1211年二月，成吉思汗自龍駒河率軍南下，越過陰山，向金朝發動了蓄謀已久的戰爭。金人在與蒙古的戰爭中再也沒有了曾經滅遼、滅宋的威風。實在無力抗衡的金隻好轉而與蒙古謀和，每年送給蒙古大批貢品以換取短暫的安寧，但蒙古對金的侵擾是日漸放肆，而金對蒙古隻能窮於應付而再無還手之力。大定年間，北方就流傳著這樣的民謠：“韃靼來，韃靼去，趕得官家沒處去”，反映出了金朝的無奈。
坐擁半壁江山、盛極一時的金朝，終於敵不住蒙古鐵騎持續了23年的攻擊，於1234年正月十日被蒙古軍攻破。金哀宗見大勢已去，傳位於末帝完顏承麟後自縊身亡，完顏承麟隨後便被蒙古軍所殺。
金朝自1115年完顏阿骨打建國以來，經曆短暫的繁榮，在曆經119年後，終於滅亡。留給女真人的，不僅僅是國破家亡的切膚之痛，更殘酷的現實擺在他們的麵前——如何維係民族的生存？金的興起和滅亡在很大程度上是與他們製度聯係在一起的。從遼朝繼承下來的統治方式以及漢族（宋）的影響，使金的政權體製過於鬆散。在蒙古人的打擊下，女真族瞬間分散為眾多的部落，等待著接受新政權的統治。
當蒙古人在成吉思汗的帶領下走向強大之時，居住在東蒙古地區女真人投入到成吉思汗的麾下。隨蒙古軍隊征討各地。隨著時間的推移，這部分女真人逐漸融入到蒙古族之中。
先前徙居中原、華北和遼東的女真族漸漸被同化，他們與建立北魏的鮮卑人，建立遼國的契丹人，建立後唐的沙陀人一樣都未能擺脫民族融合的命運。
當然並不是所有女真人都走向了被同化的道路，“忠”這一基本道德一直到金朝的最後階段也仍然存在著，雖然確實有叛徒和投機者，但部分散居於東北的女真人則非常頑強地保持著自己的民族習俗，按照自己原有的生活方式生活。他們依舊使用女真文字，似乎是滿懷希望地等待著本族的再度崛起。
到了明朝，女真人口逐漸增多，為了方便自己的統治，在女真地區設立了包括建州三衛、兀者、毛憐等在內的三百八十多個衛。還把他們劃為三個部分進行簡單的區分：居海西等處的海西女真，居建州、毛憐等處的建州女真和極東的野人女真。這時，女真的分布極為廣泛，發展穩定，大有重振輝煌之勢。據《大明一統誌》載：“東瀕海，西接兀良哈，南鄰朝鮮，北至奴兒幹、北海”，都成為當時女真人生活的區域。
女真人的興盛，使一些經曆或耳聞金國輝煌的人有了東山再起之念。明朝晚期，興盛的女真各部出現了“各部蜂起，皆稱王，互相殘殺，甚至骨肉相殘，強淩弱，眾暴寡”的局麵。其中的建州到了努爾哈赤迅速壯大起來。他吞並了女真各部，複用國號為金，不久又把女真族改名為滿洲族，並起兵向大明朝發起了進攻，努爾哈赤之子皇太極繼位後，改國號清，是為清太宗。不久便統一了女真各部，也為入主中原奠定了堅實的基礎。
此時的明朝也以處在了風雨飄搖之際，愈來愈腐敗的朝政，以及李自成率領的農民軍越來越強的攻勢，明朝已經是內憂外患。1644年，明將吳三桂與李自成的農民軍激戰於山海關。由於受到農民軍和清軍的兩麵夾擊，吳三桂思考再三後決定向後金求援，隨後多爾袞便率領後金軍入關參戰，滿洲人正式侵入中原。
遊離於努爾哈赤部族之外的野人女真迫於武力威脅，背井離鄉來到清朝位於遼東的統治中心跟隨努爾哈赤征戰南北。隨著時間的推移，他們憑借著驍勇善戰的性格，為清朝衝鋒陷陣，成為清朝入主中原的中堅力量。在朝鮮等地居住的一部分女真人後來也隨著大行勢融入滿朝。就這樣，居於東北和朝鮮的女真人不斷彙聚到清朝旗幟下， 1625年，清太宗在大勢所趨之下下令，“嗣後凡人皆須稱我國原滿洲之名，倘仍有以諸申為稱者必罪之”。
此後，“女真”一名在曆史上逐漸消失，他們都成為了“滿族”大家庭中的成員。