PDE法測定方法的敏感度：在進行標準CaM活性測定的同時，增設CaM含量為0.1ng的管10支，測定的結果與PDE基礎活性管(即不含CaM的測定管)相比較，進行t測驗（檢測兩個樣本差異性的統計方法）。該方法的靈敏度可達到0.1ng。
雖然CaM最初被鑒定為是PDM的激活因子，但現在並沒有令人信服的理由在其測活試驗中非用這種酶不可。也可選擇用蛋白激酶測活，因為這種測活方法將產物吸附於磷酸纖維素紙上，可對大量結果進行快速分析。這一測活方法的特異性在於利用提純的酶(外加的)及特異的底物肽，將不同濃度的CaM用於平滑肌肌球蛋白輕鏈(myosin light chains,MLC20)的磷酸化反應，以等劑量的CaM標準品為對照，觀察各組MLC20磷酸化程度。反應條件如下：20mmol/L Tris-HCl(pH7.4)、1mmol/L DTT、5mmol/L MgCl2、60mmol/L KCl、2mmol/L ATP、4mmol/L肌球蛋白、0.2mmol/L肌球蛋白輕鏈激酶(myosin light chain kinase，MLCK)、0.1mmol/L CaCl2。加入CaM樣品與CaM標準品(濃度可為0.1～10μg/mL不等)，於25℃下溫育20min，用甘油電泳檢測各組MLC20磷酸化程度，用Scoin Image密度掃描軟件分析各組MLC20磷酸化百分率。
從理論上講任何一種被CaM特異性激活的酶都可以用來測定CaM的活性，其中，由於PDE比較容易分離提純，而且PDE係統比較敏感，因此被廣泛應用。CaM測活中最常用的兩種蛋白激酶是CaM激酶Ⅱ和MLCK。這兩種酶有一個優點是它們能在溫和的條件下與內源性CaM分離並純化，因此被測的組分可返加回去，以測定對鈣依賴性激活作用的活性。其他的蛋白激酶，如磷酸化酶激酶，就不大方便，因為它們與內源性CaM結合得太緊。此外，磷酸化酶激酶的激活動力學因其調控亞基的磷酸化需要附加條件而變得較為複雜。
（二）CaM的鑒定
（1）紫外吸收測定每個收集管中的OD280值，繪圖並確定高峰位置。再用紫外吸收圖譜分析儀對高峰位置和次高峰位置中的溶液分別進行掃描測試，與標準CaM的紫外吸收圖譜進行比較確定。
（2）電泳法十二烷基磺酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳（SDS-PAGE），觀察在分子質量大小約為16.8ku的區域是否出現一個單一的鈣調蛋白的條帶。此外，用於CaM的電泳法還有：無去垢劑的非變性PAGE和分析折疊狀態的尿素梯度PAGE等。