徐世昌聞已當選，未便承認，即通電中外，自表謙讓。但是新總統既由小徐運動，再加王揖唐鼓吹，遂選出徐世昌來，怎肯讓他辭去。當由兩院敦請徐世昌出山，馮總統亦致函敦勸。老段見已選定，亦出函勸駕。各省督軍亦皆擁徐，除廣東政府勸徐勿就職，餘均一致。徐思再待各方麵來，就可動身。果不一日，京內外促電，紛如雪片。徐乃提出“息事寧人”四字，作為口頭禪，允即赴京就職。過兩旬，即民國七周國慶日，徐遂赴都。馮聞徐至，於十月七日發出通電，曆述一年經過事情。
又二日徐至，馮即卸職。老徐受職時，正民國七周紀念，本日行就職禮，一切儀注，統照前例。禮成，大眾各散。此日是馮政府告終，徐政府起頭節目。馮既去，段亦提出辭職書，徐照準。遂任錢能訓署理，惟參戰督辦仍屬段。徐總統就職後，專謀南北統一，設法息戰。乃令錢代理及各部長通電南方商議息戰。南方說：“北方選舉新總統，當然反對。”遂開院會議，委廣東軍政府代行國務院職權，所有選舉總統從緩，先宣布議案，議案定後，即谘軍政府，軍政府即開政務會議，承認國會議決案。當日電告代行國務院職權，並行大總統職權。越日，又發通電一道：徐總統欲謀統一，怎不相容？遂聯絡英、美、法、日、意五國，從中調停；一麵飭前敵軍隊，一體罷戰。於是美公使電告駐粵美使，向廣東軍政府提出說帖，勸他息爭，自謀統一。廣東政府亦令前敵各軍一體息戰。政務總裁岑春暄等方有電寄徐總統。徐接閱岑電甚喜。國務院亦致一函，北方和議委江督李純主持。李本主和，今授徐總統委，當然同意。一麵欲在江寧議和，一麵欲在上海議和，和議算有望，不過地點未決。徐總統先在四照堂作會議場，帶全體國務員，段督辦，各督軍，先議定政策五條。討論後，即通電各省，各督軍亦遂出京。
且說徐總統因南北和議，即令朱啟鈐南下江寧，作為南北和議全權代表，會同蘇督李純等開始議和。廣東也推唐紹儀為總代表，行次上海，不肯往江寧。經蘇督李純調停，請朱移往上海。朱為速和起見，亦許諾。時已民國八年二月了，李督軍遂發通電，宣告中外，即派幹員數十人，充朱差遣。各人均來謝委，李出接見，朱亦來拜會。李說“不必客氣”，方說“各位”二字，不防腳下一絆，從第一層跌至第四層台上，背骨又為台階所格，遂閉目忍痛，解經從役扶起，慢慢回入別廳，朱遂別去。是夕尚安，越宿即疼得很，致不能起床，後由張醫施治，直至旬月始痊。此時，朱代表赴上海，至二月二十日，南北代表同蒞會所，列席開會。經兩代表表明宗旨，先由南代表宣言後，再北代表宣言。兩方宣言畢，大眾均向國旗行禮，歡呼“民國統一萬歲”，隨後大眾散去。越日，始開正式會議，南代表首先要求撤換陝督陳樹藩。原來樹藩仗段派勢力，玩視中央命令，自由行兵，所以唐代表提出質問，迫令撤換。還有閩、鄂衝突，亦曾言及。北代表言願達中央，即擬稿令人拍發，請政府令陝陳停戰。越日，政府—電告南方，謂已派張瑞璣赴陝，監督停戰。南方又接陝西於右任來電，言樹藩部劉世瓏仍率兵進攻，顯背和議，應歸北方擔負。陝西於右任屢來電，言失去盩厔等情。朱代表自知中央理屈，未便和議，與分代表等合電辭職，徐政府複電慰留。雖有電停戰，奈陳總不遵，仍戰不止。哪知陳樹藩密奉參陸處電促，所有軍械皆由參陸處或漢陽兵工廠運去。唐代表乃提宣言書，歸咎北方停止和議。江督李純聞知很憤，因疾力起，擬定五條辦法，電陳中央，請準速行。徐總統被安福派牽製，不能主張。今接李督電，自然準行。李督又電廣東政府，請同意，又通電全國，自此和議複活。