小人國遊記
外科醫生格列佛愛好航海。1699年他登上羚羊號海輪前往南太平洋，中途不幸遇險，他隨著海浪漂到了岸上，困乏使他很快睡去。
當他醒來的時候，忽然感覺自己被什麼東西束縛住了。仔細一看，他發現無數的絲線係滿了他的全身，四周全是無數身高六英寸的小人。他們騎著戰馬，揮舞著刀劍，向格列佛發動了進攻。格列佛無力反抗，束手就擒。勝利的小人將格列佛運往了京城，並把他關在小人國最大的神廟裏。這個巨人的出現使小人國幾乎萬人空巷。
很快，格列佛便以他的善良贏得了國王和人民的信任，並逐步熟悉了小人國的風俗習慣。國王最愛看臣子們在繩上跳舞，並以此作為選拔人才的標準。財政大臣（影射當時英國首相）跳得最好而得到國王的寵幸，不過有一次他差點摔死，國王的座墊（影射當時英國國王的情婦）救了他。
小人國當時麵臨兩大危機：強敵的入侵和內部的黨爭，戰爭的原因是兩國爭論吃雞蛋應該先吃大頭還是小頭（影射英國當時的對外擴張）；黨爭的原因是兩派鞋跟的高低（影射英國黨爭）。格列佛無意參加內部黨爭，便渡海幫助國王將對岸敵國強大的艦隊繳獲過來。
格列佛立了大功，敵國很快派人講和並簽定了條約。但國王野心很大，命令格列佛將敵國徹底消滅，把那裏變成自己的行省，格列佛拒絕去做劊子手，國王很不高興。這時，皇後寢宮失火，情急之下格列佛用一泡尿澆滅了大火，皇後備感羞辱，發誓要報仇。小人國君臣經過商議，決定以叛國罪刺瞎格列佛的眼睛，格列佛聽到消息逃到了對岸的敵國，敵國國王也想讓他成為自己的戰爭工具。一天，他在海邊發現了一條小船，便離開了小人國，後來被一條商船帶回了祖國。
大人國遊記
在經過兩個月的短暫休整後，格列佛又登上冒險號商船，又一次遠航印度洋。途中遭遇風暴，船被刮到了北美洲的西海岸。在上岸尋找給養的過程中，被一個高達20米的巨人追趕，其他人都脫險了，隻有格列佛被丟在了岸上。
格列佛躲在一處麥田裏，結果被麥田的主人發現，帶回家中成了他小女兒的寵物。在她的保護和指教下，格列佛逐步熟悉了他們的語言和習慣，原來這裏是大人國，所有的物品都巨大無比。由於格列佛聰明機智，他很快名聲遠揚，他的主人把他作為賺錢的工具進行巡回表演。
他們來到了大人國的首都，引起了巨大的轟動。王後將他買了下來，作為自己的寵物。在宮廷中，他以身材之小和才智之高極為得寵，但也時時遭受著如老鼠、小鳥等動物的侵害，鬧了不少笑話。
格列佛多次向國王介紹英國的政治、經濟、文化情況，誇耀自己祖國的偉大。國王聽了他的談論，卻不斷對其中的漏洞進行反問，格列佛常常被問得無話可說。國王總結說：英國近百年的曆史“隻不過是一大堆陰謀、叛亂、暗殺、屠殺或流放。這都是貪婪、黨爭、偽善、無信、殘暴、憤怒、瘋狂、怨恨、嫉妒、淫欲、陰險和野心所能產生的最大惡果”。大人國中也有人類的通病：貴族爭權奪利，人民要求自由，君王卻主張專製，內戰也時有發生。最後3方簽定了公約：大家一致同意設置民兵，確保國內的安定團結。
格列佛在大人國住了兩年，思鄉心切。在一次隨國王南巡時，裝病到海邊呼吸新鮮空氣。這時，一隻大鷹從天而降，將裝有格列佛的木箱叼走。木箱落入海中，被路過的一艘英國商船救起，格列佛回到了祖國。
飛島遊記
在家住了兩個月，格列佛又登上了商船去東南亞一帶遠航。當船開到越南，船長因事上岸，格列佛被任命為船長，繼續向東北方行進，途中遇到海盜襲擊，他僥幸逃脫，被一座能飛動的島嶼救起。