原來馬鴻逵多年與日諜、漢奸勾勾搭搭，態度曖昧。1931年“九一八”事變後，日本帝國主義派遣大批間諜潛入綏遠各盟旗、寧夏和甘肅酒泉、武威等地，搜取情報，製造民族矛盾，為其侵占大西北作準備。1935年在阿拉善旗的定遠營和額濟納旗的東廟設立特務機關，建立電台，並在兩地開辟軍用機場，運送軍用物資的汽車、駱駝經常自綏遠百靈廟往來；並派兩個會華語的間諜持北平國民黨某機關發的旅行證來寧夏，馬派人在福慶樓宴請。同年夏，日本特務機關長江崎壽夫少將率間諜十幾人、漢奸四五十人，由百靈廟乘汽車到東廟；秋後又由百靈廟特務機關派出十餘人組成所謂經濟考察團，從綏遠乘汽車到寧夏，沿途測量地圖，拍攝照片，為所欲為。馬鴻逵本來關卡林立，戒備森嚴，但那都是對付老百姓和共產黨的，對此卻聽之任之，不加過問。而且馬鴻逵還在省府禮堂舉辦招待晚會，邀請到其私宅密談，助長了日諜凶焰。日諜以武力脅迫額旗旗長圖布森巴紮爾（稱圖王）從事間諜活動，其弟塔旺嘉布（稱塔王）則與日諜相勾結，將該旗保安隊交日諜驅使。日諜還散布傅作義失敗、日占領綏遠、駐酒泉的馬步康回軍要殺蒙民等謠言，近在咫尺的馬鴻逵對此不聞不問。1936年春，日本關東特務頭子板垣到定遠營秘密活動，並化裝乘從定遠營回來的汽車進入寧夏省城，秘密會見馬鴻逵。馬為掩人耳目，槍決了那個汽車司機。國民黨中央政府發覺日諜在阿旗的活動後，派鄭子獻為駐阿旗軍事專員，鄭對阿旗施加壓力，引起阿旗統治者的反感，馬則指責鄭子獻不善於撫綏蒙民，向蔣介石提出“治邊建議書”，主張采用清朝籠絡蒙古王公、活佛，以蒙治蒙的政策。同年冬，國民黨政府命令寧夏省民政廳長李翰園和駐防寧夏的二十五師副師長杜聿明前往額旗，勸令日諜撤離。李、杜二人向阿旗旗長達理劄雅要200條駱駝，欲取道沙漠到達東廟，日諜指使達理劄雅拒絕。李、杜又轉道綏遠，欲轉從二裏子河赴東廟，適西安事變發生，遂告中止。直到1937年3月，國民黨政府迫於人民要求，再催李翰園去額旗，馬鴻逵才派5個隨員、汽車1輛，送李到蘭州。李取道酒泉入額旗，破獲日本的特務機關，擒獲全部日諜，解送蘭州。在阿旗的日本間諜，由於國民黨政府一再電令馬鴻逵促其出境，馬才派其秘書長葉森赴定遠營與板垣交涉，盡管雙方爭執激烈，但日諜蠻橫拒絕，馬也沒有進一步措施，遂使這一問題僵持不下。馬鴻逵對待日諜也真夠客氣的了！
1937年五六月間，日本派遣以橫田中將為首的日諜3人、回族奸細七八人，以駱駝100餘隻，滿馱航空汽油從磴口北邊的巴音冒堵，經過定遠營、古魯乃、馬鬃山去安西設立特務機關，任務是與德國希特勒派出的間諜飛機在安西聯絡，建立德、日航空聯絡站，企圖切斷中蘇國際交通，包圍中國，進攻蘇聯和蒙古。日諜所經過的地方，如巴音冒堵附近，馬鴻逵駐有300多人的武裝緝私隊，定遠營駐有1個步兵團，馬並未采取任何措施，卻打電報給正在千裏外的東廟的李翰園，要李“相機處理”。李得信後，即去酒泉和駐軍馬步康商量，派部隊前往古魯乃，將橫田等全部截獲。但橫田一夥中有個回民阿訇，是馬步芳的親信，此人到酒泉後即失蹤，傳係被馬步康放走，李翰園要追查，馬步芳則大為不滿，並指示馬步康阻撓李翰園活動。後經國民黨西北行營副主任賀耀組主持協商，議定：李翰園不追問此阿訇逃走一事；所有在古魯乃繳獲武器、駱駝、物資交給馬步芳部隊；所獲無線電台、卡車、文件帶往蘭州；由西北行營派憲兵和車隊護送李翰園返回。原來馬步芳和馬鴻逵是一個樣，主持處理者也是和稀泥。有什麼真是非！
馬鴻逵的異母弟馬鴻炳，自1932年即離開部隊，寓居北平。“七七”事變後，日本特務機關積極物色與馬鴻逵有關係的人，馬鴻炳正中其選，立即照顧其生活，邀其出任偽職。此事被蔣介石偵悉，電馬鴻逵“最好把令弟從北平叫回寧夏”。未出一月，馬鴻炳即從北平到綏遠，又隨奸商駱駝隊回到寧夏。然而馬鴻炳卻牽了另一條線：幫其離開北平的是蔣輝若，此人是臨夏回民，曾在馬的第五混成旅任騎兵統領，後離開軍隊，落魄北平，投降日寇，任西北保商督辦，專門利用民族宗教關係，勾結甘、寧、青走私奸商販賣日貨、推銷煙土，往來於平、津、沈陽之間。馬鴻逵以富寧公司和寧夏銀行的名義，與蔣輝若勾結，往來頻繁。事為蔣介石偵知，曾電駐榆林的鄧寶珊密切注意，調查馬鴻逵勾結日寇板垣及串通漢奸走私的情況。1945年日寇投降後，蔣輝若投降傅作義，任包頭警備副司令，繼續與馬鴻逵勾搭，馬鴻逵先後派馬如龍、馬培清、馬全良與蔣輝若打交道，事為傅作義所知，即將蔣扣押於歸綏，後來蔣死於獄中。
馬鴻逵如此多次與日諜、奸細糾纏不清，如此不明民族大義，還談得上什麼抗日！
4．封鎖邊區
與消極抗日相對照，馬鴻逵對陝甘寧邊區的封鎖卻是無所不用其極。
一是構築所謂“防共碉堡線”。早在1936年，馬鴻逵就在金積、靈武一帶構築了一批碉堡。1940年9月，蔣介石又命令馬鴻逵和駐固原的四十二軍軍長楊德亮構築“防共碉堡線”。馬鴻逵遂全麵規劃，大興土木。以預旺堡（下馬關）、惠安堡、清水營、黑山岔、紅寺堡、金積、靈武等直接與陝甘寧邊區接壤地區為第一線工程；以黑城鎮、楊家莊、同心縣、中寧縣、中衛縣等地區為第二線工程。按工程量由各部隊分段包幹，限期3個月內竣工。工程所需木料、磚石等皆於所在地區就地征用，於是驅趕百姓，拆毀民房，借機敲詐勒索等情況，到處發生，老百姓敢怒不敢言。不到兩個月就全部完工。境內碉堡林立，戒備森嚴。1941年1月，西北長官公署派高參李毓華來驗收，得知僅金積、靈武兩縣就構築碉堡220餘座。