陸上體能訓練期為6周，海上體能訓練期為3周學員。大部份時間不停的長跑、基本體能運動、穿越繩網、木板、鐵絲網陣各式各樣的障礙物、枕木、在沙灘上做翻滾動作、在冰冷的海中遊泳與潛泳、水中上落橡皮艇、劃艇、海岸滲透偵察和水中求生訓練等；其中第5周稱為「地獄周」訓練；學員們整個為期5天的體能測試中，將會不斷進行各項體能活動，學員每天平均隻能睡20分鍾，經過3至4天不眠不休的體力消耗後，教官會叫學員好好的座下，寫一編「我為何要成為海豹特遣隊的一員！」的文章，。最後一項被海豹隊員稱為「環球大巡航」的橡皮艇航程訓練，學員們托著橡皮艇跑到基地大門前，通過大門再跑到2公裏外的沼澤地，在那裏下水劃過諾福克港區，再沿著渡輪的航道劃向港外的查沙畢克灣，劃到指定距離後，再順著水流的方向劃向聖地亞哥的灘頭，搶灘後再頂起橡皮艇從沙灘跑回基地，這樣連劃帶跑，總共16海浬的航程加上約5公裏的路程，完成後方可通過地獄周的訓煉，絕大部份被淘汰或放棄的學員都是受不了地獄周的嚴格考驗。通過「地獄周」的考驗後，學員便會接受水中爆破訓練及水中求生訓練（Drown-proofing），學員會被綁著手和腳，在泳池中不斷進行水中活動，在這個階段中，學員會被分為2人一小組的「遊泳拍擋」，此後的整個訓練過程中，都是以這個形式進行的；這樣做的目的在於培養隊員間的團隊精神及互相信任。水中偵察訓練並非隻在水中進行，還包括了岸邊的地區。
第2階段：
為期7周的第2階段訓練，訓練包括徒手潛水，使用水下呼吸器（scuba）、無氣泡式水下呼吸器（Dareger）、戰鬥導航板（Attack Board）水中導航技巧。並且利用停泊於港中的各種軍艦作為訓練目標，實習水中滲透，成為一個真正的戰鬥蛙人。
第3階段：
學員會在聖瑪斯島接受為期10周第3階段的訓練，內容包括爆破、偵察、陸上作戰、小隊戰術、各種武器操作、遊繩攀降、夜間戰鬥、長程偵察及巡邏、收集情報、傳統及電子通訊技巧、直升機滲透及撤退技巧；學員亦會學習如何利用爆藥清理灘頭，好讓後續部隊登陸的技巧；前5周為理論及基礎課程，最後4周會進行各種技巧的綜合訓練和實習，最後的5天學員要根據教官的指示完成各項實習任務；其中一項名為“求生、躲避、拯救及逃脫訓練”，學員在模擬實戰的環境，完成教官指示的任務。
學員完成BUD/S後，必需再進入海豹特擊隊或海豹運輸載具（SVD）部隊實習6個月包括
10周海豹運輸載具基本操作程序課程。
9周海豹運輸載具基本保養、維修課程。
6周特戰快艇（SWCC）作戰技巧課程。
2周海軍特戰司令部製定的特戰技巧課程。
3周潛水用具基本操作、保養、維修課程。
3周海岸作戰技巧（MAROPS）課程。
2周水底爆破技巧課程。
3周傘具基本操作、保養、維修課程。
3周日間、夜間、HALO跳傘訓練課程。
合格後，學員將獲頒發海豹特擊隊三叉徽章，成為海豹特擊隊隊員。
但事實上，海豹特擊隊平時就是不繼訓練再訓練，以確保全部隊員能保持在最佳狀態。其主要訓練為特戰技巧、特殊地型跳傘、海豹戰術訓練（STT）、反恐怖訓練（CT）、水中特戰運輸載具操作、另外負責狙擊手任務的隊員，還需要接受四星期學習裝訓練與精確射擊課程。
3、三角洲特種部隊模式
三角洲部隊號稱美軍中最神秘的特戰部隊，也是美軍中精銳的反恐部隊，但三角洲部隊從末被美畢軍官方所承認的一支特戰部隊。三角洲部隊前身可以說是一支在美陸軍中臨時組成的藍光反恐特戰部隊。這支部隊成員約有40人，成員主要為美軍第5特種作戰群。其後三角洲部隊組成，藍光反恐特戰部隊也解散。
1977年10月13日在索馬裏發生的摩加迪休恐怖分子劫持德航事件中，使美國政府有需要成立一支反恐部隊，而委任成立三角洲部隊的貝克威茲軍官是60年代英國皇家特種空勤隊（SAS）成員，三角洲部隊的入伍測試，亦以英國皇家特種空勤隊（SAS）的入伍測試作藍本。在1977年11月正式名為三角洲部隊。而三角洲部隊的入伍測試持續到1978年5月完成初期的入伍測試。當時共73名學員入選，其後進行19周的基本技術訓練。三角洲部隊駐防位於北卡羅來納州的布格堡；此地稱為圍場（The Ranch），主要訓練中心在莫特湖（Mott Lake）。
要成為三角洲隊員前，參加者必須為特戰部隊成員，要求視力單眼差別為20/40、20/70，不能色盲、參加者必須通過長達30天的基本體能測試及麵試測試，此入選試稱為信心課程。內容包括：
1分鍾內完成37次仰臥起坐
1分鍾內完成33掌上壓