做完這幾件事情後，朱常洛的生命也走到了盡頭，由於病情加重，無藥可救，朱常洛竟急病亂投醫，服下了官員李可灼人乳調藥後的一枚紅色藥丸，就是所謂“紅丸”。第一枚服下後，朱常洛頓感舒服，後來擔心藥力不足，又再服下一枚，結果服下後不久，朱常洛便帶著一腔遺憾，撒手歸西了。這就是明末“三案”中的“紅丸案”。
熹宗朱由校
（公元1605年～公元1627年）
在位時間：公元1620年～公元1627年
曾用年號：天啟
諡號：皇帝
廟號：熹宗
安葬地：德陵
公元1605年，明光宗朱常洛的長子朱由校出生。
公元1620年，在祖父明神宗和父親明光宗相隔一個月先後辭世後，朱由校即位，是為明熹宗。
公元1627年，明熹宗病死，年僅23歲。
公元1620年，明朝的兩個皇帝相隔一個月先後去世。先是明朝在位時間最長的皇帝神宗於農曆7月21日去世，他的兒子朱常洛於農曆八月初一即位，農曆九月初一早晨死去，不多不少，正好一個月。
朱常洛死後，方從哲、周嘉謨、楊漣等大臣闖入宮中，硬是將被光宗寵妃李選侍所匿藏的皇長子朱由校搶過來，擁立為帝，是為明熹宗。
朱由校能夠即位稱帝，東林黨人楊漣在其中所起的作用無可厚非，甚至為籌辦朱由校的登基大典，滿頭黑發和須眉竟然在幾天之間都變成了白色，朱由校非常感動，連聲稱他為“忠臣”。朱由校的即位，也是東林黨人取得的重大勝利。
東林黨人自詡為朝臣中最清白最忠直的大臣，認為自己肩負天下興亡的重任，對其他官僚集團極盡諷議之能事，因而引起齊黨、楚黨、浙黨、昆黨等官僚集團的不滿，並與之作對。東林黨人在這些官僚集團的圍攻下，倒有些支撐不住了。這次擁立朱由校有功，東林黨人也在朝中翻身鬥地主了，將保護鄭貴妃的黨派都一一清除，一時如日中天。東林黨人在當政後，也算是做了些實事，停止了神宗時期的一些弊政，停罷了杭州織造、革除了南京的鮮品進貢；對發生重災的地方進行了賑濟；免除了天下帶掙錢糧及北畿地區的加派，減輕了某些地區的賦稅。其他的就是恢複了張居正的官蔭，給建文時期的方孝孺等人平反，恢複了名譽。但是，東林黨人不過是對病態懨懨的明王朝做了些隔靴搔癢的事情，他們不是政客，而是文人，雖有心治天下，卻無力治國家。讓他們做個禦用文人，批評朝政的時候出來指手畫腳，倒還能人盡其才，但要讓他們治理國家，也就勉為其難了。
因而神宗末年的狀況沒有根本的改變，對國家亦無明顯建樹。
正當東林黨人在前廷蹦得正歡的時候，後宮中卻悄悄地崛起了一股政治勢力，這就是魏忠賢太監集團。
魏忠賢的興起，要源於朱由校剛出生時，一個農家少婦的進宮。她就是朱由校的奶媽客氏，客氏入宮後，憑著心靈嘴巧，在宮中上下折騰，很快就讓朱由校的生母王氏放心地把朱由校托付給了她。此時已產生了非分之想的客氏，充分地利用了這個機會，對朱由校的照顧是無微不至，以至於客氏按皇上斷奶後奶媽就要打發出宮的規定回家時，朱由校離開她便大哭不止，不吃不喝，朱由校的母親王氏便破例將她留下來，繼續服侍朱由校，等到王氏一死，朱由校競漸漸地把客氏當成了母親。
朱由校即位後，客氏這個“假皇母”竟然在後宮中擺出不可一世的架子來，使得那些有名封的後妃嬪貴不敢瞧不起她這個農家女。這時，客氏又在宮中遇到一個和她有同樣出身、同樣感情、同樣野心的太監，二人一拍即合，隨即串通一氣、狼狽為奸，進而幹預國家政治，淆亂天下，這個太監就是魏忠賢。
魏忠賢本已娶妻生有一女，但因欠了一屁股賭債，加上其妻也離他而去，走投無路的魏忠賢隻有淨身入宮，做了個小太監。遇到客氏後，兩人一見鍾情，形成了太監宮女過假夫婦生活的“對食”關係。朱由校即位後，客氏將魏忠貿引薦給朱由校，從此兩人就成了朱由校的親信，對二人也恩寵有加。
這時如日中天的東林黨人害怕失勢，也害怕朱由校被二人迷惑挾製，重演出太監專權、阿保亂政的局麵。