前章發明六腑。此章複發明六髒之義。謂前雲六腑者。有外腑在內。今經言六髒者。謂腎有兩枚。其左為腎。右為命門。又曰。命門者。謂精神之所舍。男子藏精。女子係胞。其氣與腎通。乃見越人以命門之名。配於右腎。而命門之處。實指兩腎中間。不爾。何以言藏精係胞。何以言氣與腎通。然又恐命門之名。混於手心主胞絡之髒。故有下文言三焦一腑。不屬於五髒者。是即指明屬於胞絡之髒也。其氣與腎通。
是指命門與右腎一氣相通。玩讀自見。
腑有五者何也。然。五髒各一腑。三焦亦是一腑。然不屬於五髒。故言腑有五焉。
此言三焦不屬於五髒者。乃屬於心胞絡也。舉三焦亦是一腑。以見不配五髒。而配亦是一髒之心胞絡。
最為切當者也。二十五難三焦論中。餘謂似腑外腑之大囊。配似髒另髒之小囊。與此節義同。
三十六難（三十六難次節誤列三十七難末節）曰。髒各有一耳。腎獨有兩者何也。然。腎兩者非皆腎也。其左者為腎。右者為命門。命門者。謂精神之所舍。原氣之所係也。故男子以藏精。女子以係胞。故知腎有兩（兩諸本作一）也。
此章承上章。複發明命門在於兩腎中間之義。所以又補出原氣之所係也。蓋所謂原者。即三焦之原。六十六難雲。臍下腎間動氣者。人之生命也。故名曰原。觀此亦可以無疑矣。但後人不明此義。將謂三焦與胞絡為表裏。出自內經。一陰一陽之定耦。初無命門三焦表裏之說。惟靈樞根結及素問陰陽離合等篇。有太陽根於至陰。結於命門。命門者。目也。此指太陽經穴終於睛明。睛明所夾之處。是腦心乃至命之處。故曰命門。此外並無命門之說。而右腎為命門。實見於此。但難經皆出於內經。必有確據。誠如滑氏之注七難雲。篇首有經言二字。考之靈素並無。或越人時別有上古之本。是未可知也。惟是右腎為命門。男子藏精。女子係胞。則腎將藏何物。此又無怪乎其疑也。觀經脈篇。有左為腎。右為子戶。夫所謂子戶者。即子宮也。即俗名子腸也。子腸居直腸之前。膀胱之後。當關元氣海穴之間。男精女血。皆存乎此。曰丹田。曰氣海。實則一子宮耳。子宮之下有一門。女子曰產門。男子即泄精之道。男之施由此門而出。女之攝由此門而入。胎元既足。複由此而出。即如四十四難。
七衝門者。皆指出入之處。乃見凡出凡入皆謂之門。而此係先天立命之本。焉得不謂之命門乎。
是即男子藏精。女子係胞。皆有歸著。正合六十六難臍下腎間動氣之說。而千古之疑可頓釋矣。至於十二經之陰陽表裏。固已天然配就。若以命門再配一經。是腎髒唯一。而經居其二。必無是理。且內經有督脈十椎中是命門原。屬於腎之句。當以原字讀斷。則知命門在原。並知兩腎俱非藏精係胞之所。其天一之真陰。藏於兩腎中間。命門之原。而氣通於左。坎中之真陽。藏於兩腎中間。命門之原。而氣通於右。故左腎為水。右腎為火。越人以命門之真陽。分發右尺臣火之位。理宜然也。予亦悉揣經義而評之。以俟將來之裁正焉。
中峰雲。論命門之原。十二經之根。呼吸之門。三焦之原。豈非指此命門乎。
經雲氣獨行於五髒。不榮於六腑者。何也。然。氣之行如水之流。不得息也。故陰脈榮於五髒。
陽脈榮於六腑。如環無端。莫知其紀。終而複始。而不覆溢。人氣內溫於髒腑。外濡於腠理。
此節言人身命門之氣。無不流通。但陰脈獨榮五髒。陽脈獨榮六腑耳。陰脈者。三陰脈也。
陽脈者。三陽脈也。循環無已。行於五髒六腑。而不覆溢者。謂不傾而不滿也。又曰。人氣內溫於髒腑。外濡於腠理者。言人命門一陽之氣。內則溫養髒腑。外則濡潤腠理。無微不到。無處不周。而所問之不榮於六腑者。惟陰脈耳。非氣也。故下文詳言陰脈陽脈之病。覆溢二字。並非寸口脈之覆溢。舊注指十八難之覆溢脈。大誤。
三十七難曰。五髒之氣。於何發起。通於何許。可曉以不。然。五髒者。當上關於九竅也。
故肺氣通於鼻。鼻和則知香臭矣。肝氣通於目。目和則知黑白矣。脾氣通於口。口和則知穀味矣。心氣通於舌。舌和則知五味矣。腎氣通於耳。耳和則知五音矣。三焦之氣通於喉。喉和則聲鳴矣。
此章承上而言陰脈榮於五髒之義。九竅者。目二耳二鼻二口一舌一喉一也。
五髒不和。則九竅不通。六腑不和。則留結為聚。
此亦承上章陽脈榮於六腑之義。言六腑屬陽。邪在陽。則六腑不和。不和則氣滯。而為聚為癰矣。下文又以髒腑並言之。以明其所以不和之故也。（聚字靈樞作癰字）邪在六腑。則陽脈不和。陽脈不和。則氣留之。氣留之。則陽脈盛矣。邪在五髒。則陰脈不和。陰脈不和。則血留之。血留之。則陰脈盛矣。陰氣太盛。則陽氣不得相榮也。故曰關。（向誤格字）陽氣太盛。則陰氣不得相榮也。故曰格。（向誤關字）陰陽俱盛。不得相榮也。故曰關格。關格不得盡其命而死矣。