1月6日深夜，曾任杜瓦利埃政府國防部長的羅歇·拉豐唐率領十幾名軍人攻占了總統府的國民宮，將臨時總統特魯洛女士扣為人質，逼她辭去臨時總統一職。同時，拉豐唐宣布自己為臨時總統。
僅有十幾人發動的政變竟然如此輕鬆地成功了，不過拉豐唐的笑容並沒有維持多久。由於他的倒行逆施激起了國民的反抗，而武裝部隊司令亞伯拉罕是位具有正義感和民主意識的將軍，支持文人政府，於是他率兵包圍了總統府，拉豐唐及其追隨者被逮捕。民主最終取得了勝利，民主成果也因此得以留存。
1991年2月7日，阿裏斯蒂德正式宣誓就職。
總統寶座從來不是一把安樂椅，海地總統之位更是如此。對於阿裏斯蒂德這位剛剛就任總統的神父來說，他要麵臨的將是一道又一道令人頭疼的難題。
由於是文人政府，阿裏斯蒂德尤其擔心能否得到軍隊的支持，軍人是否支持政府是政權穩固的一個關鍵因素。從當時海地的情況來看，武裝部隊司令亞伯拉罕將軍不像以往的軍隊首腦對權力充滿野心，相反，他十分支持文人政府，而且在幾次政變中都對民選政府提供了很多的支持。他曾明確表示軍隊不應該幹涉政治，應該做職業軍人。但是海地軍隊素有參與政治的傳統，那些野心勃勃的軍人會聽從亞伯拉罕的話，乖乖做一個軍人麼？這一問題是亞伯拉罕擔心的，也是阿裏斯蒂德所擔心的。
阿裏斯蒂德是一個神職人員，從來沒摸過槍，在軍隊中沒有任何特殊關係。更為重要的是，在海地這個擁有軍人參政傳統且又缺乏民主意識的國家裏，軍人是不會輕易服從文人政府的。既要穩定政局防止軍人幹政，又要利用軍隊，阿裏斯蒂德想來想去隻有一個辦法，那就是改組軍隊。
雖然杜瓦利埃流亡國外，但餘黨還在，並掌握著部分兵權。為此，阿裏斯蒂德辭退了8名高級將領中的6名，同時又提拔重用了一些主張民主的年輕軍官取而代之，其中便有42歲的塞德拉斯，他被委任為海地武裝部隊臨時司令。阿裏斯蒂德希望這些年輕軍人能支持文人政府的民主改革，成為民主政治和新政府的保護神。
除此之外，海地窘迫的經濟狀況也是阿裏斯蒂德要麵對的難題之一。
海地長期處在獨裁統治之下，國民經濟幾近崩潰，民不聊生。1990年，海地的國民生產總值下降了1%，人民生活困苦不堪。如果新政府沒有恢複經濟的良策，恐怕還會引起海地民眾的不滿，到時一些反對派、杜瓦利埃餘黨、軍隊中的野心家必然不會放過這一機會推翻新政府。
說到反對派就不得不說說阿裏斯蒂德擔心的另一個問題，就是新政府成立後，海地各黨派能否同心協力共同治理海地。
雖然海地的各政黨在推翻杜瓦利埃獨裁統治上取得了一致，但會不會在取得勝利之後為爭奪權力發生內訌還是一個未知數。坦白說，阿裏斯蒂埃毫無治國經驗，在海地這樣一個政局動蕩的國家裏，沒有一個鐵腕人物坐鎮恐怕是難以駕馭混亂的局麵的。
自阿裏斯蒂德當選總統後，海地國內暴力事件不斷，針對總統的行刺、暗殺活動層出不窮。為了保障總統的人身安全，阿裏斯蒂德沒有完全聽命於武裝部隊安排的警衛，而是不惜花重金從瑞士請人專門組建和訓練總統私人衛隊。這支衛隊由曾作為殖民者壓迫海地人民的法國人組成，裝備精良、訓練有素，直接受總統指揮。
然而，不久之後，這支總統衛隊成員成了塞德拉斯政變的借口，他說阿裏斯蒂德利用曾殖民統治過海地的殖民者保護自己，是不念國恥的行為。阿裏斯蒂德也沒有想到自己一手提拔的塞德拉斯會成為領兵謀反的人。在悔恨的歎息聲中，剛剛當選總統8個月的阿裏斯蒂德被迫放棄總統職位，開始了流亡生涯。