除掉侯景，是陳霸先的第一份功勞。而且在這件功勞最終完成之後，兩個人又勸蕭繹在江陵成立政府，這樣做穩定了南方士族們的心思，也為後來短暫的中興局麵奠定了基礎。可是就在兩個人完成了任務之後，分裂也就產生了。
要知道，陳霸先和王僧辯雖然合作過，但是畢竟是兩個人，他們之間不可能有牢固不可隔斷的紐帶，所以當他們合作完成了另立皇帝的任務之後，接下來就是爭權奪利的時刻了。梁元帝是位成年的君主，所以在他執政的時代，兩個人的矛盾隻不過是暗中較勁，但是在梁元帝死了以後，王僧辯和陳霸先的矛盾開始表麵化。
當時兩個人商議讓蕭方智擔當梁王、太宰，秉承皇帝旨意。承聖四年（555年），王僧辯因為齊國的軍力強大，所以暗中和齊國的將領勾結，並迎立齊國扶植的蕭淵明為新的梁朝皇帝，將蕭方智立為太子，陳霸先看到王僧辯這種衝動的表現，苦苦勸說沒有效果，所以他準備在暗中殺死王僧辯，爾後自己掌握權力。
在承聖四年（555年）的九月，陳霸先襲殺了王僧辯，廢黜了蕭淵明，正式將蕭方智擁立為皇帝，並且在同年十月改元紹泰。就這樣，陳霸先擔任尚書令、都督中外諸軍事、車騎將軍、遙領揚州和南徐州的刺史職位，掌握了朝廷內部的實權。
在這裏，我們要說一下王僧辯為什麼會擁立那位受齊國控製的蕭淵明。如果按照後世所記載的那個樣子，是不夠全麵的。王僧辯雖然很怕齊國，但是作為一個武將，他不會怕到連爭辯都不敢爭辯。其實這裏麵我們可以讀出王僧辯走出的是“最後一次拯救蕭梁王朝”的“嚐試”之路。
蕭淵明是蕭衍的侄子，蕭繹（梁元帝）的堂弟，蕭繹駕崩的時候，享年47歲，那麼蕭淵明的歲數不會低於35歲，那麼三十五歲的君王相比於蕭方智這個隻有十二三歲的孩童，是不是更具有治國的才能呢？雖然這位皇帝仍然是王僧辯手中的棋子，但是他是王僧辯為了拯救蕭梁的宗廟而做的最後一次嚐試。
王僧辯的被殺，相當於給那些忠於蕭梁的將領一個信號，所以他們立刻做出了反應——反抗陳霸先，務必保住蕭梁王朝。這個反應是正確的，但是在當時看來確實是不明智的，因為起義最合適的總領袖王僧辯已經被殺，如果真的挑起戰爭，隻能被各個擊破。
就這樣，紹泰元年（555年）十月，鎮州刺史杜龕、義興太守韋載、吳郡太守王僧智（王僧辯的弟弟）等人據城反抗陳霸先。但是就像大數據分析的那樣，如果這幾個人在王僧辯還活著的時候發動兵變，機會還有六成，還可能成功；現在王僧辯已經被陳霸先殺死，想要組成反對陳霸先的有力組織，那就必須要有一個中堅力量組成臨時政府，那樣勝利的幾率是五成，就算不能成功，至少也可以和陳霸先軍隊同歸於盡；可是大家看一下當時的局勢，每個郡的總司令各自為戰，互相之間不聽調度，一盤散沙，勝利的幾率降低到了兩到三成，所以反陳霸先的聯盟軍隊獲得不了最後的勝利。
當平定了這三位叛徒的造反行動之後，陳霸先開始“奉命”（其實他自己已經大權在握了，說是奉了小皇帝蕭方智的命令，實際上，都是他自己的想法，用這種想法來號令三軍，確實能起到一定的作用）統一原來蕭梁王朝的土地，這第一個要統一的就是蕭勃。