導致人類疾病的因素有兩大類，即自然因素和社會因素。兩者都甚為複雜。而運氣氣化因素則堪稱各種自然界因素中的最大也是最複雜的致因。運氣病因的最高階段是內六淫，內六淫是外六淫的發展，也是氣化外因與髒腑內因相矛盾的焦點。
第一節運氣對發病的重大影響
風寒暑濕燥火六氣大自然的造化，既是萬物生化之源，又是百病變生之因。正如《素問·至真要大論篇》所說：
夫百病之生也，皆生於風寒暑濕燥火，以之化之交也。
盡管運氣對發病的影響甚為複雜，但仍能概括為以下幾方麵：
一、大運太過不及與發病的關係
大運太過年則本氣偏勝，往往成為勝氣，本氣偏亢所髖（被克）之氣受舷，所不勝之氣也可能被侮，如壬午年，木運太過風氣流行，脾病生焉。可能易患肝氣太過及脾運不及之病。如《素問，氣交變大論篇》說：
歲木太過，風氣流行，牌主受鄂，民病飧泄食減，體重煩冤，腸鳴腹支滿……。
反之，大運不及年，則本氣偏弱，往往易被所不勝所克伐或被所勝之氣反侮。如歲木不及之年，本氣不化，則克氣盛行。如下卵年，木氣不足，金氣未克，則多病肺肝，和與之相表裏的膽、大腸病。
大運太過不及引起的發病至少涉及本氣及所勝，所不勝三個髒腑，嚴重時還可涉及所生受病則可影響至五個髒腑。
即時令未到而氣候先翻，屬於氣運太過。則乘侮所不勝而克伐所勝，這種情況稱為氣淫。反之，時令已到而氣候未到，叫做不及，則所勝之氣反而妄行，所不勝之氣乘弱克之，所生的髒氣因不能得氣而受病。亦如《寨問·五運行大論篇》所日：“氣有餘。則製已所勝，褥侮所不勝；其不及，則己所不勝，侮而乘之，已所勝輕而之，……”其理一致。
二、司天在泉與發病的關係
罰天在泉之氣，。如成為淫氣，（不正常的勝氣），則司天勝氣主上半年發病，而在象勝氣則影響下半年發病。其餘左右間氣對人體也分別具有一定的影響，除表現為和本氣相應的髒腑受病外，還出現與被克之氣的髒腑相應的病症。
可見陽明燥淫過勝之時，人體出現的燥症。但在泉淫氣主要危害下半年時期。
運氣同化與發病的關係
運氣同化年，如天符、太乙天符、歲會、同天符、同歲會年。由於運與氣同化，氣易於偏勝，因此容易導致勝氣。相應的髒腑更易致病。如甲最年，大運為生運太過，歲支五行屬性屬土，在泉之氣也為土，此為同天符加歲會年，故全年濕氣偏盛多病脾病及被勝氣所克的病——腎病（土克水）。民病多見濕泄、腫墜，甚者可致腎陽虛或其他陰寒病。
五、運氣異化與發病的關係
運氣異化指運氣相臨時不存在同氣而是生克關係，其與發病的關係是：
運生氣一小逆氣生運一順億
運克氣一不和氣克運一天刑
如庚辰年，運為金運，氣為辰戌太陽寒水司天。金生水屬運生氣，運盛氣衰是為“小逆”，氣候不相得，其變化為金運（燥氣）偏勝，肺病發病機會偏多。
再如已巳年，大運為土運不及，司天之氣為木。則屬氣克運、氣盛運衰的“天刑”年，氣候反而變為風術主化，則脾土易受病。
又如丙午年大運為水運太過，司天之氣為火，歲支之氣也為火。水克火，屬運克氣，運盛氣衰，乃“不和”之候，剛全年氣候可能為心與小腸易罹病。