馬雲在經曆兩次創業挫折後，馬上又全身心地投入了第三次創業。1997年年底，他受國家外經貿部的邀請，北上給外經貿部做網站，讓外經貿部成為中國第一個上網的部級單位。馬雲在北京租了一個不到20平方米的小房間，沒日沒夜地幹活。“中國第一個網站交易市場是我們做的，第一個進出口交易所是我們做的。政府和我們這些人合作得很愉快。”馬雲曾經這麼說。但是後來，由於在業務的方向是幫助中小企業還是大企業上出現分歧，使馬雲無比苦惱，這次合作最終也以失敗告終。1999年年初，馬雲回到了杭州。盡管公司賺了287萬元的利潤，但是馬雲除了工資之外沒有拿到任何紅利。關於這場風波的緣起，有各種版本，但根據馬雲自己的說法，是因為他沒有分清朋友和上下級的關係。他反省了自身，認為在今後的創業中，應該清楚地區分好朋友與上下級關係。
經曆了那麼多的磨難與挫折後，1999年3月，馬雲回到杭州創辦阿裏巴巴網站。這一次，他終於成功了！
對於如何麵對創業的坎坷，馬雲這麼說：“所以對於我來講這十年以來任何失敗、成功，取得的這些經曆是我最大得財富，有的時候可能要失敗、有的時候不失敗。比方說雅虎的購並，我們前期沒有想過，在並購的時候沒想到那麼大麻煩，麻煩被一個一個地解決往前走這就是一個經曆，失敗了也是經曆。人一輩子不會因為你做過什麼而後悔，很多的時候因為你沒做過什麼而後悔。創業者的心態要平衡好，你從第一天創業的時候要知道自己走的路是曲折的。”
大凡偉大之人，總有一段刻骨銘心的磨難、挫折之經曆。有人說“挫折是弱者的地獄，強者的階梯，智者的故鄉，偉人的天堂”，此話不假。亨利·福特在進軍汽車業的前三年，破產過兩次；美國大百貨公司梅西百貨曾經七次遭遇“轉折點”——也就是一般人所說的失敗，最後終於取得成功；萊特兄弟在經曆了數百次失敗的實驗以後才駕駛著人類第一架動力飛機飛上了藍天。
弱者在錯誤中懊悔、倒下，而強者在錯誤中學習、成長。馬雲常常開玩笑說他在經營阿裏巴巴前已經犯下一千零一個錯誤。對於馬雲這樣的強者來說，經曆了那麼多錯誤，將會增長多少智慧啊。“武林高手比的是經曆了多少磨難，而不是取得過多少成功。”
斯巴昆說：“有許多人一生之所以偉大，那是來自他們所經曆的大困難。”精良的斧頭、鋒利的斧刃是從爐火的鍛煉與磨削中得來的。很多人，具備“大有作為”的才智，但是，由於一生中沒有同逆境搏鬥的機會，沒有被困難充分磨煉，不足以刺激起其內在的潛能，以至於終生默默無聞。
蠶蛹在成為蝴蝶之前，會經曆痛苦的蠕動和掙紮，隻有這樣，它才能蛻變出美麗的翅膀和輕盈的身體。化蝶之理，對人亦同！也許在獲得成功之前，我們都會必不可少地經曆痛苦，可隻有在痛苦過後，品嚐到的幸福才更香、更甜！
其實在生活中,很多時候我們就如那小小的蛹，經常陷於一種生存的窒息狀態，或是處於絕望的境地。這就需要我們用智慧和良好心態去突破將自己包裹起來的厚重外殼，盡管這一過程會很痛苦，但於生命的重生，它又實在是一種必需。所以破繭成蝶，是人生的一種境界。能夠破繭成蝶，就會有重獲新生的歡愉和快慰。