李鴻章趁機勸曾國藩放棄祁門，另移他處，但他不是直接勸說，而是迂回。他專函胡林翼請其代勸。胡於三月十二日（4月21日）致函曾，說道：李鴻章“之議頗識時務”，左宗棠建議移駐九江也是把握了形勢，但您未必采納，如果能在湖口或東流設立大營，聯絡南北兩岸則功效必大。
後來又經曾國藩的親弟曾國荃來信相勸，曾國藩這才於三月二十六日（5月5日）離開祁門，四月初一日（5月10日），曾到達位於長江邊的東流。這裏可西溯武漢，東下安慶，聯絡諸軍十分方便。
曾國藩在北京時，就患了皮膚病，身生瘡癬。現在駐紮於東流，雖是江邊，仍然燥熱難當，痛癢不止，手不停的撓，幾乎無以存活。更兼身邊沒有李鴻章這樣的得力助手，居然感到難以作事了。
清夜深思，他雖然仍不能同意李鴻章的意見，但覺得李鴻章能以個人進退來堅持自己的立場，確屬性格剛毅，難能可貴。五月十八日（6月25日），他專函李鴻章，劈頭寫道：“閣下久不來營，頗不可解。”接著剖析說，以公事論，鴻章仍是淮陽水師的長官，以私事論，鴻章離開祁門時並沒有說不再回來；最後說到自己的身體情況，“鄙人遍身熱毒，內外交病，諸事廢擱，不奏事者已五十日矣！”情詞懇切地請李鴻章速來相助。
麵對這樣真摯的邀請，又是老師困難時期，李鴻章再也無法推辭了。
六月六日（7月13日），他來到東流大營，重入曾幕。下午，他們談了很多；晚飯後，曾國藩將手上的藥洗了洗，又與李鴻章談了起來，直談到二更末。這一夜曾國藩因與李鴻章之間消除嫌隙、無話不談而興奮得不能成眠。
他們連日長談，大有“一日不見如三秋兮”之感。他們之間的關係已經超出一般的師生情感，可以說是無話不說的諍友。二十八日（8月4日），李鴻章來到曾國藩的後院，一邊乘涼，一邊長談，至二更三點才散。他甚至說到了曾國藩的缺點是“懦緩”，辦事總是多謀少斷，不能大刀闊斧。
有時，曾國藩不便出麵處理的事情，就讓李鴻章去處理。例如鮑超從九江率軍前來，這麼重要的事情他避而不見，讓李鴻章去接見。因為他不滿意鮑超不分輕重緩急跑到這裏來。
八月初一日（9月5日），曾國藩得知安慶攻克。初五日（9月9日），他同李鴻章一起乘船去安慶犒師。此間正值鹹豐帝駕崩消息傳來，即在安慶大營設立靈殿，安排文武官員們祭奠。在這個特殊時期，他們更是每天長談。他們的思想是相通的，共同憂慮著時局的安危。
十五日（9月19日），李鴻章得到元配夫人周氏去世的消息，回到江西料理喪事。直到九月二十四日（10月27日）重回安慶。
此後，他們繼續關注著朝局變化。當他們得知北京發生宮廷政變的消息，鹹豐帝臨終任命的讚襄政務王大臣肅順等八人被推翻，政權由慈禧和慈安兩宮皇太後和恭親王掌握。他們共同感到“皇太後英明果斷，為自古帝王所僅見”，因而“相與欽悚久之”。
前後數載，進進出出，李鴻章坐幕曾府，曆練品性，靜觀時局，時有用兵，不輕易拋頭露麵，終悟出隱忍玄機，使其終生受用不盡。