清軍守備李廷揚以下八十多人。
但是，雷再浩的部隊仍然無法在廣西立足，隻得再度進兵新寧，於11月29日黎明從黃瓜衝發起兩路猛攻，進駐深衝峒，迫使駐防清軍退守石田。
雷再浩打算在八峒地區長期固守。楊炳堃和總兵英俊又擔心了，認為八峒地勢險惡，要打攻堅戰，恐怕兵員不夠，必須就地征兵。江忠源對他們說：“二位大可不必征兵，隻要依靠鄉勇，直搗匪巢，就能平定事端了。”
江忠源請官府知會廣西清軍會攻，自己督率團丁，四麵圍逼，截斷了起義軍出兵的道路。起義軍得不到食物，人心浮動。江忠源派本縣的書生蔣啟華，去勸誘起義軍將領陳新進和李尚開投降。蔣啟華密授機宜，讓這兩個叛徒力勸雷再浩放棄八峒，趁著武岡清軍兵力空虛，率部北進，攻取武岡。
雷再浩上了江忠源的當，於12月3日率領一千多名部眾，向毛安轉移。江忠源已經率領一千多名兵勇在這裏預設埋伏，對起義軍發起突襲，重創雷再浩所部。
陳新進和李尚開趁機內應，將雷再浩捆綁起來，送到江忠源的軍營。
第二天，江忠源命令部隊搜山，將李輝抓捕。當時起義軍還有一千多人，江忠源要求官府將其中勇猛多謀者處死。楊炳堃不同意，隻殺了幾個人，其餘一律釋放。江忠源歎息道：“亂民知道官府會息事寧人，不會懾於官兵軍威，還會東山再起！”
不出幾年，江忠源的話果然應驗，新寧又發生了李沅發的起義，影響湖南和廣西，激發了廣西的會黨起義。
在江忠源還沒有抓到雷再浩的時候，楊炳堃曾懸賞一萬兩銀子購買雷再浩的人頭。江忠源得到這筆賞金，用於修葺新寧城。
1848年1月，湖南官府將雷再浩和李輝在長沙處死。
從此以後，江忠源在湖南博得了通曉軍事的聲名。湖廣總督裕泰將他的戰功上報清廷，清廷賞給他一頂藍翎頂戴，任命他為知縣。
1849年，清廷將江忠源揀發浙江。
短短三年，江忠源在建功立業的道路上，邁出了重要的一步。
不過，這和他日後升遷的速度比起來，簡直就算不了什麼。從1851年開始，江忠源隻用了兩年多時間，就由一個七品小官，靠著戰功，跨越了許多人一輩子也爬不上去的十個台階，成為清廷的二品大員，令滿朝文武瞠目結舌，也令湖南的讀書人個個心癢，爭相效仿。在這種意義上，江忠源是一個具有曆史意義的榜樣。
但是，在1847年，江忠源剛剛步入官場的時候，並沒有幻想以後的飛黃騰達，隻是一心想著如何做好一個知縣。