從長遠的角度來看，近衛軍目前所麵對最大的難題，還是如何應付那些各自為政的各省軍閥。畢竟可以打過漢口一戰，也可以勉勉強強對付護****，但戰爭必然存在消耗，在這一連串的消耗之後，是否真的還有餘力來對付各省軍閥，當真是一個未知數。
所以在結束了孝感戰役之後，蔣百裏當然清楚的認識到必須在最短的時間裏，做好休整和擴充準備，同時利用目前還沒有完全結束戰爭的借口，盡可能向中央政府索取更多的物資。不管是用在修整軍隊，還是用來儲備，等到迎接接下來的戰事，都是有必要。
在孝感的全軍整頓上麵，除了按照袁肅的思路，把第一師、第三師全部分拆填補到第五師和第一兵團上麵之外，同時還將俘虜的兩萬多名曹錕的叛軍做了整編。為了防止這些叛軍中會有不穩定的情況，他最先做出的就是剔除軍官，將所有軍官全部抽調出來，或分配到其他部隊，或就地解散，又或者是做為警告似的宣判罪行。
哪怕在基層當中有很多軍風成問題的士兵，但是也要比有號召力和指揮權的軍官要容易管教。更何況在今後的編排之中，對於那些作風問題嚴重的士兵，照樣還是可以開除或者另作其他調用。
對於這眾多俘虜的編製，蔣百裏先按照中央師的編製組成了一個師的番號，同時又從第五師、第一師和第一兵團方麵抽調了部分軍官接管這個師。如此一來，對於之前那些第一師、第五師的軍官們來說，他們雖然大部分在這次編製中升職，可到底還是脫離了原來的圈子，麵對的是一群不熟悉的士兵和部下，極大的削弱了彼此的影響和不穩定。同時，抽調走的這些軍官缺位自然還是由灤州集團安排人來替補，最終大大的鞏固了蔣百裏控製第五師。
新建立這支師的番號申報到袁肅那裏，經過幾天的研究之後暫時批下為衛戍兵團。
袁肅希望在這個師的基礎上，把另外剩下沒有編製的俘虜都變成一個兵團，但是暫時不設置兵團司令部，仍然近衛軍總司令部來直接管理這個兵團。而那個師則被成為衛戍兵團第一師，外加幾個零散的團、營番號，剛好把這些俘虜全部安排好了。
衛戍兵團的主要任務，除了做為正常作戰之外，同時還肩負起地方衛戍任務。
袁肅旨在把這些雜牌部隊全部降低一個層次，在思想、訓練、後勤供應以及軍事地位上，全部要比中央軍差上幾個檔次。到戰後就徹底淪為預備役。讓這些雜牌部隊在進訓練營裏麵好好訓練一番，把一些過往不好的習慣全部清除。
整個孝感的整頓和編排俘虜並不是三天、五天就能完成的工作。經過孝感一戰製造了太多傷亡人數，陣亡的士兵需要撫恤，受傷的士兵需要照料。袁肅從一開始就標榜近代軍隊的所有係統，所以當然不會在像以前那樣舊式軍隊的做派，對於受傷和陣亡的士兵能敷衍就敷衍，甚至還有將撫恤和救助的資金直接貪汙克扣情況。
由於陣亡和傷亡數量過於龐大，單單是統計名字就要花去許多人力和時間。
從戰爭還在繼續時，傷亡的人員大多是由交通線轉移到河南，甚至還有一些人被迫轉移回到直隸利用西醫設施來救治。到戰爭結束時，更多的傷員都留在孝感本地，這其中不止有近衛軍的傷員，還有不少曹錕俘虜當中的傷員。袁肅和蔣百裏曾經通過電話來討論過這個問題，雖然在大局觀上理應一視同仁，可這會兒在孝感打得十分太激烈，很多人都殺紅了眼，若真要一視同仁肯定會讓近衛軍的士兵很不痛快。
最終總司令部還是下達了一份命令，近衛軍傷員和俘虜傷員分開救治，並且在醫療資源上采取近衛軍傷亡優先的原則。
蔣百裏所預想的傷亡狀況最多是成營成營的程度，可真正統計起來，再加上那些俘虜當中的傷亡，實際上已經到了成團成團的情況。縱然中央軍大部分都有戰役醫院和軍醫的編製，但真正做到完善和達到標準的，也隻有第一兵團和第十師。麵對如此龐大的傷員，許多軍醫幾乎要一人肩負數職。很多軍醫連續堅守崗位奮戰三天三夜，到最後甚至連自己都累倒了。