也有學者通過查閱清代史料後指出，李蓮英其實並沒有參與朝中的黨派之爭，他充其量隻不過是一個執行者而已，因此談不上得罪革命黨人。更何況李蓮英死時已經出宮三年有餘。試想一下，一個年邁的老太監能夠對革命產生什麼影響呢？殺掉他對於當時的革命形勢又有何益處呢？
上世紀90年代，北京文史研究館研究員顏儀民先生在一篇文章中指出，李蓮英是被江朝宗和小德張二人合謀所殺。文章內容大致如下：
李蓮英被準許出宮後，一直住在護國寺棉花胡同附近的一所宅院中，過著與世無爭的生活。一天，李蓮英接到了一張請帖，發帖之人是當時的九門提督江朝宗。江朝宗在請帖中說，要請李蓮英在什刹海附近地會賢堂吃飯。正所謂無事不登三寶殿，李蓮英似乎感到事情不妙，最終還是決定赴宴。整個宴會並沒有什麼意外，李蓮英感到很奇怪。宴會結束後，在回家的路上卻被人暗殺致死。第二天，李蓮英的家人尋遍北京城，最後在後海附近找到李蓮英的頭顱，身軀不知所蹤。按顏先生的意思，即使不是江朝宗二人殺害了李蓮英，此二人也與李蓮英的死亡有極大關係。
對此，曆史學家唐益年以史料為據，提出質疑。據史料記載，江朝宗於宣統二年（公元1910年）任陝西漢中鎮總兵，並且一直到民國二年（公元1912年）才從陝西調回北京，擔任北洋政府的北京衛戍司令。也就是說，江朝宗根本沒有當過什麼九門提督。而且李蓮英死於宣統三年，當時的江朝宗遠在數千裏之外當總兵，因此江朝宗謀殺李蓮英一說根本不成立。此外，唐先生還指出，小德張比李蓮英小很多，他的得勢也是在李蓮英出宮之後，他與李蓮英之間根本沒有利害衝突，也就沒有殺害李蓮英的動機。
也有人說，李蓮英是被隆裕太後下旨處死的，死後巨額財產悉數充公。實事求是地說，李蓮英在宮中數十年不倒，確實收斂了大量財富。雖然關於李蓮英的財富有多少，史料中並無確切記載，但據野史說他曾經多次接受袁世凱等權臣的賄賂。還有人說李蓮英僅僅存放在京城各銀號中的白銀就上千萬兩，此外還收斂了大最地產和金玉珠寶。隆裕垂簾聽政後，覬覦李蓮英的驚人財富，找個借口將李蓮英殺死，並假惺惺地賜墳地、賜葬銀以掩人耳目。
專家指出，即使隆裕真的想除掉李蓮英，完全可以給他安個罪名後再將其處死，而掩人耳目無疑是牽強附會之說。再者，如果李蓮英是隆裕所殺，她又怎麼舍得讓那麼多珠寶玉器一起隨李蓮英埋葬於地下呢？
此外，有學者指出，李蓮英確實是死於疾病。人們之所以在其棺槨中隻見到頭骨，是因為他始終以自己是“半殘之身”為恥，認為死後無麵目見祖宗於九泉之下，臨死前吩咐兒孫們死後隻留頭顱，至於軀幹則索性舍棄。應該說，這一說法還是有一定道理的，由於缺乏更有力的記載，這一說法令很多學者難以苟同。
那麼，李蓮英的真正死因是什麼呢？本書認為，雖然最後一種說法稍顯勉強，但是縱觀李蓮英的一生，他極有可能會因為無顏見列祖列宗而將軀幹舍棄。由於缺乏有力的依據，這一說法還隻能停留在推測的基礎上，也許隻是筆者的一廂情願而已。