運氣氣化病機是中醫病機學中的最高層次，運氣氣化病機的重大意義在於揭示了運氣氣化與髒腑氣化之間的矛盾所導致的病理，開辟了病機學的新領域。
第一節運氣氣化病機及其主要觀點
運氣病機是運氣學說的重要精髓，其特點是突出了六氣氣化在病機中的重要意義。
六氣病機，即指氣化異常與疾病發生發展的關係。
一、運氣氣化病機的主要觀點
（一）歲主藏害——六淫病機的提出
《素問·至真要大論篇》說：“歲主藏害”，即言自然界五運六氣都影響著人體，如果氣候變化太過超過人體的適應限度，則能導致疾病的發生，此即所謂“歲主藏害’：，即言運氣太過不及，勝複淫治對人體髒器皆能有所損害。
（二）以所臨藏位命其病——疾病定位定性的提出
《素問·至真要大論篇》：“以所臨藏位命其病，”以及《素問·六節藏象論篇》“各以氣命其藏”皆說明了偏勝的六氣對人體髒腑都有相應的影響，並決定著疾病的定位和定性。如《素問·至真要大論篇》的病機十九條，則根據穴淫對髒器的影響具體地提出了五髒定位和六氣定性，為後世辨證論治奠定了基礎。如“諸風掉眩，皆屬於肝”，“諸寒收引，皆屬於腎”“諸氣胺鬱，皆屬於肺”，“諸濕腫滿，皆屬於脾”，屬於六氣與人體髒腑定位的條文。“諸病水液，澄澈清冷，皆屬於寒。“諸痙項強，皆屬於濕”則又屬於疾病定性的條文。總之，運氣七篇病機十九條根據六氣氣化與人體關係的理論作了疾病定性定位的劃分，為後世六淫病機定位定性的規定奠定了基礎。
“審察病機，無失氣宜”——氣化病機的準則
《素問·至真要大論篇》說：“審察病機，無失氣宜”，是氣化病機的綱領，所謂氣宜，即“百病之生也，皆生於風寒暑濕燥火，氣化誌變也。”即言審察病機時，一定要注意考慮六淫因素，查看氣化有元勝複鬱發之變，後世醫家對此作了許多發揮，如：
金元·劉河間把十九條分別以五運六氣歸類，強調了六氣病機的“亢極之化”，提出“亢過極，則反兼勝已之化”觀點，真正掌握了十九條的真諦。
明·張景嶽對病機十九條的分析也充分貫穿了運氣氣化的理論，如把運氣中的司天，在泉、勝、複、太過，不及對髒腑虛蜜的影響，皆詳盡加以論述。如曰：“凡淫勝在我者，我之實也，實者真邪也。反勝在彼者，我之虛也，虛者假邪也。此六氣之虛實，群所謂有無也。”
因此，審察“氣宜”，即在病機分析過程中首先要審察是否屬於六氣氣化異常所導致，這是氣化病機的關鍵。也是審察病機的準則。
二、“求其屬"——運氣病機分析的最高境界
求其屬即尋求病機的具體歸屬，病機總分為六淫氣化病機及非六淫氣化病機兩大類。《素問·至真要大論篇：》對這兩大類病機的審察進行了綱領性的闡述，即：
（一）六淫氣化病機
1第一步：“有者求之，無者求之”區分六淫氣化病機及非六淫氣化病機的分水嶺學說。
運氣要求分析病機，首先要區分是六淫氣化病機還是內體髒腑失調（即非六淫病機），如果沒有六淫病機，第二步才分析髒腑內部因素。《素問·至真要大論篇》用“有者求之”、“無者求之”，來概括，此即“求其屬”。《素問·至真要大論篇》的“求其屬”這一審察病機的準則使分析病機達到了一個更高的層次，打破了以往分析病機偏重於髒腑內部的局限。《素問·至真要大論篇》強調分析病機首先“審察氣宜”，這是病機分析的最高境界。擴大病機分析的領域，強調了人體病機與自然界氣化異常的關係，具有重大意義。
2．第二步：“甚者責之，虛者責之”分析髒氣盛衰的生克規律
即根據髒氣存在的偏勝偏衰狀況，分析是單一的髒氣之偏，還是存在著生克乘侮的影響，從而審察是否為氣淫所致。六淫氣化病機的特點是很少局限於某一髒器，而往往是引起相關的幾個髒腑的連鎖反映。有生克乘侮關係之間髒氣的或同時存在此強彼弱，或先後繼出此盛彼衰的情況。如是，則應考慮是否為六淫氣化勝複鬱發變氣的影響，此即“甚者責之，虛者責之”的真諦所在。