由於美軍反潛兵力雄厚，警戒嚴密，日本海軍在衝繩海域活動的11艘潛艇未獲任何戰果，反被擊沉8艘。至此，日本海軍對衝繩島守軍的支援均告失利。
4.日本軍瘋狂虐殺國民
日本第32軍往喜武半島撤退的時候，野戰醫院處理傷員的暴行令人毛骨悚然。
位於豐見城的日軍野戰醫院在6月初接到撤退的命令。命令要求還能夠走動的傷員一律隨軍撤退，剩下的一律自殺或殺掉，不能投降當俘虜。軍令如山，必須無條件服從，有的傷兵強忍疼痛堅持自己走出去。最後剩下七八十人，實在不能動彈，隻好就地斃命。
衛生員對他們說，自殺的辦法有3種：手榴彈自爆、氰化鉀注射、槍殺，希望每個人提出自己的意見。有50多人希望注射藥針；有16人希望用手榴彈自爆；還有身體嚴重傷殘完全不能動彈的人，要求把他們抬到外邊，吸一口新鮮空氣以後再槍殺。
希望注射氰化鉀的人，頭部向北，並排躺在一起。大型注射器中抽滿了氰化鉀毒液，當室外殺死傷兵的槍聲響起來的時候，便依次把毒液注射到傷兵的靜脈中去。這些人相繼寂靜地停止了呼吸。然後是手榴彈的爆炸聲。
據“衝繩戰役回憶會”編輯的《衝繩戰和和平教育》一書所載，這樣處置的重傷兵共計約有1萬人。
衝繩島戰役不僅日軍官兵傷亡慘重，那些被強迫入伍的學生兵更是苦不堪言，無謂地做了炮灰。
據戰後統計，衝繩縣縣立一中強製征兵600名，死266名；縣立二中征兵248人，死165名；縣立工業學校征兵130名，死106名；縣立農村學校征兵170名，死66名；縣立水產學校征兵45名，死28名；那霸市立商業學校征兵115名，死92名；私立開南中學征兵81名，死70名。才十幾年的生命就白白斷送了。
當時被征集的學生兵大田昌秀僥幸未死，戰後在他所著的《鐵血勤皇隊》一書中，把學生遭受到的苦難如實地記述了下來。這些十幾歲的學生，既被征兵，卻又享受不到正規兵的待遇，飽受欺淩。從他寫的文章中可以看到日本兵殘暴的程度：
美機在天空盤旋著，我立刻跳到道路左下方去，看見一條橫向地壕。入口處有一個簡單的土牆，是防暴風用的，一看就知道是老百姓挖的防空壕。我繞過土牆正要躲避空襲時，一支槍口對準我的胸膛：“這不行！這個混蛋，誰讓你進去的？你沒有看見這個嗎？出來！這個討厭的學生！”一邊申斥，一邊又接著罵：“什麼東西！這算皇軍士兵嗎？算神兵嗎”他正罵著的時候，“嗒、嗒、嗒……”像割竹子那樣脆響的飛機掃射聲連成一片。旁邊沒有一點可藏身的東西，我不由自主地又朝地壕入口處移動了一步。那位士兵又吼道：“你這小子什麼也不懂嗎？再亂跑我就不饒你了！你沒有看見那邊滾的東西嗎？”我向槍口指的方向一看，前方四五米遠的山芋地裏，一位老人仰身躺著，焦黑的衣服剝落，裸著胸膛，屁股、大腿旁邊浸滿渾濁紫黑的血。一看到這情景，我胸中滿腔的憤怒消散開來。“還有這樣的事？不不，不會的。”我努力想排去腦中的疑惑，搖晃著腦袋。可是，事實確實是那樣，現實是無情的，我的頭發昏、發脹起來。“你這小子，沒有看見那裏滾動的東西嗎？學生，你這個東西！”那個士兵警告、訓斥的語調我走到哪裏也無法忘掉，腦子裏充滿不安和疑惑……
衝繩的女學生們都在接受了護士速成訓練後被派到野戰醫院去服務。其中衝繩師範學校有187名女生加入到姬百合部隊，死去117名名；縣立第一女中的98名學生中有86名死在姬百合部隊；縣立第二女高中（護蘭部隊）10名學生中死1名；縣立首裏女高中（水仙部隊）83名學生中死50名；私立積德女高中（積德部隊）57名學生中死50名；私立昭和女高中(梯梧部隊)67名學生中死54名。這些青年女學生被軍國主義惡魔無情地剝奪了青春和生命。
衝繩戰役中，日軍對當地老百姓的虐待和暴行更是令人發指。