順治死後，一種傳言不脛而走：順治帝沒有死，他是遁入五台山，祝發為僧了。這便是清初四大疑案之一的“順治出家”。人們懷疑順治出家未死的根據，除了文人雅士揣摸順治意願、在詩文中做出的種種暗示（如吳偉業《清涼山讚佛詩》屢點“董”字，暗示董妃之死與清涼山佛的關係，並有“回首長安城，緇素慘不歡。房星竟未動，天降白玉棺”句，“回首長安城”兩句說順治幸清涼山不返，削發披緇皈依佛門後，回首帝京往事，淒惻慘然，而“房星竟未動”兩句則說，朝中雖以大喪告，然“帝實未崩也”）之外，最重要的是康熙曾經四次去五台山。
這是史實。一次是在康熙二十二年（1683年）秋，康熙侍奉祖母孝莊文皇後前行。當時孝莊文皇後已有七十一歲的高齡。山嶺峻絕，康熙親自下馬扶輦。路數折不可上，孝莊文皇後遂還，但仍命他代禮諸寺。
又雲，康熙每幸五台山，總要摒退隨從，獨登高峰。他最後一次謁五台，留下了一首詩：又到清涼境，岩卷複垂。勞心愧自省，瘦骨久鳴悲。膏雨隨時節，寒霜惜大時。文殊色相在，惟願鬼神知。
言詞極其悵惘哀痛。人們由此猜測，康熙是去五台山看望他的父親順治帝。而這最後的一次，順治已經過世了。
然而有人考證，順治確係於順治十八年（1661年）正月初七死於天花。正月初二那天，順治命他最寵信的太監吳良輔去憫忠寺（今北京廣安門外法源寺）祝發（剃頭），舉行代他出家的儀式。他本人也親臨觀禮，回來後略感不適，初四，沒有上朝。初五，宮中各殿楹聯門神盡撤。初七晚，朝中下令大赦，並傳諭民間勿炒豆，勿燃燈，勿潑水（這是當時崇拜“痘疹娘娘”的風俗）。群臣這才知道順治染上了天花。
王熙《王文靖集·自撰年譜》也記載，當時他奉詔入養心殿，順治親口對他講：“朕患痘，勢將不起。”
初七日，宮中傳喪。順治之喪，經茆溪森禪師舉火焚化入葬。事見《五燈全書》。那麼，康熙四幸五台山做何解釋呢？
應該說，康熙去五台山，雖不能作為順治出家的根據，但確實與其父順治有很大關係。董鄂妃之死，使順治萬念俱灰。董鄂妃哀怨淒婉的聲音總在他耳旁縈繞：“一口氣不來，向何處安身立命？”“一口氣不來，向何處安身立命？”
……順治落了發，決意效法如來、達摩棄國出家，隻是在著名禪師玉林的勸導下，才暫時放棄了出家的念頭。為了製止順治再次萌發出家之念，玉林除了安排吳良輔作為順治出家的替身外，還特意安排順治去五台山——中國佛教徒心目中釋迦牟尼居住說法的靈鷲山——進香朝佛。就在五台山之行指日可待時，順治撒手人寰。
順治帝發喪之日，眾人“仰見皇太後黑素袍，禦乾清門台基上，南麵扶石欄立，哭甚哀”。龍鳳文化碰撞中犧牲的，畢竟是她自己親生的兒子。
灰飛煙散，何處尋覓兒子的孤魂？母親最知道兒子的心，隻有五台山，隻有浸透兒子血淚的五台山。
康熙侍奉祖母或遵祖母之命，四上五台山。他摒退侍從，獨自登上高峰，不單單肩荷著一顆滴著血淚的母親的心，而且懷著自坐龍庭以來（或許由於處境相似）對父親與日俱增的同情理解和深深的思念。五台山最高峰——海拔3058米的葉鬥峰的背麵，是四季不化的萬年冰雪。五台山菩薩頂，頂下環繞著檀林寶刹、法駕黃雲。想順治棄天下如敝屣，披緇合十，趺坐於寂寥山阿、漫漫雲海之上。頂上是晴空萬裏，陽光和煦，腳下是雷鳴電閃，雲滾雨急，他的內心猶如深潭，麵容似喜似悲，靜靜聽著山上塔簷殿角清越悠長的風鐸之聲，冷冷地望著山下如條條黃龍蜿蜒急下的澗水山洪……麵對父親的亡靈，康熙心中激起了什麼樣的反應，他在想些什麼，訴說著什麼呢？
康熙二十二年九月，康熙最後一次謁五台山時，剛剛平定了三藩，收複了台灣。戰爭中局勢出人意料的變幻，迫使康熙反複思索過他是“龍”，還是“鳳”的問題。
他終於清醒。清醒，有時是一種莫大的痛楚。麵對父親的亡靈，康熙反複吟誦：“又到清涼境，巉岩卷複垂……”那何嚐不是對自己艱難思緒的歸納與總結？何嚐不是對自己痛楚的抒發與傾訴？他隻能麵對父親的亡靈，因為除了父親，再沒有人可能理解他——一個穩坐龍庭的勝利者——的痛楚。康熙的祖母孝莊文皇後，則是清初四大疑案中另一個疑案——“太後下嫁”的主角。孝莊文皇後下嫁多爾袞，正史並無記載，迄今也並沒有發現諸如“下嫁詔書”之類的鐵證，其根據主要有以下幾點：一、皇父之稱。多爾袞始為攝政王，入關後加叔父攝政王，後又加皇叔父攝政王，順治五年冬至祀天之時，再加皇父攝政王。自此，試策、本章、旨意，都改稱皇父。多爾袞死時被尊為“懋德修道廣業定功安民立政誠敬義皇帝”，廟號“成宗”，翌年奉於太廟。
多爾袞既為皇父，身為聖母的孝莊文皇後顯然是同他結合了。於是有這樣的傳說，多爾袞授意大臣範文程在朝上雲：“攝政王雖為皇叔父，實乃以帝位讓上，猶父傳子也。上亦應以父視王，然否？”群臣道：“然。”“今聞王新悼亡，而我皇太後又寡居無偶。皇上即視王若父，不可使父母異居，宜請王與太後同宮。”臣道：“可。”太後遂下嫁攝政王。並有恩詔謄黃頒示天下，其略曰：太後盛年寡居，春花秋月，悄然不怡。朕貴為天子，以天下養，乃獨能養口體，而不能養誌，使聖母以喪偶之故，日在愁煩抑鬱之中，其何以教天下之孝？皇父攝政王現方鰥居，其身份容貌皆為中國第一等人。太後頗願紆尊下嫁，朕仰體慈懷，敬謹遵行，一應典禮著所司預辦。