電泳（Electrophoresis）是帶電物質在電場作用下，向著與其電荷相反的電極移動的現象。電泳現象早在19世紀初就已發現（1808年俄國物理學家Reǔss進行了世界上第一次電泳實驗）。但電泳技術的廣泛應用，則是在1937年用濾紙作為支持介質成功地進行紙電泳以後，特別是近幾十年以來，電泳技術發展很快，各種類型的電泳技術相繼誕生，在生物化學、醫學、免疫學等領域得到了廣泛應用。
一、基本原理
當把一個帶靜電荷（Q）的顆粒放入電場時，便有一個電場力（F）作用於其上。F的大小等於質點所帶淨電荷量（Q）與電場強度（E）的乘積，可用下式表示：F=QE（5-1）由於F的作用，使帶點顆粒在電場中向一定方向泳動。質點的前移還要受到阻力（F′）的影響，對於一個球形質點，服從Stoke定律，
1.顆粒性質
顆粒直徑、形狀以及所帶的淨電荷對泳動速度有較大影響。一般來說，其餘條件不變情況下，顆粒帶淨電荷量越大，或其直徑越小，或其形狀越接近球形，在電場中的泳動速度就越快。反之，則越慢。
2.電場強度
電場強度是指單位長度的電位降，也稱電勢梯度。如以濾紙作支持物，其兩端浸入到電極液中，電極液與濾紙交界麵的紙長為20cm，測得的電位降為200V，那麼電場強度為200V/20cm=10V/cm。當電壓在500V以下，電場強度在2～10V/cm時為常壓電泳。電壓在500V以上，電場強度在20～200V/cm時為高壓電泳。電場強度大，帶電質點的遷移率加快，因此省時，但因產生大量熱量，應配備冷卻裝置以維持恒溫。
3.溶液的pH
溶液的pH決定被分離物質的解離程度和質點的帶電性質及所帶淨電荷量。例如蛋白質分子，它是既有酸性基團（—COOH），又有堿性基團（—NH2）的兩性電解質，在某一溶液中所帶正負電荷相等，即分子的淨電荷等於零。此時，蛋白質在電場中不再移動，溶液的這一pH為該蛋白質的等電點。若溶液pH處於等電點酸側，即pH＜pI，則蛋白質帶正電荷，在電場中向負極移動。若溶液pH處於等電點堿側，即pH＞pI，則蛋白質帶負電荷，向正極移動。溶液的pH離pI越遠，質點所帶淨電荷越多，電泳遷移率越大。因此在電泳時，應根據樣品性質，選擇合適的pH緩衝液。
4.溶液的離子強度
電泳液中的離子濃度增加時會引起質點遷移率的降低。其原因是帶電質點吸引相反電荷的離子聚集在其周圍，形成一個與運動質點電荷相反的離子氛（ionic atmosphere），離子氛不僅降低質點的帶電量，同時增加質點前移的阻力，甚至使其不能泳動。然而離子濃度過低，會降低緩衝液的總濃度及緩衝容量，不易維持溶液的pH，影響質點的帶電量，改變泳動速度。離子的這種障礙效應與其濃度和價數相關，可用離子強度I表示。
5.電滲
在電場作用下液體對於固體支持物的相對移動稱為電滲（electroosmosis）。其產生的原因是固體支持物多孔，且帶有可解離的化學基團，因此常吸附溶液中的正離子或負離子，使溶液相對帶負電或正電。如以濾紙作支持物時，紙上纖維素吸附OH-帶負電荷，與紙接觸的水溶液因產生H3O+，帶正電荷移向負極。若質點原來在電場中移向負極，結果質點的表現速度比其固有速度要快；若質點原來移向正極，表現速度比其固有速度要慢，可見應盡可能選擇低電滲作用的支持物以減少電滲的影響。
6.焦耳熱
在電泳過程中，電流強度與釋放出熱量（Q）之間的關係可列成如下公式
公式表明，電泳過程中釋放出熱量與電流強度的平方成正比。當電流強度或電極緩衝液以及樣品中離子強度增高時，電流強度會隨著增大。這不僅降低分辨率，影響泳動速度，而且在嚴重時會燒斷濾紙或融化瓊脂糖凝膠支持物。