雖然劉太後掌權日久，不願把權柄交給宋仁宗，但她卻依然是個慈母。宋仁宗少時體弱多病，劉太後忙於政務，讓楊淑妃照顧，宋仁宗稱劉太後為“大娘娘”，楊妃為“小娘娘。”
而宋仁宗生母李氏，劉太後也升封她為順容，遷往宋真宗永定陵，成為守陵的先帝諸妃之一。而且早在真宗年間，便尋訪到李氏家人封官。宋真宗去世後，她依然沿用李氏，未下殺手。
明道元年(1032年)二月，李氏患了重病，劉太後連忙派太醫前去診治，並晉封她為宸妃。然而李氏薄命，封妃當天便病薨，享年46歲。起初，劉太後隻想以普通宮嬪的身份殮葬了事，然而聽了宰相呂夷簡的勸說，以保全劉氏家族計，劉太後以一品禮儀將李妃殯殮，在皇儀殿治喪，並給李妃穿上皇後冠服。李妃的父親得到追封，兄弟李用和也再次晉升。
劉太後雖不願還政於宋仁宗，卻並未想過自立。程琳獻圖《武後臨朝圖》，劉太後親擲於地，道:“吾不作此負祖宗事!”
劉太後表態後，群臣如釋重負，宋仁宗也心懷感激，恭孝唯謹，更於天聖七年(1029年)九月頒布詔書，將太後生辰長寧節的儀禮升級到與皇帝生辰乾元節相同的程度。
明道二年(1033年)二月，舉朝要行祭太廟大典，劉太後自覺天命已不久，想要在生前穿一次天子袞冕，便提出自己要著袞冕祭祀太廟。群臣大嘩，卻隻得將皇帝袞衣上的飾物稍減了幾樣，呈了上去。二月乙巳這天，劉太後穿著天子袞衣、頭戴儀天冠，在近侍引導下步入太廟行祭典初獻之禮。為了將這場典禮搞得功德圓滿，亞獻者為皇太妃楊氏、終獻者為宋仁宗皇後郭氏。儀式結束後，劉太後在太廟文德殿接受了群臣給自己上的尊號:應天齊聖顯功崇德慈仁保壽皇太後。自此，徹底還政於兒子宋仁宗。
三月，劉太後病重，宋仁宗大赦天下，四處征召名醫，然而卻無法挽留她的生命，幾天後，劉太後病逝於寶慈殿，享年65歲。
第二日，宋仁宗在皇儀殿召群臣，哭道:“太後臨終前數度拉扯身上衣服，可有什麼心願未了?”參知政事薛奎曰:“太後不願先帝見她身穿天子服入葬。”宋仁宗恍然大悟，下令給劉太後換上皇後冠服。
宋仁宗正自傷感，群臣卻紛紛上議，說劉太後並非他生母，生母是李宸妃，而燕王更說李宸妃是宋太後毒死的。宋仁宗震驚，派人召來李用和，讓他親自去查看李宸妃的棺木。見李宸妃葬品如一品夫人，甚至身穿皇後服，宋仁宗大悔，歎道:“人言豈可盡信。”來到劉太後牌位前拜謝自責:“從此後大娘娘的生平可清白分明了。”而上諡號之時，劉太後諡為四字:莊獻明肅皇後(後改章獻明肅皇後)，而宋朝舊製皇後皆兩字諡，四字諡自劉太後始。宋仁宗生母李宸妃諡為莊懿皇後(後改章懿皇後)。