不完全吞噬可使這些病菌在吞噬細胞內得到保護，使機體體液中特異性抗體、非特異性抗菌物質或抗菌藥物無法消滅它們；有的病菌尚能在吞噬細胞內生長繁殖，反使吞噬細胞死亡；有的可隨遊走的吞噬細胞經淋巴液或血流擴散到人體其他部位，造成廣泛性病變。
此外，吞噬細胞在吞噬過程中，溶酶體釋放出的多種水解酶也能破壞鄰近的正常組織細胞，造成對人體不利的病理性免疫損傷。
正常人體的血液、組織液、分泌液等體液中，含有多種具有殺傷或抑製病原體的物質。主要有補體、溶菌酶、防禦素、乙型溶素、吞噬細胞殺菌素、組蛋白、正常調理素等。這些物質的直接殺傷病原體的作用不如吞噬細胞強大，往往隻是配合其他抗菌因素發揮作用。例如，補體對霍亂弧菌隻有弱的抑菌效應，但在霍亂弧菌與其特異抗體結合的複合物中若再加入補體，則很快發生溶解霍亂弧菌的溶菌反應。
人體的免疫係統不僅時刻保護我們免受外來入侵病菌的危害，同時也能預防體內細胞突變引發癌症的威脅。如果沒有免疫係統的保護，即使是一粒灰塵也足以置人於死地。
人體本身的防禦機製具有不可思議的力量。適當的營養能使免疫係統全麵有效地運作，有助於人體更好地防禦疾病、環境汙染及毒素的侵襲。
激烈的廝殺
當病菌、病毒等致病微生物進入到人體後，免疫係統中的巨噬細胞首先發起進攻，將它們吞噬在巨噬細胞內，然後通過酶的作用，把它們分解成一個個片斷，並將這些微生物的片斷顯現在巨噬細胞的表麵，成為抗原，表示自己已經吞噬過入侵的病菌，並讓免疫係統中的T細胞知道。
T細胞與巨噬細胞表麵的微生物片斷或者說微生物的抗原相遇後，馬上發生反應。這時，巨噬細胞便會產生出一種稱為淋巴因子的物質，其作用是激活T細胞。T細胞一旦被激活，便立即向整個免疫係統發出警報，報告有敵人入侵的消息。
這時，免疫係統會出動一種具有殺傷性的T淋巴細胞，並派出專門的B淋巴細胞，最後通過B淋巴細胞產生專一的抗體。
具有殺傷性的T淋巴細胞能夠找到那些已經被感染的人體細胞，一旦找到之後便像殺手那樣將這些受感染的細胞摧毀掉，防止致病微生物的進一步繁殖。
在摧毀受感染的細胞的同時，B淋巴細胞產生的抗體與細胞內的致病微生物結合，最終將其清除掉。免疫係統正是通過以上一係列複雜的過程，達到抵抗外敵入侵的目的。
當第一次感染被抑製住以後，免疫係統會把這種致病微生物的特性具體地記錄下來。如果人體再次受到同樣的致病微生物入侵，免疫係統已經清楚地知道該怎樣對付它們，並能夠很容易、很準確、很迅速的作出反應，將入侵之敵消滅掉。
人體的戰場
人們通常也知道體液經由靜脈和動脈這兩種管道輸送，但恐怕很少有人知道還有第三種運送體液的係統，即所謂的淋巴係統，它平行於但又獨立於血管。
淋巴係統有兩大主要任務。它將血管中滲出的體液聚集起來，並使之重新參加循環。同時，它不斷貯存並生產各種淋巴細胞，以防止細菌、病毒甚至癌細胞的侵襲。
淋巴係統是相當大的輸送係統，它像樹根一樣終日不停地吸收體液。淋巴係統甚至不需要自己提供動力，它依賴肌肉的運動及附近血管的搏動而運送其“貨物”。
淋巴係統並不僅是一係列管子。當淋巴上行時，它經過數百個被稱為淋巴結的器官。每個器官都像小倉庫，裏麵裝滿被稱為巨噬細胞的東西。
“巨噬”意味著其食量驚人，這些細胞也確實如此。不管經過淋巴結的是細菌還是癌細胞，都被巨噬細胞吞食殆盡。淋巴結其實就是一個小型戰場。當因感染而需開始作戰時，外來的入侵者和免疫細胞都聚集在這裏，淋巴結就會腫大，甚至能觸摸到它。
淋巴結既是戰場，又是整個軍隊的排水係統。淋巴結肩負著過濾淋巴液的工作，把病毒、細菌等廢物運走。淋巴係統就是這樣將要送回血液的體液進行過濾。
人體衛士也有反目的時候
免疫係統是一部高效的機器，但也隻是一種機器而已。有時它也會出現故障或運轉不靈。更糟的是，它能完全失靈甚至向自身組織發動進攻，有時會帶來災難性後果。
當免疫功能喪失時，身體就會失去抵禦入侵者的能力。隨之而來的那種十分混亂的狀況，讓人難以想象。此時，身體虛弱到隨時都會出現意外。