秋，七月二十日，車隊行至沙丘平台，秦始皇駕崩。丞相李斯因為君主在外駕崩，擔心各皇子爭位及天下發生變故，所以秘不發喪，把棺材藏在車上，用遮陰的簾子遮擋，由始皇以前寵幸的宦官在旁邊陪乘。每到一個地方，所有安排一如既往，由宦官在車中假冒始皇，準許大臣所奏的事情，隻有胡亥、趙高還有受寵幸的宦官等五六人知道這件事。
當初，蒙恬、蒙毅兩兄弟備受秦始皇寵信。蒙恬在外為將，蒙毅在朝中參與謀劃，有忠信之譽，即使是位列將相者也要禮讓他們幾分。趙高沒有生育能力，秦始皇聽說他力氣大，又精通刑獄法令，就提拔他當中車府令，還讓胡亥跟從他學習法令斷案，胡亥很寵幸他。趙高犯罪，秦始皇讓蒙毅處理。蒙毅依法判處趙高死刑，秦始皇因為趙高辦事機敏，就把他赦免了。
趙高一向受胡亥寵幸，又怨恨蒙氏兄弟，此時於是勸說胡亥偽造一份始皇詔書，殺死扶蘇，自立為太子。胡亥當然表示讚成。
趙高說：“這事兒要想不出紕漏，必須得拉丞相入夥。”
於是去見丞相李斯，說：“胡亥那兒就有始皇駕崩前擬的詔書和符璽。立誰為太子，就憑丞相您與我二人說了算。您看這事情怎麼樣？”李斯說：“趙高，你好大的膽子！這不是為人臣子應該議論的！”
趙高說：“您在才能、謀略、功勞、勞而無怨以及扶蘇的寵信這幾個方麵，比之蒙恬孰高孰低？”
李斯說：“我不及蒙恬。”
趙高說：“這樣說來，一旦扶蘇即位，必定讓蒙恬取代您的位置，那看來您終究不能夠身懷列侯印璽而榮歸故裏了。胡亥忠厚仁義，你我可以輔佐他繼承皇位，做新朝的從龍功臣。希望您仔細考慮後決定此事！”
李斯被趙高說得心動了，就與趙高一起謀劃，假稱得到始皇詔令，立胡亥為太子。另外偽造了一封詔書給扶蘇，責備他不能開辟疆土，無尺寸之功卻耗損兵力，反而屢次上書，抗言誹謗，日夜抱怨，怕不能回來做太子；大將蒙恬不予匡扶，反而教唆參與謀反，兩人一並賜死，將軍隊交給副將王離。
扶蘇打開詔書，看後哭了起來，想在內室自盡以明誌。
蒙恬說：“陛下在外巡遊，還沒有立太子，但是讓您監督邊境30萬將士的動向，這是國家的重任！現在才派一介之使前來，如果這是一場騙局，你自殺就太不值了！臣再次請求您弄明白事情真相以後再死，也不算晚。”使者屢次催促，扶蘇對蒙恬說：“父親命令兒子死，兒子不得不死！”就自殺了。蒙恬不肯自殺，使者就把他交付有關官吏，囚禁在陽周。又命李斯的手下接掌護軍一職，然後使者回去報告。胡亥聽到扶蘇自盡的消息，就想釋放蒙恬。正好蒙毅為始皇出巡而祈禱山川，回來時路過，趙高就對胡亥說：“先帝原來早想立您為太子的，而蒙毅勸諫說不可以，不如把他殺了！”因此派人囚禁了蒙毅，把他關在代縣大牢裏。
然後車騎從井陘出發，抵達九原。當時正值酷暑，臭氣從棺材裏源源不斷地飄散出來，無法掩飾，幾個人沒有辦法，隻好下令隨從將一石鮑魚裝在車上，這樣屍體的腐臭就被鮑魚的臭味掩蓋了。車隊走直道到達鹹陽，然後才發喪。隨後胡亥登基，即秦二世。
九月，秦始皇被安葬在驪山。秦始皇墓挖得很深，人們設法把地下水隔開；又想辦法運來各種奇珍異寶，藏在墓穴裏，裝得滿滿的；還在墓中各處設下種種機關暗器，有敢挖洞進來盜墓的，機關會自動發動將靠近者射殺；用水銀模擬百川、江河、大海，靠機械灌注輸送；沒有誕下子嗣的嬪妃侍妾，一律被拉去殉葬。
下葬以後，由於墓室、機關都是工匠們建造布置的，他們知道其中的秘密，裏麵藏寶豐富，恐怕他們泄露。於是等安葬完畢，工匠們全都在封閉的墓穴裏給始皇帝做了陪葬。
秦二世想誅殺蒙氏兄弟，他的侄子子嬰勸他對蒙氏兄弟手下留情，二世不聽。於是先殺了蒙毅，蒙恬聽說消息後，知道大勢已去，於是選擇了服毒自盡。
陳勝吳廣起義
秦二世元年（公元前209年）七月，一個叫陳勝的陽城人和一個叫吳廣的陽夏人在今安徽蘄縣大澤鄉一帶揭竿而起，反抗暴秦。
陳勝、吳廣大澤鄉起義
當時，秦國征發平民去戍守漁陽，陳勝、吳廣等一行900人被征發趕往漁陽，陳勝、吳廣是他們的小隊長。行至大澤鄉正好碰上天降暴雨，道路不通，即使趕到漁陽，也要延誤期限了。按照秦的法律，征戍延誤期限者，一律處斬。
於是陳勝、吳廣趁天下百姓怨恨秦的暴虐，把押送他們的將官殺掉，召集戍卒號令說：“我們都已延誤期限，按律當斬。就算上麵大發慈悲，不把我們斬首，咱們這群人也要有多半要死於戍邊。何況壯士不死也就罷了，要死，就要死得轟轟烈烈！王、侯、將、相，難道是生下來就已注定的嗎？”這一號令得到了戍卒們的積極響應。