正值此時，廣西督軍署參謀馬曉軍為在廣西軍隊中推行新式訓練，提高部隊戰鬥力，組建模範營，招納新式軍事人材。馬曉軍是廣西唯一的日本士官學校畢業生，清末加入同盟會，在廣西新式軍人中頗有聲望。白崇禧得知這一消息，自請調往模範營。
１９１７年，白祟禧升任第一連上尉連長，成了模範營的台柱之一。１９１９年初，模範營奉調開赴桂西南剿匪，這對白祟禧來說是項艱巨而生疏的任務。
社會的黑暗，官府的腐敗，年輕正直的白崇禧反而遭到各種勢力的打擊。他的部下一些人，見他辦事認真，無油水可撈，十分不滿，策劃了一場兵變。當時白手下有一個步兵排，是馬曉軍由家鄉招募而來，其中有些人還做過土匪。一天，他們乘白崇禧去百色開會，就與祿豐附近的匪徒相勾結，脅迫在連部受訓的一排新兵攜槍叛逃。當連部勤務兵冒險逃至百色向白崇禧報告時，已是傍晚時分。白聞訊大驚，深感事關重大，向團長報告後，當夜趕回駐地，調集分散在附近查巡的兩個排，連夜追擊逃兵。經晝夜追趕，第二天部隊來到八角山，但卻不見叛兵蹤影。白崇禧見士兵多有倦意，便令休息，自己則向附近老鄉打聽，得知確有一隊馬路過。於是他用望遠境向四周群山搜索，突然在遠處半山腰發現自己的那匹黃馬。白崇禧料定叛兵均藏在山穀中，為了一網打盡，他令士兵散開隊形，三麵包抄，並囑咐等接近叛兵，先高喊“白連長來了”，然後再放槍。士兵們遵命行事，結果除少數匪徒倉皇逃跑外，大多數新兵歸順了白崇禧。
這次兵變雖被白崇禧挽回，未釀成大禍，但事後白崇禧引咎請求處分。上司中，有人勸他今後禁煙以從寬為上策，免激兵變，白崇禧則表示不能因噎廢食，否則國家、社會永無安寧之日。好在馬團長在上報兵變時，為白講了很多好話，誇他禁煙有功，治軍嚴明，而叛兵是與他所招募的人員不良有關。這樣，此次兵變不僅沒有使白遭受處分，反而受到嘉獎。
忠於職守，處事妥捷，是白崇禧給模範營同事們留下的最突出印象，他因此受到同僚們的敬重。
１９２１年秋冬，廣西政局發生了引人注目的變化。孫中山為清除北伐的後顧之憂，檄調粵、黔、滇軍討桂，於１１月將大本營移駐桂林。廣西地方實力派陸榮廷、譚浩明被逐，馬君就任廣西省長，模範團改為田南警備司令部，從此脫離與陸、譚的部屬關係，成為新政權的一支主要武裝力量。同時，白崇禧也被提升為模範團營長。但由於趙恒惕的阻撓，拒絕北伐軍由桂入湘，孫中山將大本營移往韶關，粵軍隨即班師，陸榮廷、譚浩明卷土重來，在廣西境內成立自治軍，矛頭指向新政權，田南警備司令部也時常遭到自治軍的襲去。
一天拂曉，自治軍偷襲田南警備司令部得逞，逮捕了馬曉軍。司令部一片混亂。那天，白崇禧也因公事在司令部駐地，他看到對方人多勢眾，敗局難以挽回，於是乘混亂之機隻身附城牆逃入黔境，投奔昔日保定軍校的同學劉莘圓處暫避。
白、夏率兩營士兵退避貴州後，受到老同學妥善安頓，並補足糧餉。稍作休整後，白崇禧便籌謀由坡腳渡過紅河，殲滅西降自治軍。這將是他第一次獨立指揮作戰。為了摸清敵軍火力部署，在一個雨夜，他帶兩個衛兵到坡腳北邊的山坡上觀察對岸敵人的機槍陣地。因天黑路陡，白崇禧不慎跌下山坡，左腳受傷。因腳傷嚴重，難以挪步，無法指揮，隻好讓夏威一個人負責，按計劃行動。
白崇禧躺在床上，焦急地等待著戰報。但隊伍在向西降推進時，受到敵軍頑強抵抗，久攻不下，最後敗下陣來。白崇禧清楚，能否戰勝敵人，是關係到自己前途的問題，因此當晚召集部隊訓話，強調指出，此戰勝負是關係到我部存亡的關鍵，隻有返桂才可望反敗為勝，希望大家務必齊心協力。第二天，白崇禧令部隊重新發動攻擊。為了鼓舞士兵的鬥誌，他躺在擔架上，讓人抬到前沿督戰；為了激勵士兵的勇氣，他在前沿陣線上告訴大家，若此次攻擊失敗，他決心與諸位同死不退。於是部隊發起衝鋒後，一鼓作氣突破敵軍防線，乘勝追至百色，救出馬曉軍，在廣西重新獲得一塊立足之地。
西隆戰役，白崇禧表現了自己的軍事才能，尤其馬曉軍得救，更覺白崇禧是不可多得的人才，於是提升他為統領。與白同時晉升一級的還有黃紹竑。
從１９２３年到１９２５年的短短兩年中，白崇禧與李宗仁一起，擊敗陸榮廷，征服沈鴻英，驅逐入桂滇軍，在廣西南征北戰，用血與火結束了廣西分割混亂的局麵，使廣西得到了統一。