重建國民黨各級組織。中央改造委員會頒發了《黨員歸隊實施辦法》等條規，收集潰散的國民黨黨員。規定於1951年1月4日至23日辦理黨員歸隊登記手續。蔣介石對於歸隊的黨員並不放心，決定由國民黨的各級委員會對一般黨員進行甄別，而由中央改造委員會負責審查歸隊的中央委員。歸隊的黨員要進行宣誓儀式，表示對蔣介石的效忠和無條件服從。所有黨員都必須納入組織，通過小組的形式加以控製。對於未歸隊的黨員一律撤銷黨籍。與此同時，在民間吸收新黨員，改變國民黨的組織成分和社會基礎。據國民黨的中央改造委員會1952年8月的統計，國民黨改造後的成分構成中，“農工分子”占49.3%，高中以上“知識分子”占29.77%，25歲以下青年占35.29%，台籍黨員人數明顯增加。在吸收新黨員的基礎上，將“黨員納入組織”，否則黨籍無效。然後，加強對國民黨黨員的“教育訓練”。
強化組織紀律建設。為改變國民黨組織混亂、紀律鬆散的弊病，在改造過程中除嚴格執行黨員登記、黨員繳費和黨員定期學習的規定外，國民黨還采取多項措施，加強組織紀律。重點是改革監察製度，撤銷形同虛設的各級監察委員會，在各級改造委員會中設立紀律委員會，負責監察黨員行為、審核黨的經費決算及審理各類違紀案件。對在黨內搞小組織、違背上級政策與命令、不按時繳納黨費、不參加黨小組活動、泄露黨的秘密等行為，一律視為違反黨紀而懲罰；將“變節通敵”、“跨黨變節”、貪汙瀆職、生活腐化且劣績顯著、放棄職守不負責任、工作廢弛、搞不正當經營以牟取暴利的黨員皆視為腐敗分子，一經發現，當即清除。中央改造委員會號召各級黨部、各個黨員進行檢討，鼓勵下級對上級的檢舉，黨員之間相互檢舉。
重塑國民黨的“精神”。蔣介石認為國民黨原有的屬性已發生蛻變，“不及一個普通政黨”，因此，國民黨改造的“本質屬性”為建設“革命民主政黨”。具體內容為：以國民黨組織和精神維護“民主憲政”的基礎；強化國民黨組織權能；繼續貫徹三民主義思想。此舉實質是強化國民黨的思想和組織功能，有利於維持國民黨偏安台灣的局麵。
製定“黨務製度”。其主要內容包括兩個方麵：在幹部製度上，堅決改掉“側重個人領導的舊作風”，實行“原則領導、一元領導和民主領導的新作風”，“領袖”采取幹部集體決議；在黨政關係製度上，改變過去由“黨直接領導政府”的方式，實行“依主義製定政策，以政策決定人事，以組織管理黨員”的原則，透過“民意機構”，“依法定程序構成法令及政令”。同時又規定在各機關中普遍建立國民黨黨團組織，各項政策的實行須通過各級黨團組織。借以實現“以黨治國”和“以黨領政”。
1952年秋天，國民黨在台灣普遍建立起包括省黨部在內的各級黨組織，並開始了有效的工作，這標誌著國民黨改造實施階段的結束。隨後又召開國民黨第七次全國代表大會，修正了黨章及政綱政策，提出“反共抗俄時期工作綱領案”，大會還選出了由48人組成的中央谘詢委員會和由32人組成的中央委員會。中央委員會旋即召開一中全會，選出了由10人組成中央常務委員會，接替為時兩年多的中央改造委員會的工作，中央改造委員會隨之解散，國民黨的組織重新恢複正常狀態。
那麼，對國民黨的“改造運動”應如何評價呢？
國民黨利用朝鮮戰爭帶來的喘息之時機，開展“改造運動”並實施了一係列調整幹部、穩定社會、發展經濟的措施，加之美國的援助，使它在台灣這座孤島上起死回生，形成了偏安一隅的“南朝”。這次“改造運動”在一定程度上取得了預期的效果。
1.清除異己，使台灣成為清一色的蔣家天下
通過“改造運動”而進入國民黨政治權利核心的陳誠、穀正綱、蔣經國等16名中央改造委員，皆為蔣介石心腹幹將。而作為台灣發展障礙的那些曾經位高權重、而今少能乏力的原大陸軍政界“黨國元老”，均被安排在有職無權的中央評議委員會“頤養天年”。同時，曾經形成山頭割據之勢的國民黨內原有CC係、孔宋係、政學係及其他派係，在改造中均被瓦解。加之國民黨在島內嚴格實施“黨禁”，保證了蔣介石全麵而嚴格地掌控黨、政、軍、特大權。此舉無疑既有利於穩定其黨內地位，也有利於國民黨對台灣的統治，同時也有益於台灣社會經濟的發展。