魄門，指肛門，為大腸的下端。為什麼取魄門這個名字呢？原因有兩個：一是因為肺藏魄，肺又與大腸相表裏，所以稱為魄門；二是，“魄”通“粕”，即糟粕，魄門是傳送糟粕之門，所以說是魄門。
《黃帝內經》中指出：“魄門亦為五髒使。”“使”是使喚、命令之意。“魄門亦為五髒使”，是指魄門的啟閉功能受五髒所統攝，髒腑功能正常，升降有序則隨著魄門的啟閉而升清降濁。
五髒與魄門的關係
●心與魄門
心主神誌，為五髒六腑之大主，心神正常則魄門啟閉正常，糟粕按時而下；心神失常，如昏厥患者，魄門失去心神調控，二便就不正常，易失禁或秘結。
●肺與魄門
肺與大腸相表裏，魄門與肺的關係最大。肺主氣具有宣發肅降之職，大腸的傳導氣化與魄門的啟閉排便，依賴於肺氣的推動及宣降作用。肺氣充足，把津液運到大腸，則大腸氣化有力，魄門啟閉正常；若肺氣虧虛，大腸就氣化無力，傳導緩慢，魄門開啟無力，便秘就出現了；若肺氣壅滯，易使大腸氣滯，也會導致便秘。
●脾胃與魄門
脾主運化，胃主受納，脾胃可以將飲食水穀化為水穀精微，並將精微布散全身，大腸的傳導功能有賴於氣血的充養及津液的滋潤。因此，魄門的啟閉功能依賴於脾氣的升提與胃氣的通降。脾胃功能正常，則大腸傳導、魄門啟閉正常；若脾胃功能失常，則大腸傳導功能失常，導致魄門開啟失常。中虛脾陽清氣下陷則魄門失守而泄瀉，所以《黃帝內經》中說，“中氣不足，溲便為之變”。
●肝與魄門
肝主疏泄，能調暢氣機，促進氣機的升降出入，調節大腸的傳導與魄門的開啟。若肝失疏泄，氣機就不通暢，進而影響大腸的傳導，導致大便溏泄；若肝氣鬱結，氣滯不暢，大腸傳導無力，就會造成大便秘結。所以，李在《醫學入門》中指出：“肝與大腸相通，肝病宜疏通大腸，大腸病宜平肝。”
●腎與魄門
腎開竅於二陰，主司二便。大腸的傳導功能依賴於腎陽的溫煦、氣化及腎陰的滋潤、濡養，魄門的開啟還有賴於腎氣固攝作用。如果腎陽虧虛，或腎氣不足，固攝無力，就會出現腹瀉便溏；如果腎陰虧虛、腸道失潤，或腎陽不足、推動無力，就會造成大便秘結。
綜上所述，“魄門亦為五髒使”，魄門的開閉、大便的排泄依賴於心神的主宰、肺氣的宣降、脾氣的升提、胃氣的通降、肝氣的調達，以及腎氣的固攝。這一理論、對於疾病的診斷與治療都非常重要。
從魄門察病
《黃帝內經》中指出，“凡治病必察其下，觀其誌意，與其病也。”強調在治療疾病時，必須注意觀察患者二便的變化，通過二便的變化，判斷疾病的虛實，推測病情的吉凶。
所以，中醫有事沒事都會問二便（大小便），這是何意呢？其實，問大便可以知道脾胃如何。比如脾胃氣血旺盛的話，大便是成形的，而且是很粗的，所以小孩、年輕人的大便和老年人的大便是不一樣的。年輕時，氣血旺，五髒強，大便又粗、又大、又長；可是年老體弱了，五髒虛損，大便都拉得特別細。因此，脾胃氣血旺盛好的話，大便功能就好。
此外，肛門的鬆緊厚薄，為髒腑精氣盛衰（尤為脾腎盛衰）的外露，肛門緊而厚實，象征髒氣堅實；肛門鬆弛而薄提示內髒虛，肛門下脫更為脾氣虛之兆。
值得注意的是，肛門皮膚的異常，常為下消化道腫瘤的警報，如肛門皮膚出現蕈狀或棘狀贅生物，或瘙癢、頑固濕疹等往往為直腸腫瘤的外兆。五髒病變，通調魄門魄門啟閉功能失常，影響髒腑氣機升降失常，出現便秘或腹瀉，引起五髒病變，治可通調魄門。因此，在疾病的治療中，魄門病變可調理五髒；五髒病變，通調魄門。
魄門還有藏的作用，《黃帝內經》中說，“水穀不得久藏”，表明魄門有一定藏的作用。更確切地說“一瀉一藏”就是“一開一閉”，肛門的運用在於“一開一閉”的貫通中，此為“通”也，就是“氣”通了。
●何謂“開”
卯時（早晨5時到7時）是大腸經當令，這個時候天基本上亮了，天門開了。那麼相對而言，地戶也要開。地戶在中醫裏就是指魄門，門者，門戶也，魄門就是肛門。地戶要開即是肛門要“瀉”，應該正常地排便，把垃圾毒素排出來。因此要養成早上定時排便的習慣。
肛門這個地方，不僅有氣的變化，而且氣一足還能化成精。如果這個地方一開放，精氣就要跑出來了，精氣往外跑，生命就沒有能量，就有損於健康、有阻於長壽，所以要“閉地戶”，但關鍵不是“閉”，而是要往上“提”。把肛門往上提，精就不容易跑了。因此，養生學中很重視“氣道內提”，收提肛門以保元真之氣內藏。這麼說來，吃瀉藥治療便秘的方法很不好，因為它消耗了人體很多的元氣；同樣的排便不暢，不應該攥拳用力使勁，而應憋一口氣。