張格爾餘黨博巴克複入新疆喀什噶爾，清廷命長齡、楊遇春、楊芳等往剿。魏源因與楊芳有授館關係，前往甘肅參佐戎幕。不久，亂事平定，魏源未能親至新疆。
蔣攸銛病，江蘇巡撫陶澍升任兩江總督。
道光十一年（1831辛卯）三十八歲春，父邦魯病重，魏源回江蘇省親。七月，魏邦魯病逝於寶山主簿任所。
在寶山認識“強恕老人”章謙存，後二年為作《章教諭強恕齋書序》。守製蘇州期間，開始整理、增訂《詩古微》。
道光十二年（1832壬辰）三十九歲在北京應禮部試，未中。與應試友人集會於三官廟花之寺，到會者有龔自珍、包世臣、端木國瑚、宋翔鳳等十四五人。
仲夏回江南，佐兩江總督陶澍改革淮北鹽法，試行票鹽，成效顯著，官商民均得其利。撰《吳農備荒議》上下兩篇。
七月，林則徐接任江蘇巡撫，與陶澍共事“誌同道合，相得無間”，常延請魏源商議興利除弊事宜。
道光十三年（1833癸巳）四十歲江南水患，作《湖廣水利論》雲：“欲興水利，先除水弊。除弊如何？曰：除其奪水奪利之人而已。”又作《東南七郡水利略敘》。
道光十四年（1834甲午）四十一歲與謝元淮、曹懋堅、吳嘉淦同遊江蘇雲台山。陶澍重修雲台山海曙樓，魏源代作《海曙樓銘》。
穆彰阿任吏部尚書、協辦大學士。
道光十五年（1835乙未）四十二歲至北京應禮部試，仍未中，作《下第過舊阿縣題壁》詩，絕意科場。回江蘇，在揚州買園一處，名之為“絜園”。往江陰拜會李兆洛。
江蘇元和縣知縣黃冕在蘇州修建寶帶橋、乙未亭等，魏源代作碑文，以紀其事。
道光帝賜陶澍禦書“印心石屋”四字，陶澍命魏源收錄朝中官員與江南士紳所贈詩文，編成《禦書印心石屋詩文薈》，作序及頌六章。
道光十六年（1836丙申）四十三歲在揚州，作《揚州絜園閑詠》等詩，與兩淮鹽運使司海州分司運判謝元淮、海州書院山長許喬林聚會。
穆彰阿任武英殿大學士。
道光十七年（1837丁酉）四十四歲在揚州，與張際亮會晤。研究明史，編纂《明代食兵二政錄》，收錄明代食兵二政資料，作為借鑒，以期對清代製度有所興革。
英國再次爆發資本主義經濟危機。本年鴉片輸入驟增至三萬箱。林則徐升任湖廣總督，陳鑾接任江蘇巡撫。姚瑩任福建台灣道。
道光十八年（1838戊戌）四十五歲在揚州，代海州分司運判童濂編纂《淮北票鹽誌略》並代作序文，撰《淮南鹽法輕本敵私議》一卷並自序，二序提出對鹽法改革的意見。
次子昌耆生。
鴻臚寺卿黃爵滋奏請嚴禁鴉片。道光帝命林則徐為欽差大臣，馳往廣東查辦海口事件，節製該省水師。周天爵任湖廣總督。王鼎任東閣大學士，仍管刑部。
道光十九年（1839己亥）四十六歲回鄉掃墓，與族中父老子弟商議重修族譜事。應親友之請，撰書多處楹聯。族譜修成後，作《邵陽金灘魏氏二修譜序》。
陶澍卒，作《太子太保兩江總督陶文毅公神道碑銘》及《陶公行狀》。
龔自珍自北京南歸，在揚州與魏源會晤。
林則徐繼陶澍任兩江總督，調任兩廣總督後，陳鑾繼任。陳鑾病卒，伊裏布繼任。裕謙任江蘇巡撫。鄧廷楨任閩浙總督。
林則徐至廣東查禁鴉片並在虎門海灘監督銷毀。英國兵船開炮挑釁，英內閣會議決定發動侵華戰爭。
道光二十年（1840庚子）四十七歲奉命修浚江蘇徒陽河。為友人邀至浙江寧波。在欽差大臣伊裏布軍營審訊英俘安突德，據供詞及其他資料寫成《英吉利小記》，後收入《海國圖誌》中。
命兩江總督伊裏布為欽差大臣，赴浙江剿辦，裕謙繼任。
英軍北上進犯閩、浙沿海，犯廈門被守軍擊退，改入浙江，陷定海縣。北上至天津大沽口外，遞信與琦善訴“屈”。道光帝命琦善為欽差大臣，赴廣東查辦，下旨將林則徐、鄧廷楨交部議處。
道光二十一年（1841辛醜）四十八歲在浙江，兩江總督、欽差大臣裕謙延入幕府。在守定海戰役中，建議未被采納，定海失守。鎮海亦為英軍攻陷，裕謙自盡，黃冕遣戍伊犁。回揚州，作《自定海歸揚州舟中》詩。赴鎮江，與遣戍伊犁的林則徐會晤，作《江口晤林少穆製府》詩。林則徐贈《四洲誌》譯稿，囑撰《海國圖誌》。作《寰海》詩，斥責清政府及投降派腐敗無能，讚美廣州三元裏人民抗擊英國侵略軍。作《湖北崇陽縣知縣師君墓誌銘》，認為鍾人傑起事與錢漕弊政有關，法窮則變，急宜改革舊製。
裕謙往浙江，伊裏布革職，牛鑒任兩江總督。林則徐以四品卿銜赴浙江鎮海軍營，又至東河效力，終仍遣戍伊犁。琦善以英軍攻陷廣東虎門，下部嚴議；又因擅許割讓香港，革職拿問。命奕經為揚威將軍，督辦浙江海防。
龔自珍、李兆洛、裕謙卒。
道光二十二年（1842壬寅）四十九歲在揚州，著《聖武記》十四卷。序中雲：“今夫財用不足，國非貧，人材不競之謂貧；令不行於海外，國非羸，令不行於境內之謂羸。故先王不患財用而惟亟人材，不憂不逞誌於四夷，而憂不逞誌於四境。官無不材，則國楨富；境無廢令，則國柄強。楨富柄強，則以之詰奸，奸不處；以之治財，財不蠹；以之蒐器，器不窳；以之練士，士無虛伍。如是，何患於四夷，何憂乎禦侮！斯之謂折衝於尊俎。”
作《海國圖誌》五十卷。序中雲：“是書何以作？曰為以夷攻夷而作，為以夷款夷而作，為師夷長技以製夷而作。”
為龔橙編定其父龔自珍文集，作《定庵文錄敘》。作《秋興》詩，詩中有悼念大學士王鼎因諫保林則徐而自縊事，又寫守定海等鴉片戰爭事。
英軍自長江吳淞口、鎮江，直至江寧，迫清政府與英國簽訂《江寧條約》（《南京條約》）。林則徐抵達伊犁戍所。兩江總督牛鑒革職，耆英繼任。
道光二十三年（1843癸卯）五十歲以家道中落，又至北京準備應試，途中作《金焦行》等詩，感歎戰事甫過，高官豪富又複衣香鬢影，紙醉金迷。
長孫璽生，四歲殤。
洪秀全初創拜上帝會，在廣東花縣傳教。
道光二十四年（1844甲辰）五十一歲在北京應禮部試，《四書》時文獲房考官“勁掃千軍，倒傾三峽”批語，中式第十九名。然因試卷草稿字跡模糊，罰停殿試一年，憤而作《都中吟》詩十三首。
應曹懋堅邀，與姚燮、湯鵬宴聚，姚燮作長歌為贈；又與湯鵬為姚燮餞行。與友人何紹基、湯鵬等在北京慈仁寺顧炎武祠公祭，參加者還有張穆、苗夔、徐鬆、王茂蔭、馮桂芬等。友人林昌彝在京患病，資助藥費。南歸趕至漢陽送別姚瑩入川奉派乍雅，贈《海國圖誌》，姚瑩一路研讀，在其《康紀行》中多次記敘“大獲我心”之感。
《聖武記》始入日本一部，此後逐年增多。
次孫桂生。
耆英調任兩廣總督，壁昌繼任兩江總督。
道光二十五年（1845乙巳）五十二歲為補行殿試北上，再次從固安渡永定河，考察畿輔水利，作《畿輔河渠議》。補行殿試，賜同進士出身，以知州用，分發江蘇。在京為陳岱霖《雲石詩存》作《題辭》詩，詩中以關心國事與人民疾苦相勉。贈朱琦《海國圖誌》，朱琦作詩致謝，詩中雲京中市賈紛紛刻印此書，諸要人爭相購讀。南歸經曲阜訪孔憲彝，為其夫人所臨《曹全碑》題辭。回到江蘇往蘇州會晤從新疆歸來的黃冕，作《吳門重晤黃南坡太守》詩五首。