為除掉安德海，載淳曾找慈安太後密商辦法，他們認為山東巡撫丁寶楨敢作敢為，因此在丁寶楨入京晉見時，令他俟機誅殺安德海，丁寶楨慨然允諾。同治八年（1869）七月，慈禧太後命安德海南方采辦宮中用物，安德海自然得意非常，他公然打著欽差大臣的旗號乘桉船沿運河南下，一路聲勢浩蕩，招搖納賄。安德海進入山東德州地界時，丁寶楨得知消息。他令總兵王正啟率兵追安德海。等追到春、泰安，王正啟抓住了安德海，並馬上把他押送到濟南府。
逮住安德海後，丁寶楨便飛馬上奏朝廷。慈安太後得到報告，立即召見軍機大臣奕沂及內務府大臣等訥議處置辦法。諸位大臣都說太監不得出都城之門乃是祖製，大清建立200多年來還從沒有敢違犯的，如有違犯者要堅決處死不可饒恕，安德海應就地正法。慈安太後果斷的以皇帝的名義降旨，在濟南殺掉了安德海。
鈕祜祿氏為人寬厚仁愛，小皇帝載淳雖不是她親生的兒子，但她與載淳的關係和對他的照顧卻遠遠超過載淳的生母慈禧太後。
為同治皇帝選立皇後，體現了慈安太後關心小皇帝慈母之心。她怕載淳親政以後，年紀太輕，不能勝任繁重的政務，所以得要一位成熟賢淑、識大體，而又能動筆墨的皇後，輔助皇帝。出於這種考慮，她先同載淳商量，征得了載淳的同意，在立後問題上，明確堅持要立載淳滿意的鈕祜祿氏為皇後。皇帝“大婚”之後，慈安太後對皇後鈕祜祿氏更是百般關照，每次皇後來問安、伺膳，她都熱情接待，並屢次催促皇後早早回宮，不必過於拘禮。由於慈禧太後的挑撥、幹擾，致使帝後分居，造成了以後的悲劇。在載淳剛死後的幾天裏，也多虧她安慰、開導皇後，才使鈕祜祿氏有了生活的勇氣。
穆宗死後，載恬被立為帝。即德帝，亦光緒皇帝，本非出自慈安太後之願，完全是慈禧太後的主張。由於德宗皇帝即痊時年紀尚幼，兩宮皇太後二次垂簾聽政。這時雖然是二人同時訓政，但慈安太後已無一分權力。實權都掌握在慈禧太後手中。在光緒年間，她一心信奉佛教，在宮中天天以持齋念佛為主要功課。這樣，慈禧太後更覺無所約束，益加肆意弄權，膽大妄為了。
光緒一朝，慈安太後日益倦怠不聞外事，而慈禧太後則日益振奮統攝全局大權獨攬。從生活上說，慈安太後崇尚節儉，不事鋪張，吃飯以素食為主。而慈禧太後卻肆無忌憚地揮霍。她在體和殿每日正餐兩頓，每頓飯僅主食就有50多種，菜肴120多樣，每天需用豬、牛、羊、魚、兔肉500多斤，雞鴨100多隻，前前後後要有450多人伺候，花費白銀達千兩。耗費之大，實在驚人。同慈安太後形成了鮮明的對比。
慈禧太後經常單獨召見大臣，決定大事要事逐漸地也不再告知慈安太後。慈安太後打算勸阻慈禧太後的驕橫擅權的獨斷行為，給她一個警告，使她收斂一些。在光緒七年（1881）的某一天晚上，慈安太後在自己宮中置辦酒宴，說是為慈禧太後祝福。酒至半酣，慈安太後屏退左曆侍從人員，先熱情詳細地追述了在熱河行宮，蕭順擅權，兩宮太後受擠，隨後果斷謀劃辛酉政變，以及同治十一年間二人同時垂簾聽政的事情，動情外抽泣垂淚良久。慈禧太後聽了也悲不自勝。慈安見打動慈禧，忽然話題一轉道：“咱們姊妹現在都老了，說不定哪天就要離開塵世。相處20多年，所幸從赤都是同心協力，連一句衝撞對方的話都沒說過。而我這裏存有一件東西則過去從選取帝文宗處接受過來的，現在它已經沒什麼作用了。”說完，慈安太後從袖子裏拿也一個精微的信封遞線性慈禧太後，讓她拆開看一下。慈禧太後接過信封，女子奇的啟封後細看，嚇得臉色頓變，羞慚得不敢抬頭看慈安太後。這封函內裝的不是別的，正是清文宗交給慈安太後的遺詔。遺詔的大意是：葉赫那拉氏是皇帝的親生母親，母以子貴，日後定會尊封為皇太後，我對此人實在是不能深信。此後如果她能安分守法也就罷了，否則，你可以出示這一紙詔書，命延臣宣布我的遺命，把她除掉。
慈禧太後看完後，慈安太後把安要回，當關慈禧的麵非常仗義地放在燭火上燒掉了。當時，慈禧太後慚愧與惱怒的心情交加，但仍勉強裝出感激淚下的樣子。慈安太後又對她百般勸解安慰，至此酒宴方才結束。過了幾天，慈安太後偶然因有事到慈禧太後宮中，慈禧太後對她禮節周全非常恭敬，一反過去那樣驕狂放縱，連一旁伺候的太監宮女都感到很奇怪。慈安太後也暗自高興，以為是前日自己燒密旨的做法收到了預期的效果。兩個人坐下來聊天，越聊越投機，時間稍長，慈安太後覺著腹內稍微有點饑餓，慈禧太後即令侍者捧來一盒糕餅，慈安太後吃著很香甜，很對口味，說這好像不是禦膳房做的食物。慈禧太後回答：“這是我妹妹送給我的。姐姐您喜歡吃，明天我叫她再送一份來。”過了一兩天，慈禧太後派人把糕餅幾盒送進慈安太後宮中，花色味道與慈安太後上次吃過的一模一樣。慈安太後隻吃了一兩個，頓時就覺得不舒服，不料到了晚上，年僅45歲的慈安太後中毒身亡。