7．1992年《文化的圖像（上冊）——文化發展的人類學探討》，台北：允晨出版公司。
8．1992年《文化的圖像（下冊）——宗教與族群的文化觀察》，台北：允晨出版公司。
9．1996年《文化與修養》，清華大學人文社會學院主編，台北：幼獅文化事業公司。
10．1996年《人類的視野》，上海：上海文藝出版社。
11．1998年《宗教與神話論集》，台北：立緒文化公司。
12．1999年《田野圖像——我的人類學研究生活》，台北：立緒文化公司（繁體中文版）。濟南：山東畫報出版社（簡體中文版）。
13．2002年《李亦園自選集》，上海：上海世紀出版集團、上海教育出版社。
14．2003年《說文化，談宗教——人類學的觀點》，台北：台灣大學、時報出版社。
（二）合著
1．1962年 《馬太安阿美族的物質文化》（李亦園等著），中同研究院民族學研究所專刊之2，台北：中央研究院民族學研究所。
2．1963年 《南澳的泰雅人——民族學的田野與研究（上）》（與徐人仁等合著），中央研究院民族學研究所專刊之5，台北：中央研究院民族學研究所。
3．1964年 《南澳的泰雅人——民族學的田野調查與研究（下）》（與古磊等合著），中央研究院民族學研究所專刊之6，台北：中央研究院民族學研究所。
4．1983年 《山地行政政策之研究與評估報告書》（與古磊＝瞿海源、蕭新煌、餘光弘合著），台灣省政府民政廳委托研究計劃，中央研究院民族學研究所執行，台北。
5．1985年 《東南亞華人社會的研究（上、下）》（與吳燕和等合著），台北：正中書局。
6．1992年 《蘭嶼文化生態學調查研究報告》（與王俊秀、許木柱合著），台北：原子能委員會。
（三）編著
1．1972年 《中國人的性格：科際綜合性討論》（與楊國樞合編），中央研究院民族學研究所坍塌乙種第4號，台北：中央研究院民族學研究所。
2．1974年 《文化人類學選讀》，台北：食貨出版社。
3．1978年 《社會及行為科學研究法（上、下）》（與楊國樞、文崇一、吳聰賢合編），台北：東華出版社。
4．1978年 《社會變遷中的青少年問題》（與文崇一、楊國樞合編），中央研究院 民族學研究所專刊之24，台北：中央研究院民族學研究所。
5．1982年 《中國的民族、社會與文化——慶祝芮逸夫教授八十歲論文集》（與喬鍵合編），台北：食貨出版社。
6．1982年 《社會變遷中的犯罪問題及其對策研討會論文集》（與文崇一、楊國樞合編），中國社會學社、中國心理學會、中國民族學會主辦，台北。
7．1984年 《民間現行曆書的使用及其影響之研究》（李亦園、莊英章主持），台北：中央研究院民族學研究所。
8．1985年 《現代化與中國化論集》（與文崇一、楊國樞合編），台北：桂冠圖書公司。
9．1985年 《民間宗教儀式之檢討研討會論文集》（與莊英章合編），台北：中國民族學會編印。
10．1985年《海外華人社會研究叢刊》，共十二冊，（與廓振羽合編），台北：正中書局。
11．1987年《中國家庭之研究論著目錄》（與莊英章合編），台北：漢學研究中心。
12．1990年《人文學概論（上、下）》，台北空中大學。
（四）學術論文
1．1952年《本校四十年度新生之體質》，《台灣大學校刊》155期。
2．1954年《記本係所藏平埔各族器用標本》，《台灣大學考古人類學刊》（3）。
3．1954年《本係所藏平埔族衣飾標本》，《台灣大學考古人類學刊》（4）。
4．1955年《台灣平埔族的祖靈祭》，《中國民族學報》（1）。
5．1955年《台灣平埔各族所具東南亞古文化物質》，《主義與國策》（民族學專號）。
6．1955年《從文獻資料看台灣平埔族》，《大陸雜誌》（10）。
7．1955年《日月潭邵族民族學調查初步報告》（與陳奇祿等合著），《台灣大學考古人類學刊》（6）。
8．1955年“PreliminaryRreportofEthnologicalInestigationintheThaoofJihYuehT’anTaiwan，《台灣大學考古人類學刊》（6）。
9．1956年《來義鄉排灣族中箕模人的探究》，《民族學研究所集刊》（1）。
10．1956年《來義鄉白鷺等村排灣人的家族構成》，《民族學研究所集刊》（2）。
11．1957年《台灣南部平埔族平台屋的比較研究》，《民族學研究所集刊》（3）。
12．1957年《南勢阿美族的部落組織》，《民族學研究所集刊》（4）。
13．1957年《邵族的經濟生活》，《台灣大學考研人類學刊》（9/10）。
14．1960年TheStructureoftheIfugaoReligion，《民族學研究所集刊》（9）。
15．1960年《Anito的社會功能——雅美族靈魂信仰的社會心理學研究》，《民族學研究所集刊》（10）。
16．1962年《祖靈的庇蔭——南澳泰雅人超自然信仰研究》，《民族學研究所集刊》（14）。