依克唐阿回到家鄉，處理完母親的喪事，便開始為母守孝。依克唐阿雖然解職居家，但其軍事才華和行政能力已為很多大臣所周知。光緒六年（1880年）七月，詹事府右庶子張之洞在上奏條陳海防事宜時，力諫朝廷破例啟用依克唐阿。張之洞建議：呼蘭副都統依克唐阿驍勇善戰，現因丁憂在吉林原籍，請俟百日後飭赴營口帶兵。”朝廷對此非常重視，命令吉林將軍銘安“察看其入才具，能否獨當一麵，據實具奏。”銘安遵旨察看依克唐阿之後，認為其完全具備“籌辦安置金匪情形”的能力。
原來，《中俄璦琿條約》和《中俄北京條約》簽訂後，烏蘇裏江以東地區劃入俄國版圖，吉林將軍轄區急劇縮小。隨著封禁東北政策的廢除，大批關內移民來到吉林東部地區。人口的迅猛增加和管理的滯後，使這裏的社會極為混亂，流民、金礦工人起義以及土匪暴動等此起彼伏。經過清朝地方軍隊的圍剿和鎮壓，“寧古塔、三姓、東山一帶金匪，自擒斬孫百萬等及查拿韓效忠後，近無著名頭目，其聚多偷挖金砂者，率係無業流民。”針對這種局勢，吉林將軍銘安提出：對於這些無業流民，“撫之未必得力，逐之恐為敵誘，擬設法安置。”張之洞也認為：“既無剿捕禁絕之方，不如化私為官，撫而用之，亦可藉以禦侮。”至於由誰來承辦此事，依克唐阿當然是最好的人選。於是朝廷傳旨令依克唐阿不用到營口帶兵，而是“召募獵夫人等，赴琿春駐紮。”
依克唐阿之所以被派往琿春，是由於琿春地區的重要性已經引起清朝政府和沙俄的重視。琿春地區原隸屬於寧古塔副都統衙門。康熙五十三年（1714年），設琿春協領衙門，協領衙門隻管八旗一般事務及當地所設驛站卡倫，一些重要事宜，如司法、涉外等項需要報請寧古塔副都統衙門辦理。雍正五年（1727年）設副協領。乾隆元年（1736年），因外事殷頻，奏加副都統銜。到了光緒初年，由於邊境的變化，琿春失去了沿海地區，成為中國與朝鮮、俄國接壤的邊疆要地。而寧古塔副都統衙門距琿春較遠，難以兼顧。這裏不僅人口增多，商業往來事務繁雜，而且涉外交往日益頻繁，但行政管理非常落後，駐防城池以及各卡倫驛站也需要增加兵力，設置官兵也不夠分配，原設的機構和兵力不能夠勝任駐防和管理，需要增加有經驗的各種人才、官員，增設管理機構。
光緒六年（1880年）八月，清朝政府開始招募、組織調集軍隊，駐紮琿春。“現在吉林琿春地方防務緊要，亟須添兵布置，以備不虞。吉林舊有剿捕土匪馬步各隊，著銘安移緩就急，飭令協領雙壽、金福將此項馬步洋槍各隊分帶一千五六百名，趕赴琿春，擇要駐守。並著德平阿揀派妥員，速將塔城東南蘇城翠峰各溝獵夫，盡數招致營中，以五百人編立成軍，均紮琿春。”副都統依克唐阿也被委以重任，前往琿春駐守指揮。“現在防務需人，著即速飭該副都統（依克唐阿），就近在伊通召募滿漢獵夫暨蘇拉西丹，前赴琿春。並雙壽、金福、副將郭長雲、馬步各隊，均歸該副都統統帶，會商德平阿擇要駐守。”光緒六年（1880年）九月，朝廷再次下諭“谘照依克唐阿，趕將伊通丹勇召募成軍，即赴防所。”
依克唐阿接到朝廷旨令，立即行動起來，在伊通招募獵人勇士，組成軍隊奔赴琿春。到琿春後，依克唐阿與各級官員密切配合，將各地招募來的鄉勇獵夫，認真揀選，嚴格訓練，最終組建成了吉林鎮邊營。光緒七年（1881年）二月，烏裏雅蘇台參讚大臣喜昌奏報奉命挑募吉軍暨鎮邊各營情況，“經與副都統依克唐阿將吉林、烏拉、阿勒楚民丁暨兵丹獵夫，認真揀選，擇精壯者為正兵，粗拙者為營夫。軍火由銘安借撥，克期訓練，冀成勁旅”。
隨著吉林鎮邊營的組建和駐防軍隊的增加，琿春地方的軍政管理機構也急需升格。特別是19世紀70年代以後，烏蘇裏江及其以南中俄邊境上俄國移民驟增，俄人經常越境到中國境內墾荒。俄國軍隊也不斷蠶食中國領土，甚至搶掠、殺害中國邊民。一些俄軍哨所，也逐漸向中國邊境推進。烏蘇裏江及其以南中俄邊境邊防緊張。光緒七年（1881年）初，吉林將軍銘安不失時機地奏請朝廷，“添設琿春副都統一員，將原設協領改為左右兩翼，以資分管”。同年四月，朝廷批準了這一請求，“以呼蘭副都統依克唐阿，為新設琿春副都統。伯都訥副都統博棟阿為呼蘭副都統，前任西安副都統明春為伯都訥副都統”。這樣，依克唐阿則由首任呼蘭副都統變成了首任琿春副都統。