最後，隻剩下了朱由檢一個皇帝被困在了陰冷的紫禁城之中。這裏抄錄了一段朱由檢生命倒數二十四小時的備忘錄，由此，我們也可以看出這位“此才無力可補天”的亡國之君在最後時刻的悲苦與無奈了。
崇禎十七年（1644年）三月十七日早朝，朱由檢怒書禦案：“文武個個可殺！”
明莊烈帝朱由檢皇後周氏回到後宮後，朱由檢感覺到事態嚴重，即召太子朱慈烺、永王朱慈照、定王朱慈炯三個兒子入宮，戀戀不舍地告誡他們：“你等今日為太子皇子，明日皇城一破，即為普通小民了。今後，一定要好自為之。”話說到一半，即泣不成聲地說不下去，乃不勝傷感地讓人領了三個皇子從速逃生。
至十八日深夜，外麵傳言內城已經失陷了。這時，昔日人影綽綽的乾清宮已經寂寥無人。朱由檢跟周皇後對影成雙人。朱由檢淒婉酸咽地跟周皇後講：“廷臣惟爭義氣，全忘忠義。十七年辛苦，仍為若輩所誤。朕惟一死報祖宗，但苦百姓耳。”
周皇後大約對於朱由檢這類陳年舊詞聽過一百遍了，此刻，大限來臨，夫妻分飛，周皇後便大哭著埋怨了朱由檢數語：“毛文龍不誅，袁崇煥不殺，盧象升、洪承疇不必勤王，賊猶可滅。天運人事，一至於此。”
其時，朱由檢已抱定必死之心，人之將死，出語謙遜。於是，便弱弱地反問了一句：“除卻數人，竟無人可圖大事耶？”
周皇後歎了一口氣，幽幽地回答：“早年求治太急，朝廷皆不安於位。後來已補救不及。妾事陛下十八年，卒不聽一語，今日同死社稷，亦複何恨？”
說畢，周皇後竟走入坤寧宮懸梁自盡了。
接下來，朱由檢便把十五歲的大女兒長公主叫進了宮。長公主自幼成長於膏粱錦繡的環境，驟然遭遇這樣慘痛的巨變，便隻知哀慟地啜泣著。朱由檢心若槁木死灰，無奈地歎息：“汝奈何生我家！”說罷，即以左衣袖掩麵，右手揮刀向自己的女兒刺去。長公主下意識地用手去擋刺向自己的利刃，左臂應聲斷落於地，長公主竟疼痛得暈倒在地上。朱由檢悲慟之下，一刀未能致命，卻已手軟得不能再刺。
於是，談遷在《國榷》中記載：“上又巡西宮，命所寵袁貴妃自經。繩斷，墮地複蘇；上拔劍刃其肩，三砍而上亦手軟。因遍召所禦妃嬪數人，俱親殺之。複遣宮人逼張太後（天啟帝朱由校的皇後）速死。”
崇禎自縊的老槐樹三月十九日五鼓，朱由檢、王承恩這一對患難君臣手牽著手，來到了宮殿後麵萬壽山的壽皇亭旁邊。當時，這個亭子新建不久。朱由檢在這個地方徘徊沉吟了許久。後來，便頷首向王承恩說：就這個地方吧，我已經累了。於是，王承恩在海棠樹上係了兩根結實的白綾。王承恩先扶著皇帝把頸項投進了繯環。然後，王承恩大哭著麵對朱由檢跪拜了三次，隨即吊死於朱由檢的對麵。
據說，朱由檢氣絕之時，一道白光騰地從東北角升起，在黎明的天空中，寂靜地徘徊了很久。有人說，那是朱由檢的帝王之靈魂回到了天堂。
這樣，不管人們譽也罷，毀也罷，皇帝朱由檢最後總算遵守了自己與社稷江山共存亡的諾言。
崇禎十七年（1644年）夏，南明弘光帝立。弘光帝給朱由檢追贈的廟號為“思宗”，這有一種淡淡的憂傷的味道，令人想起那句千古令人潸然淚下的詩句：“可堪孤館閉春寒，杜鵑聲裏殘陽暮。”後來，清廷贈與朱由檢的諡號為“莊烈帝”，一個“莊”字，一個“烈”字，形象地勾勒出了他的肅穆肅殺的嚴整性格，這於朱由檢的一生論定，大致也是中肯的。