當然這種種的猜測隻能止步於此，直至我們發掘秦始皇陵，揭開這位皇帝的棺槨之時，才能得到解答。以上這些謎團隻是秦陵地宮眾多謎團之冰山一角。我們對地宮的眾多了解還隻是建立於猜想和勘測，相信這一係列的謎團和疑雲將會在未來揭開。
徐福東渡日本留下了多少謎團？
公元前 219年，秦始皇東巡到了山東沿海的琅玡（今諸城東南），齊人徐福與一些人士上書秦始皇，聲稱海中有三座神山，請求秦始皇派童男童女和他一起去求長生不老藥。秦始皇聽信了他的話，派數千童男童女乘船隨他出航。經過幾年，花去了許多費用，並沒有得到神藥。公元前 210年，秦始皇再次巡幸琅玡時，徐福恐怕受到責備，便編造謊言，說是求神藥由於海中有大鮫魚，受到阻難，一定要派善於使用連弩的射手去才能排除困難。據徐福東渡後 20年出生的伍被和淮南王劉安的對話中透露，這次秦始皇又派徐福率童男童女 3000人，裝載五穀種子、技藝百工下海。徐福的這次東渡一去無影蹤，留給了後人種種謎團。
首先是，徐福東渡的真正原因是什麼？據《史記》所言，秦始皇支持徐福東渡，是為了尋神山仙藥，求長生不死藥。但也有人認為徐福東渡不僅寄托了秦始皇長生不老的理想，還有負責開拓疆土的含義。《呂氏春秋·為欲篇》指出了秦國統治者的理想：“北至大夏，南至北戶，西至三危，東至扶木，不敢亂矣。 ”“扶木”就是“扶桑”，即後來所說的日本。秦始皇一再派徐福等入海尋找三神山，絕不是單純為了采神藥，而是為了把東方疆土開拓至日本。
秦始皇統一天下隻有 12年的時間，但是 4次到東方沿海巡視，這說明他對東方諸島的極大關注。有的學者說：“始皇東巡的根本目的在於實現東至扶木的理想，而徐福探海東渡正是實現始皇理想宏願的具體行動。”秦始皇曾在琅玡刻石中說：“普天之下，摶心揖誌。器械一量，同書文字。日月所照，舟輿所載。皆終其命，莫不得意。”又說：“西涉流沙，南盡北戶。東有東海，北過大夏，人跡所至，無不臣者。”從中可以看出，秦始皇早有吞並日本之意，徐福東渡，或許正與此有關。
徐福東渡到了哪裏也是眾多史學家爭論之處？有人說那時航海技術落後，碰到大風浪，全部覆沒。而史籍中最早記載徐福史事的是司馬遷，可是沒有講明徐福浮海到了何處。後人以為是台灣島或琉球群島，也有說是美洲，但大多數認為是日本。
據《史記·淮南衡山列傳》中的記載：“徐福得平原廣澤，止王不來。”可以推測徐福登陸地是一平原。日本列島符合這一特征，除日本列島外，其他島嶼沒有“平原廣澤”的地理特征。另外，徐福東渡日本，在後世的史書資料中也有記載。在《三國誌·吳書·吳主傳》中記載：“長老傳言秦始皇遣方士徐福將童男女數千人入海，求蓬萊神山及仙藥，止此洲不還。 ”《後漢書》中，把徐福入海求仙事件附在倭國之後。五代時期義楚和尚所寫《義楚六帖》中提到：“日本亦名倭國，在東海中，秦時，徐福將五百童男、五百童女止此國。”宋代文學家、史學家歐陽修也認為徐福東渡到日本，明初，日本和尚空海到南京，向明太祖獻詩，提“熊野峰前徐福祠”。清末駐日公使黎庶昌、黃遵憲等人，都參觀了徐福墓，並作詩文題記。在日本學術界，也有不少史
料記述徐福到日本的情況，有《神皇正統記》、《林羅山文集》、《異稱日本傳》、《同文通考》等文獻。
在日本民間，徐福被尊稱為農神、蠶桑神、醫藥神。還有一些日本人認為自己是徐福的後裔，他們的根據是：在日語中，秦與羽田的發音相同。日本前首相羽田孜就稱自己是徐福的後裔。他說：“我是秦人的後裔，我的姓在很早以前寫作‘秦’，我當首相時，考古學家和曆史學家對我的家族進行了調查，並在祖墓碑上發現了‘秦’字。”
然而，也有些學者認為，徐福東渡並不是到了日本而是美洲。在隋唐時期，日本與中國交往極為頻繁，但在文獻之中卻罕見“徐福”二字。而日本古文獻中載有徐福傳說者以《神皇正統記》（1339年）為最早，這是受了宋元以來中國文獻的影響。因為徐福東渡的時間與美洲瑪雅文明的興起相吻合。在哥倫布發現美洲之前，已有多位中國人到過美洲，故徐福後來東渡美洲很有可能。吳人《外國圖》指出“洲去琅玡萬裏”，根據距離分析根本不是日本，而是美洲。最早記述倭國的《後漢書》是把亶洲與日本區別開來的。“亶”字有大島的含義，美洲大陸像“亶”字，故以字形命名。現在檀香山還遺有帶有中國篆書刻字的方形岩石，舊金山附