由於寇準為官期間政績突出，有利於宋王朝政權的鞏固，故受到宋太宗的信賴，連連升遷。當時，恰逢太宗下詔，讓百官上書直言進諫，討論國家大事。有一次，眾卿都建議與遼國講和，而寇準卻大膽直言，反對講和，並據理陳詞，力排眾議。宋太宗見寇準膽識過人，才幹超群，因此對他尤為器重，拜寇準為樞密院直學士。還有一次，寇準上朝奏事，因說話不合太宗心意，太宗大怒而起，欲退朝回宮。此時寇難並未因太宗發怒而罷諫，相反，卻上前扯住太宗的衣角，讓太宗坐下來，繼續聽他直言陳述，直到太宗同意他的意見，當即決斷之後，才肯罷休。寇準這種為國計民生之大事，敢於在威怒之下的皇帝麵前，不怕丟官，挽衣強諫的精神，與前朝名相魏征不相上下。所以，當太宗息怒之後，仔細想來，寇準能如此忠勇直諫，實屬難得，對他頗為讚許。太宗對近臣說道：“朕得寇準，猶如唐太宗得魏征一樣。”
在兩次廢立太子的重大事件中，寇準充分顯示了他的足智多謀和善斷大事的品質。一次是廢楚王趙元佐太子。元佐是宋太宗的長子，由於營救太宗之弟趙廷美沒有成功，得了心病，行為變得粗暴殘忍。身邊的人稍有過失，他就用殘酷的刑罰處死。太宗多次訓誡他，始終未見好轉。重陽節那天，太宗設宴招待眾王，元佐因病剛愈沒有讓他參加。到了半夜，為了發泄憤懣，元佐竟把妻妾關閉起來，縱火焚燒宮室。太宗因此大怒，意欲廢掉元佐，另立太子。當時寇準在鄆州做通判，太宗召見他問道：“你試著為朕決斷一件事情，太子的所作所為太無王法了，日後必定有夏桀、商紂一樣的行為，朕想廢掉他，但東宮擁有兵甲，恐怕因此會鬧出大亂子。此事如何是好?請您替我籌劃一個萬全之策。”寇準說：“請陛下找個機會，命太子代您主持某項典禮，他左右人員必定隨行，然後陛下派人往東宮仔細搜查，果真有不法的事情，等太子回來拿給他看，把他廢除。到時候隻要一個太監的力量就夠了。”太宗接受了寇準的計策，趁太子外出，派人從他的宮中果然搜出了許多刑具，有剜眼睛的、抽筋條的、割舌頭的等等。在大量物證麵前，元佐隻好低頭認罪，於是就順理成章地被廢黜了，沒有發生任何風波。另一次是立襄王元侃。那是淳化五年(公元994年)的事。當時太宗已近暮年，為立太子事心煩意亂，坐臥不安，加上身患腳疾，疼痛難忍，真可謂心力交瘁，苦不堪言。此前，有馮拯等人上疏，請求早立太子，太宗盛怒之下，把他們都貶到嶺南去了。此後，再也沒有人敢提及立太子的事。但太宗畢竟年事已高，立太子繼承皇位想回避也回避不了。此時的太宗，亟需一個情投意合的人與他為伴，向他一吐衷腸，以求得心理平衡，並共同謀劃另立太子之事。太宗想起了被他貶到青州的寇準，想起了他直言進諫、為國盡忠的種種好處，不免有所悔悟，懷念之情油然而生。於是下詔書召寇準回京。當太宗聞報寇準上殿進見時，便急忙宣入。待寇準參拜已畢，太宗先讓他看看自己的腳病，隨後賜坐，並問寇準：“愛卿為什麼來得這樣遲緩?”寇準回答：“臣不見您的詔書召還，是不敢擅回京師的。”太宗對寇準的回答並不介意，隻想盡快聽到寇準關於確立太子的意見，便馬上轉換話題。他問寇準道：“愛卿看我這些兒子當中，誰可以繼承皇位呢?”寇準此時雖然心中有個人選，但不知太宗心中傾向於哪一個，因此不便直接回答太宗的問題。於是他隻給太宗提出一個選立太子的原則。寇準回道：“陛下為天下人選擇君主，與婦人、宦官商量，是不行的；與近臣商量，也不行；隻要陛下您自己選擇能符合天下人所期望的人，就可以了。”太宗聽罷，低頭思之良久，然後屏退左右，對寇準說：“你看襄王元侃可以嗎?”其實寇準心中所想的也是襄王元侃，於是連忙說道：“知子莫如父。陛下既然認為可以，願您當即決定。”立太子的事，君臣二人就這樣決定了，太宗從此了卻了一樁心事。
至道元年(公元995年)八月，宋太宗正式立襄王元侃為皇太子。當太子到宗廟參拜行禮回來，京城人民夾道觀看，歡呼雀躍，有人說：“真是個少年天子!”太宗得知後，心中甚是不悅，說道：“人心一下子都歸了太子，那將把我擺在什麼地位呢?”寇準怕太宗改變主意，便急中生智，立刻再拜並祝賀說：“太子眾望所歸，是陛下的決策英明，是國家百姓的洪福。”太宗聽寇準如此一說，覺得自己在臣民心中的地位仍屬於太子之上，便馬上高興起來。又入後宮，把此事說給皇後、嬪妃知曉，後宮的人又都出來慶賀。太宗乘興命人擺宴，與寇準共飲，待醉方休。
寇準主張執法公正，斷案如鑒，反對徇情枉法，以權謀私。宋太宗淳化二年(公元991年)春，大旱無雨，又鬧蝗災，加上前一年火、蝗、旱三災並發，所以引起了太宗的注意。他召集近臣進殿，詢問他們處理朝政是否有不當之處，因而觸怒了上天，大臣們都說這是天意如此，我朝朝政並沒有什麼錯處。然而寇準卻回答說：“《尚書·洪範》說，天人之間，互相感應，如影隨形，如響隨聲；現在出現了大旱之災，證明我朝施用刑罰有不公平的地方。”太宗聽後不悅，轉身退入宮中。過了一會，太宗又召見寇準，問他什麼事情處理不公平。寇準說：“請召中書省與樞密院二府大臣前來，我就說。”於是太宗下詔，召二府大臣進入內宮。寇準說道：“前不久，祖吉、王淮皆因違法受賄而被治罪。但祖吉貪贓少卻被殺了，而王淮因為是參知政事王沔的弟弟，雖然侵吞自己主管的國家財物多至千萬，反而隻受杖刑，又官複原職，難道這不是不公平嗎?”太宗問王沔，此事是否如寇準所說，王沔無可辯駁，隻好叩頭謝罪。太宗又狠狠地斥責了王沔。
景德元年(公元1004年)七月，宋真宗任寇準為宰相。同年九月，遼軍有小股遊騎侵犯宋邊境，作戰稍有不利，就急忙引軍退卻，似無大舉進兵與宋軍交戰之意。寇準接到此一軍情報告，料定此為遼國興兵南下大舉侵犯的前兆，故立刻上奏真宗說：“遼軍此舉是想麻痹我們。我們應當加緊訓練部隊，任命將帥，並且要選派精銳部隊占據軍事要地，以防遼軍大舉進犯。”在寇準的建議下，宋軍調兵遣將，嚴陣以待。
果然不出寇準所料，同年十一月，遼軍大舉南下。遼國蕭太後、聖宗耶律隆緒禦駕親征，大將蕭達攬率軍二十萬直進中原，軍情十分危急，宋廷驚慌失措。一個晚上竟有探馬飛報五封軍情機密文書送達相府，而身為朝廷重臣的寇準卻十分鎮定，他對緊急軍情文書連拆也不拆，照常飲酒，談笑如常。第二天，有人將此事奏報真宗，真宗大驚，責問寇準為何如此?寇準回答說：“陛下想了結此事，不出五天定見分曉。”真宗問寇準有何退兵良策。寇準提出要真宗禦駕親赴澶州(今河南濮陽)坐陣，這樣必能克敵製勝。他認為皇帝大駕親征，宋軍必定團結和睦，士氣高昂，軍威振奮，而敵人自然會聞風落荒而逃。否則，宋軍人心渙散，敵人乘勝而入，大宋天下難得太平。朝內群臣見寇準提出要真宗禦駕親征，感到事情重大，也怕隨駕前往，因此個個膽戰心驚，紛紛準備退朝，以免皇帝怪罪。寇準見群臣如此委縮退卻，心中甚是不悅，便嚴辭厲聲製止。真宗皇帝也感到十分為難，想要回到內宮，然後再議決此事。寇準一看真宗皇帝有不願親征之意，一旦回宮，這件事就難辦了。就對真宗說：“陛下一進去，群臣就再難見到您，那就要誤大事了。請您不要回宮。”真宗在寇準的強諫之下，萬般無奈，隻好同意討論是否親征事宜。