準備北征
經過了長時間的醞釀和準備，鄭成功決定發動長江之役。此役，時人稱“延平王北征”、“江南之役”、“長江之役”、“進取南都”或“南京之役”。
早在清順治九年（1652年）海澄之戰大捷時，周全斌曾經獻策“從洞庭湖而直取江南，是為上策”，這給鄭成功以不少啟示。為此，他多次派張名振、陳輝等率師入長江，進行武裝偵察。順治十一年（1654年），李定國曾致書鄭成功，建議合兵“直取江南”。順治十二年（1655年），鄭成功開始有了親自北征的意向，他認為：清軍入關後“數年間河北人民半付澤國，江南百姓多化魃鬼”。第二年，他又想乘清軍在中原兵力空虛，有機可乘，願與李定國會師北征，“掃清宮闕，會盟畿輔”。
順治十四年（1657年，南明永曆十一年）四月，鄭成功因為許多城池頻得頻失，終無了局，思慮何時才能得望中興？這一天，他征求眾文武臣將的意見。
吏官潘庚鍾說：“邊地雖得，亦不足為業，難以號召天下豪傑。”他總結明太祖建水師、成一統天下的經驗，建議：“漳泉沿邊，數載爭戰，民亦苦極，不如將數百號戰艦直從長江而入，逼取江南，南京一得，彼閩、粵、浙、楚以及黔、蜀之豪傑，均會起而響應。”
甘輝不同意潘庚鍾的外線出擊建議，他說：“倘大隊前進，而清軍偵知，會合水師出攻兩島，豈不危乎？不如就近窺其釁隙攻取，進可攻，退可守。”
潘庚鍾認為甘輝所言，是“眼前常見，非長久之計。”他說：“一旦清軍集天下之兵來攻，金、廈豈能獨全？眼下，應乘孫可望、李定國在滇、黔、粵西牽製，我軍入據長江，截其糧道，則江南半壁悉為我有。”
工官馮澄世讚成潘庚鍾的見解，說：“潘參軍之論，正是舍末而就本。”
參軍陳永華說：“潘、馮二參軍持論師出江南，號召天下，其見甚高，蓋取江南，而兩島自安。若偷安歲月，一旦合攻，雖使孔明複生，亦難措手矣。”
鄭成功說：“吾亦有心北征久矣。正如諸葛武侯所言，‘勢不兩立’，清朝豈肯每飯忘我耶？”因此，他主張，先派人去見孫可望、李定國，共約集兵而會江南，以分敵勢，天下英雄定能相從。
潘庚鍾建議：“鑒於孫、李不和，可差能員前往，說孫、李忠君愛國之心，忘私憤而伸大義，分道出師，立功者稱王，庶得萬全。”
鄭成功拍案稱好，說：“此論最是。”於是，派楊廷世、劉九皋二使，泛海間道去粵西拜見永曆帝。楊、劉二使於九月到達，當麵向永曆帝奏報鄭成功雄兵20萬直取金陵的計劃，永曆帝大喜，冊封鄭成功為王，同時封王秀奇為祥符伯，馬信為建威伯，甘輝為崇明伯，陳輝為忠靖伯，洪旭為忠振伯，黃廷為永安伯，萬禮為建安伯，鄭泰加少傅。永曆帝又親書手詔，令鄭成功迅速進師江南。十二月，楊、劉二使回到廈門，鄭成功拜受封冊，並照王府之規，設長史、審理、典寶、典杖、典儀、典膳等官。永曆帝封爵加官，為鄭成功親率大軍北征增添了新的動力。
在半年多時間內，鄭成功派人去浙江沿海招撫漁民，為進軍長江作向導；任命兵官洪旭、五軍都督陳輝二將，督水師諸鎮，留守金、廈。鄭成功親督舟師為北征作準備。
順治十五年（1658年，南明永曆十二年）四月，鄭成功對北征隊伍進行了重新調整編組。他任命：
中提督甘輝為前部先鋒，下轄：左虎衛陳魁所領鐵人5000，護衛兵1萬，宣毅前鎮陳澤、宣毅後鎮吳豪、前衝鎮劉巧、右虎鎮陳鵬、後勁鎮楊正、左衝鎮郭義、後衝鎮劉進忠、永武鎮樸世用等，領兵1萬，配坐大火貢船20艘，烏船20隻，快哨10隻，為首程。