綾雪被那個和她長相相似的女人注射不知名藥物(藥物實為女人自己研發的),三天如果不道出雪莉的下落便會因未得到解藥而死亡。與此同時,綾雪用手表型通話器聯係上新一,告訴他們蘭德處境。這時組織已經開始行動了,田中市原並未被捕,而是中途逃走,他也曾是組織的一員,實為朗姆酒(渡邊久寺)同父異母的弟弟,卻因為朗姆酒行動失敗後被組織滅口而懷恨在心,最終被判組織,逃亡中找到貌似綾雪的女人的秘密,欲與其交換,卻被信發現交易導致信身體縮小。
貝爾摩德曾有一個妹妹,卻被組織所殺。貝爾摩德為此加入組織,隻為能有一天親自為妹妹報仇。真正的boss被貝爾摩德殺死,貝爾摩德早已倒戈,利用boss告知琴酒不讓他動蘭和綾雪。卻被琴酒懷疑。順便一提,貝爾摩德之所以處處護著綾雪,是因為她妹妹的關係。初次見麵的櫻樹下,綾雪畫畫的場景勾起貝爾摩德的回憶——以前她的妹妹也曾坐在櫻樹下畫畫,並為她畫過肖像。於是貝爾摩德才想讓綾雪為她畫一副肖像。
由於特快列車上的遭遇,琴酒已開始懷疑基德摻入其中。那封來自琴酒的信件裏,已經點明他們知道了基德的參與。蘭無意中得知柯南就是新一這件事的真相,卻並沒有埋怨新一。在蘭以為快要死了的時候,麵對新一,微笑著含著淚說她從未怨過他。後被急忙趕來的貝爾摩德救下。
貝爾摩德把解藥交給信,在綾雪醒來的時候對其道出真相,從此消失。她並沒有尋短見,而是帶著妹妹的遺願——去看海,看世界,而自由的前進。對貝爾摩德而言,妹妹的眼睛和靈魂一直寄宿在她心裏,並未離開消失。
故事,進入尾聲..