翁立達先生非常遺憾地說，他們的研究表明：隨著長江幹流葛洲壩和三峽水電站以及沿江堤、閘工程的建設，生活在長江的河海間洄遊的魚類如鱘魚、鰣魚等珍稀魚類已大為減少。國家一級保護動物中華鱘原產卵地在上遊合江至屏山，長約八百公裏，原有十六處產卵場，葛洲壩電站建成後，雖然在葛洲壩下遊形成了人工產卵場，但符合中華鱘產卵的三個條件，即九至十三米水深、穩流與產卵場麵積大大縮小，僅為原有的百分之一至二。國家一級保護動物白鱘產卵場原分布於金沙江下遊和重慶以上的長江幹流，產卵季節為三月至五月，習慣在河灘礫石間產卵。國家二級保護動物胭脂魚產卵場在長江上遊岷江和嘉陵江等支流，卵具微粘性、散布在石塊縫隙中發育，幼魚可隨江漂流到中下遊及通江湖泊。若在這些河段建設水庫，河灘將被淹沒，原有的產卵場被破壞，將直接影響這些珍稀魚類棲息地和洄遊通道。長江裏的四大家魚——草魚、青魚、鱅魚、白鰱都具有半洄遊性。現在已有八個四大家魚的產卵場被淹掉了。二○○七年夏天我曾經采訪過長江委的專家，那時得到的數字是，四大家魚的魚苗銳減百分之八十。三年之後，二○○七年第四期《中國國家地理》上的數字，四大家魚銳減的數字上升到百分之九十七。
我們的船走在三峽裏時，翁先生告訴我：四大家魚的產卵很大程度上取決於水溫和漲水等環境因素，在四月底至五月初的繁殖期，如果水溫不到十八攝氏度，即使漲水也不產卵，如達到合適的水溫，遇河流水位陡漲，可刺激家魚產卵，產卵規模與漲水幅度正相關，魚卵在隨水漂流過程中發育、孵化，漂流距離可達三百至四百公裏，但流速需大於0.2m/s以上，否則魚卵和魚苗會下沉而不能正常發育，像這樣產漂流性魚卵的魚類，在長江幹流有二十多種。河道轉變成水庫後，因河灘淹沒，產卵場減少，流速減緩，魚卵將難以漂流孵化。
翁立達先生曾是水利部長江委員會的高官，在長江上工作了四十二年。《長江的保護與發展報告2007》第九章“長江上遊地區水電開發”是由他撰寫的。麵對記者他坦陳：三峽工程有利也有弊。興建水庫後，通過人工調控，減少了洪水災害，提高了水利用的保證率。但同時減弱了河道的自然洪枯過程，而水生生物的生境需要有一定幅度的變化。生物多樣性常與生境的複雜性有直接的關係。河道周而複始的洪、枯現象是河流和河道形成的必要條件，洪、枯演替引起了河流水位、水溫、水量、含沙量和消落帶等的變化，這也是維持河流自然生境的需要，是維係河流生物多樣性的基礎。
翁先生說：水電站建設對生態環境的影響主要由大壩與水庫的形成而引起。工程的興建和水庫的形成將部分改變河流的水文情勢，從而使河流的生態與環境係統的結構發生變化，對流域的生態與環境產生深遠的影響，其中有些影響是短期、可逆的，有的則是長期、潛在和不可逆的。而目前三峽水庫的消落帶是指：待三峽工程完工後，為保證發電需要，三峽庫區冬季正常蓄水位為一百七十五米，而夏季為防洪，水位降到一百四十五米，這其間三十米水位落差暴露出的土地就是消落帶。消落帶是江岸帶中生態最為脆弱的地帶。水浸泡後的兩岸，常常引起滑坡和崩岸。國土資源部專家、三峽庫區地災防治工作指揮部指揮長黃學斌在二○○七年九月在長沙召開的“長江論壇”上說：時常發生的地質災害嚴重威脅庫區民眾生命安全，滑坡入江後會造成湧浪災害，浪高最高可達數十米，波及數十公裏範圍。清水下泄對長江中下遊最險的荊江河段堤防的威脅也引起湖北省高度重視。湖北省副省長李春明說：近年來，荊江崩岸險情頻次明顯增多，崩岸長度明顯增加。“據研究分析，今後長江河床將發生長距離的沿程衝刷和橫向擴展，對河勢控製和護岸工程帶來較大影響，並引發新的崩岸。”
我們的“長江”號遊輪在三峽的三天裏，每天上午船都是在大霧中穿行，能見度很低。隻有過了中午天才慢慢放晴。我問翁先生，前幾年我聽一位政協委員說他們到三峽考察，當地人告訴他們三峽水位升高後，現在江上每天上午的大霧都難以散去，三峽修壩其中一個功能是航運，上午的大霧對航運有影響。翁先生說，在做工程環評時，這個問題是考慮到的。但現在江上大霧的時間之長和地域範圍之廣，確實和預先想到的有所不同。這對航運是有影響，但是現在江上有很多滾裝船，就是車可以開到船上的那種船，運輸能力很強。翁先生告訴我一個數字，說明的是現在三峽的航運貨運量不但已經完成了當年設想的運營額，在三峽建設還沒有全部完成的情況下，已經接近設計的標準。
對於我很關心的氣候問題，翁先生首先對去年重慶大旱，今年重慶大水，一些官員，甚至是科學工作者出來說與三峽無關表示有不同意見。他說，才一年、兩年、三年的運轉怎麼就能下結論？去冬今春，長江支流岷江都江堰灌區出現了冬幹春旱。總降水量普遍較常年同期偏少四至七成，都江堰渠首引水流量創十年來新低。二○○六年十一月六日有報道稱：水位下降，洲灘裸露，鄱陽湖出現了建國以來曆史同期最低水位。據二○○六年東洞庭湖漁政部門提供數據，由於大片水域幹涸，已有二千一百戶七千六百名漁民座船擱淺受困，三分之二的漁民已無業可作。二○○七年一月三日，長江湖北沙市段水位是-0.77米，低於有水文記錄以來的曆史同期平均值，創下一百四十多年來的最低紀錄。這些不能不說和全球氣候變化有關，但這些江段也正是近年來我們大做“文章”的地方。就在我上船之前，還看到《長沙晚報》二○○七年十月二十二日報道：二十一日上午八時，湘江長沙段水位降至二十五點八九米，比十月十日下降一點一三米，接近曆史最枯水位。