軍隊體製
南朝軍隊體製，主要分為中軍、外軍兩部分。
中軍又稱內軍。南朝中軍以六軍為主，即領軍、護軍、左衛、右衛、驍騎、遊擊六將軍所統軍隊。此外，有左、右、前、後四將軍，稱為四軍。宋武帝劉裕曾恢複屯騎、步兵（梁為步騎）、越騎、長水、射聲五校尉所統軍隊，以擴大宿衛宮城及京都的兵力。還有虎賁中郎將、冗從仆射、羽林監所統軍隊，謂之三將。蕭梁曾改驍騎將軍為雲騎將軍、遊擊將軍為遊騎將軍，另置左、右驍騎將軍，左、右遊擊將軍，位在雲騎、遊騎將軍之上。上述諸軍皆為中軍，但六軍是中軍主力。中軍中的左、右衛宿衛宮闕，其餘眾軍平時保衛京師，戰時出兵征討。宋武帝曾下令：“有征討悉配以台見軍隊，行還複舊。”所謂“台見軍隊”，主要是指中軍。南朝中軍兵力總數不見記載，但從多次出兵數量看，最多當不過10萬人左右。南朝中軍實力遠不如魏晉中軍，甚至不如南朝某些大州都督所擁有的兵力，這也正是南朝內輕外重政治軍事形勢的特點。
六軍中的領軍將軍，是中軍首領，資曆名望輕些的為中領軍。史稱：“領軍將軍一人，掌內軍。”齊、梁、陳各代大體如此。領軍將軍權力很大，南朝人稱其為“端戎”。
南朝太子東宮宿衛兵，由太子左衛率、太子右衛率所統兵。劉裕曾增置太子屯騎校尉、太子步兵校尉、太子翊軍校尉共21人，太子虎賁中郎將10人，殿中將軍10人，他們或領兵，或為太子身邊的高級侍從武官，以加強東宮防衛，保衛皇位合法的繼承人。宋代東宮宿衛兵數量多時有萬餘人。東宮設太子詹事，職比尚書令和領軍將軍，總管東宮軍政，統率東宮宿衛兵。宋世曾規定，東官兵不得入台城。東官兵由太子直接掌管，不隸領軍。但朝廷有事出征，可以征調。
南朝外軍，即各地都督所統軍隊及地方州郡兵。沿東晉舊製，南朝都督幾乎遍布於全國，揚、南徐、南兗、徐、兗、青、冀、豫、荊、江、湘、雍、梁、秦、交、廣、益、司等州都曾置都督。南朝都督所轄少則一、二州，多則八、九州，最多者至十六州。凡都督皆領兵，有些都督擁有軍隊數量十分可觀，所以當時人說：“群蕃嶽峙，銳卒精旅，動有萬數。”南朝都督皆兼任刺史，既總數州軍事，又總民政，獨攬一方大權。各地都督軍隊總數當為中軍數的若幹倍，有時某一都督統兵多者，也可超過中軍數。南朝外軍兵力除布防在與北朝接壤的沿邊鎮戍外，內地主要分布在荊、揚、南徐等州。荊州駐紮重兵，以接應南北爭奪的襄樊前線，揚、南徐二州為京都兩翼，其雄厚兵力則為拱衛首都建康。南朝都督由中央任命，君主當然有對其征召調遣的權力，對他們也還有一些具體的限製。如宋孝武帝大明（457～464）年間，曾命令。刺史守宰，動民興軍，皆須手詔施行。”都督概兼刺史，這自然是對都督的限製。但南朝某些都督軍隊實力既超過中軍，又獨擅一方軍政大權，完全有條件抗命不遵，乃至起兵謀叛。南朝齊、梁兩代開國君主都是憑借方鎮軍隊起事，奪得皇帝寶座的。
中央以六軍中的護軍將軍總統都督外軍，資曆名望較輕的為中護軍。史稱：“護軍將軍一人，掌外軍。”又說：“今護軍總方伯。”因此，護軍將軍權力也很大，當時謂之“總戎一。但中央對外軍的調遣，一般通過皇帝下詔，而護軍將軍直接指揮都督軍隊的記載不甚明顯。
州郡兵是州、郡所領軍隊，屬地方軍。南朝時期，州、郡皆有兵。宋初，北魏犯境，弘農郡太守竇應明曾率郡兵500人參與抵抗。宋元嘉末，孝武帝亦曾令州郡“並出兵”討伐叛逆。南齊時，曾發南康、廬陵、始興郡兵征交州。各州、郡根據大小領兵不等。州、郡無權擅自出兵，受所隸都督節製，有戰事時直接聽命於中央。
南朝中外諸軍的領導權總歸於皇帝。征發調遣時，皇帝頒詔，尚書下符。南朝尚書八座中有五兵尚書一人，專總兵事。尚書諸曹郎中有中兵、外兵等曹。宋代雖曾一度廢五兵尚書，但中兵、外兵曹郎仍設置。中軍、外軍、東官兵，中央都有權調遣。南朝除皇帝而外，總領中外一切軍隊的職位，叫都督中外諸軍事，凡任此職的可以調遣中外各軍。南朝開國之君，都曾在前朝任此職務，因而憑借軍權爭得皇位。
兵役製度
南朝通行的兵役製度是世兵製、征兵製和募兵製並用。南朝世兵稱為軍戶，仍與普通民戶分立戶籍，軍府統轄，軍戶不經放免，子弟要世代為兵。但由於長期的戰爭消耗、士兵逃亡、私家分割等原因，南朝世兵的數量日漸減少。再者，由於軍戶的低賤身份，使其戰鬥力日見低落。世兵數量的減少和戰鬥力的低下，反映了南朝世兵製的衰落。因此，南朝兵士來源不得不以征兵與募兵進行補充。征兵即征發民丁為兵。南朝曾多次征發民兵，如宋元嘉末北伐，曾以兵力不足，征發南兗州“三五民丁”。所謂“三五民丁”，即戶有三丁者，出一人為兵；戶有五丁者，出二人為兵。所征民丁接到命令10日後，就要到指定地點集合。南齊時，齊武帝也曾發揚、徐二州民丁為兵。南朝的征兵，不是經常性的製度，僅在有重大戰事時臨時征發。征平民為兵，常為臨戰應急。因未經訓練，軍紀和戰鬥力極差，所以他們在軍隊中並不占有主要地位。南朝軍隊的主要兵源來自招募。募兵時多招募有軍事技藝的勁勇為兵，戰鬥力強。這是維持軍隊數量，尤其是維持軍隊戰鬥力的可靠途徑。南朝募兵極為盛行，內外軍隊大多由招募者組成。如宋元嘉末與北魏大戰前，就曾招募“天下弩手，不問所從，若有馬步眾藝武力之士應科者，皆加厚賞”。宋明帝即位時，四方反叛，曾派人募江西楚人，得“快射手八百”。南齊時，防戍北邊與北魏對壘的軍隊，多為募兵組成，對外用兵，也多用募兵，永明年間，因北魏聲言南下，齊武帝曾“廣設召募”。梁、陳也都是以募兵為軍隊主力，其開國之君梁武帝、陳武帝都以募兵起事。南朝各代方鎮所統的大量軍隊，大都是靠召集宗族鄉裏或流亡農民組成的。總之，南朝時期，募兵是軍隊的主要來源，通過招募集兵是最重要、最流行的方式。募兵不是終身為兵，應募為兵者，在一定期限後，就可以免除當兵的義務，因而兵士身份地位提高了，其戰鬥力也增強了。