孔子生活的時代，周室衰微，詩書缺，禮樂廢，因此，他的晚年除了教育弟子外，就利用空暇時間整理古時候的詩書。他將西周初年至春秋中葉500多年的詩歌305篇整理成冊，並按用途和音樂分為“風、雅、頌”三個部分，這就是今天我們看到的《詩經》。
孔子晚年時，尤其喜歡《易經》，簡直愛不釋手，每天都要翻閱。《易經》相傳是伏羲與周文王根據《河圖》《洛書》演繹並加以總結概括而來，是我國最古老的占卜術原著，其中蘊涵了很多自然哲學與倫理實踐的問題。
孔子曾歎息著說：“假如老天爺再讓我多活幾年就好了，我可以仔細地研究《易經》，這樣死後也就不會有什麼遺憾了！”孔子後來對《易經》裏關於人生哲理的內容有很多闡發，所以有一種說法：流傳後世的《易經》是伏羲、文王、孔子所作，即伏羲製卦、文王係辭、孔子作十翼。所謂“十翼”，就是孔子對《易經》的闡釋，這些流傳後世，使得《易經》由卜筮的書籍變成了包含深遠哲理的書籍。後來，秦始皇“焚書坑儒”，儒家經典幾乎被焚毀殆盡。由於《易經》被認為是卜筮的書，因而得以保存下來，未曾遭受祝融的厄運。
孔子除了整理《詩經》、闡釋《易經》外，還著力研究周朝的禮樂。詩書禮樂就是孔子教授弟子的主要內容。孔子自杏壇講學以來，先後教授的弟子共達3000人，其中身通六藝者72人，被稱為“孔門七十二賢”，顏回、子路等都名列其中。
孔子對禮樂有著執著不懈的追求，也有著很獨到的見解。他曾經和魯國的樂官談論樂的問題。孔子說：“音樂的演奏，其擎音節奏的全部過程是可以知道的。一開始，各種樂器一起演奏，接著放開音量，清濁高下立現，卻又互相和諧，宮是宮，商是商，不相混亂而節奏分明地連續不絕，直到一支樂曲終了。”
除了學問的積累，孔子還很注重人格修養。他經過長時期的磨煉，已經成為當代的聖人。孔子在與自己的鄉裏人相處時，態度溫和恭順，一副老實不愛說話的樣子。但在宗廟裏或朝堂上，需要講究禮法或決定政事的時候，孔子則詳詳細細地問、明明白白地解說，絲毫都不含糊。不過，這時候孔子的發言也總是很謹慎。
孔子在朝廷上和品階低一點的下大夫交談時，態度和藹而剛直；和品階相對較高的上大夫交談時，中正適度，和顏悅色中帶著不可侵犯的樣子。當國君臨朝時，他則恭恭敬敬，威儀適當而合乎禮儀。
日常生活中的孔子，對飲食要求得很精細，所謂“食不厭精，膾不厭細”。米飯是養生的必需品，最好精致而白皙；魚和肉類最好切得小一些、細一些，因為切得太大，難以咀嚼，不合衛生。飯太熱、太濕的時候，不吃；魚肉變味了或腐敗了，不吃；食物的顏色跟平常不一樣，不吃；食物有怪味惡臭，不吃；烹調失宜、不生不熟的食物，不吃；不是三餐正常的時間，不吃；街上買來的現成的酒菜，可能不衛生、不幹淨，不吃。即便飯桌上肉類很多，也不能食用超過平時的量。喝酒雖沒有定量，但不能喝醉。不管吃任何東西，都保持定量，絕不多食。薑能除穢惡、驅風寒，所以要經常備著，飯後也不撤去。
祭祀後，分配到的肉，要馬上分送給別人，不能留到隔宿，因為會腐敗，有礙健康。
孔子在吃飯的時候，絕不說話，必須保持肅靜；睡覺的時候，也是如此。
雖然有時候吃的是粗飯、菜湯，孔子也會先拿出一部分祭祀先人，而且態度恭敬嚴肅。
如果遇到朋友不幸死亡，沒有家屬親人料理喪葬事宜時，孔子就會主動地負起殯葬的責任。
朋友有所饋贈時，除非是祭肉，否則即使是貴重的車馬，孔子也絕不拜受。不接受禮贈是孔子剛直的表現，獨獨可以接受祭肉，則是因為這表示敬重朋友的祖先。
孔子睡覺時，不挺直四肢仰臥，因為他覺得這樣的姿勢像屍體。
孔子平時在家裏時，儀容整潔，卻從不故意裝出肅穆的樣子，態度上也很隨和。