為紀念這位偉大的數學家，人們修建了秦九韶紀念館，中科院院長路甬祥親自題詞，四川師範大學確定秦九韶紀念館為“秦九韶數學史教育研究基地”。
秦九韶紀念館座落在安嶽縣城南郊一公裏的雲居山腰，緊鄰旅遊景點圓覺洞。占地麵積六千五百多平方米，建築麵積一千五百多平方米，為仿宋古建築，整個建築典雅別致。秦九韶紀念館的正殿，正中的漢白玉雕像就是秦九韶。左右分別立有一匾，右匾記載了秦九韶的生平，左匾是秦九韶籍貫考證者邵其昌同誌撰寫的題記。
該館於1998年9月9日修建，2000年12月1日正式開館。2000年12月4日，在秦九韶紀念館舉行了落成典禮暨秦九韶《數書九章》學術研討會。中科院院士、北京天文台名譽台長、原北京天文台台長王綬琯、中科院院士、四川大學校長劉應明、內蒙古大學教授李迪、中國數學學術研究會副理事長郭書春、中國科技館館長王渝生、美國博士Johnson、中國科學史學會副理事長陳久金、陝西天文台研究員劉次沅、四川師大原副校長杜心華、四川省社會科學院研究員查有梁等專家、教授、學者和資陽市、內江市、安嶽縣領導出席了會議。中國科學技術館、中國數學史學會、中國科學技術史學會、中國科學院數學研究所、中國科學院自然科學史研究所贈送了匾牌。
2002年省委宣傳部、省科技廳和省科協發文公布秦九韶紀念館為“四川省科普教育基地”。2002年6月28日，四川師範大學決定把秦九韶紀念館作為四川師範大學秦九韶數學史教育研究基地。2007年1月，市委、市政府命名秦九韶紀念館為市級愛國主義教育基地。
紀念館自開館以來，本著弘揚愛國主義精神、繼承民族傳統美德的目的，對青少年參觀實行免票政策，每年前來參觀的青少年學生和外地遊客絡繹不絕。