在李開複組建微軟中國研究院的日子裏，他也將更多的時間和精力用在對夥伴的提升上。
“就像眾多的學者一樣，我熱愛的是做基礎研究，我多年的夢想就是擁有一個環境，能讓我和一些才華出眾的人在一起，發明突破性的科技，造福世界上數以億計的電腦用戶。今天，我擁有了實現自己夢想的機會。身為微軟中國研究院院長，我的新使命是提供一個獨一無二的研究環境，和有同樣夢想的人合作，共創人類計算的未來。”
這是李開複在《從基礎研究說起》中的一段話。文章發表的時間是1998年10月，此時的微軟研究院尚未正式掛牌，而李開複已經對未來做好了安排。
毫無疑問，在人才招募方麵，李開複是成功的。即便在2005年他與微軟對簿公堂，微軟取笑李開複是“最昂貴的人力資源經理”，但這事實上仍然折射出一個事實，那就是：在為中國研究院招攬人才的工作中，李開複取得的成果遠遠超出了微軟的想象。而現在，隨著他尋找的那些“有同樣夢想的人”的一一到位，他的工作精力也從招募人才慢慢地轉移到了如何為這些人實現他們的夢想上。
李開複在研究院成立後的一年中為60位研究人員花了1240萬元去購置設備，人均超過20萬元，大約10倍於中國科研人員的年均經費——包括設備、基建、日常消耗、工資、福利和獎金。在辦公室的布置上，李開複也頗費心思。
這並不是如李開複所說的為他的員工提供的“獨一無二的研究環境”的全部。研究環境有兩種：一種是硬件的，例如以上列舉的辦公室；另一種是軟件的，例如說工作的氛圍、研究人員可得到的支持，等等。李開複所強調的“獨一無二的研究環境”，更多的是從軟件方麵入手。
所謂“軟件”，更多的是在思想上找問題。學貫中西的李開複很清楚東方文化和西方文化的優缺點，他認為，中國人是聰明的，但是長期以來的一些思想，如官本位、層級觀念等，都極大地影響到了他同事們的更好的發揮。這也難怪，那麼多年來，這些同事都是在一種“完成領導交代的任務”的指導下學習和工作的，又怎麼能夠指望他們能一下子就改過來呢？
李開複的經驗告訴他，解決這個問題的方法就是讓東西方兩種文化碰撞，讓同事們有機會換一種方式思考。他將微軟所倡導的“自由的、真誠的、平等的文化”複製到了中國，用於指導研究院的工作，給予研究院每一位成員最大的空間，讓他們做自己想做的事，說自己想說的話。
李開複對“自由的、真誠的、平等的文化”的理解是這樣的：