黑龍江地區財政基本靠中央撥款。墨爾根、黑龍江、呼倫貝爾、呼蘭雖然有稅，但額度通計不足一千兩銀。要維係正常官衙運轉，尤其布防駐軍，有效實施邊防，沒有較充裕的物力支持很難有所作為。
二、薩布素規劃屯田和建立學校
據《黑龍江外紀》記載，齊齊哈爾和黑龍江的墨爾根公倉貯存米穀定額都是3萬石，康熙三十七年（1698年），薩布素又奏定呼蘭貯存米穀定額10萬石。這麼看來，黑龍江地區官家儲糧比較充實。這些儲糧來源相當部分是公田、官莊屯耕所得。又據記載，齊齊哈爾、墨爾根的黑龍江公田養育兵和官莊屯丁，每名歲交糧22石；呼蘭官屯壯丁，每名歲交糧25石。合計起來，齊齊哈爾公田交糧780石，官屯交糧6600石。墨爾根公田交糧360石，官屯交糧3300百石，黑龍江公田交糧6600石，官屯交糧8800石，呼蘭官屯交糧12750石。
從繳納官糧數量可以約略推定黑龍江地區的農業規模。當時關外地曠人稀，加上當地土著生計亦農亦牧，農業很不發達。清朝要加強邊地統治，設官駐軍，需要物資供應，特別是糧食供給，全憑內地調運，顯然要加重政府負擔。為此必須開發當地，實行自給。在準備對俄戰事時，康熙帝已經考慮到這些問題。康熙二十三年（1684年）十二月，議政王大臣會議提到，黑龍江地方田地應遣戶部大臣一員監督耕種。康熙帝決定派遣戶部侍郎薩海去監督耕種。康熙二十五年（1686年）正月又差副都統馬喇等前往黑龍江督理農務。康熙帝指示他們說，農事關係兵餉，必須積貯充足。那些驛站遞送的人夫也應讓他們合力播種屯田。當年在有關官員監督下，以蒙古、錫伯、達呼爾、索倫等人力耕種，“田穀大獲”。收獲糧食“足供驛站人役之口糧，又積貯其餘穀”。康熙帝表示滿意，下令嘉獎相關出力官員。
但是黑龍江地區發展農業並非如此簡單。氣候嚴酷，無霜期短，當時關外土地以坰計算，一坰合六畝餘，因廣狹長短不同，隻是約略其數，不像關內以弓步丈量為準。黑龍江土著居民種田，一犁經常要駕三頭牛，因為當地沙性堅實，一牛犁不動；一架犁也比內地長大，犁多者為殷實之家，所以他們相逢談及生計，必問幾套犁杖。
黑龍江地力肥沃，人力不足，人力資源的匱乏嚴重製約著農耕的發展。由於軍政合一製度，許多兵丁需要應役，難兼顧耕耘，散居民戶又多無力購置牛犁，因此也難於開荒於數十裏之外。以齊齊哈爾城為例，僅僅在城周邊百裏內有田土者，世守其業，餘皆樵牧自給，僅圖溫飽。至於全區膏腴萬頃，荒而不治，被認為“勢使之然也”。
薩布素經理官屯的農業發展，隻能在人力不足的前提下限定地域進行。康熙二十九年（1690年），黑龍江將軍薩布素報告說，墨爾根居住的索倫總管安珠護等，每年領人耕種官田二千餘坰。現在官兵要移駐墨爾根，可否以此項成熟之田分給墨爾根兵丁耕種。經過戶部官員討論，清政府批準了薩布素的建議。
康熙三十六年（1697年）九月，薩布素向康熙帝報告說沿河遭水災有18個莊，請求計其人數，將黑龍江舊貯米糧救濟這些莊戶。康熙帝接讀報告後對戶部、理藩院官員說，我以前巡視去寧夏時，黑龍江將軍薩布素曾報告稱他那裏收貯糧米三萬餘石，年久漸朽，與其存積腐爛，不如分給兵丁，這樣可以出陳糧充軍糧，再收新糧收貯。現在他請求出倉糧救濟遭災莊戶也是這個道理，可以同意他的請示。於是遭災莊戶因此得到救濟。
黑龍江地區曆史上一直是當地土著民族棲息地方。土著居民的文化傳承自有傳統，與內地文教製度迥異。在黑龍江地區建立內地式官學，始自薩布素在康熙三十四年（1695年）的一道奏折。他向清廷建議，在墨爾根駐防八旗兩翼各立一學，設立助教官，選新滿洲及錫伯、索倫、達呼爾每佐領下幼童一名，教習書藝。這被認為是黑龍江建學之始。
禮部議複意見表示同意薩布素的提議，隨後康熙帝也批準了這個計劃。