後來，康熙帝又應用這種單株選擇法，成功地選育了一種早熟高產的優質水稻——禦稻。據《康熙幾暇格物編》的記載，事情的經過是這樣的：有一次，康熙帝在田間巡行，”忽見一科高出眾稻之上”的稻子。他還發現這株稻與普通稻子不同，它成熟較早。當時正陰曆六月下旬，普通稻“穀穗方疑”，然而這株稻的子實，卻“已堅好”。為了證明這種早熟性狀是否能遺傳下去，康熙帝便把這株稻的種子單獨收下來，準備第二年在田間試驗。第二年試驗結果證明，這株稻的早熟性狀是遺傳的，六月時，此稻果然先熟，並“從此生生不已，歲取千百”。長時期來，它一直成為禦用稻米的主要來源。由於它最初是從皇宮用糧的稻田中發現選育成的，所以人們稱它為“禦稻”。禦稻的選育成功和推廣，與康熙帝的卓識是分不開的。由於“禦稻”早熟，生長期短，所以既適合在無霜期短的東北地區種植，也適於在無霜期長的江南地區實行一年兩熟。康熙帝決定在更大的地區範圍推廣這種稻種。公元1715年，他首先在江浙地區推廣，令民種植。果然，第一年就在蘇州地區獲得一年兩熟的成績。在推廣“禦稻”的過程中，康熙帝始終將“禦稻”與普通稻進行對比試驗研究，結果是“禦稻”在江浙推廣的第二年，兩季相加畝產已達到五石二鬥，比對照田每畝要多收一石三鬥。四月兩季相加，畝產已高達六石八鬥。增產效果十分明顯，所以很快就被推廣到安徽、江西等地。
清代包世臣在他的《齊民四術》中，提出要在肥地中選擇單穗，分收分存。他把這種單穗選擇育種，稱之為“一穗傳”。這也是地地道道的單株選擇法。
總之，我國古代在人工選擇育種方麵，有著豐富的經驗。達爾文曾從我國古代的人工選擇的豐富經驗中吸取了豐富的養料，並給以高度的評價。他在《動物和植物在家養下的變異》這部著作中寫道：
“在前一世紀，‘耶穌會會員們’出版了一部有關中國的巨大著作，這一著作主要是根據古代《中國百科全書》編成的。關於綿羊，據說‘改良它們的品種在於特別細心地選擇那些預定作為繁殖之用的羊羔，給予它們豐富的營養，保持羊群的隔離。’中國人對於各種植物和果樹也應用了同樣的原理。皇帝上諭勸告人們選擇顯著大型的種子，甚至皇帝還親自進行選擇。關於花卉植物，按照中國傳統，牡丹的栽培已經有1000年了。並且育成了200到300個變種。”
達爾文研究過中國許多著作，他對中國在人工選擇育種方麵取得的重大成就是了解的。他認為，實際上中國古代人民就已經發現了人工選擇的原理。所以他在《物種起源》中說：“如果以為選擇原理是近代的發現，那就未免與事實相差太遠，……在一部古代的中國百科全書中，已經有關於選擇原理的明確論述。”
雜種優勢
我國古代人民在實踐中，還很早就注意到對雜交優勢的利用。馬和驢雜交而產生騾是一例。據《呂氏春秋·愛士》記載：“趙簡子有兩白騾，而甚愛之。”《楚辭》中亦有“同駑鸁與乘駔兮，雜斑駁與闒茸”的詩句。注雲：“馬母驢父，生子曰鸁。”這就是說，古代也稱“騾之為鸁。”由此可見。遠在春秋時代，我國早就有驢馬之雜交所產的騾。關於驢馬之雜交優勢表現，在《齊民要術》等古籍中均有記載。《齊民要術·養馬篇》：“以馬覆驢所生騾者，形容壯犬，彌複勝馬。”李時珍在《本草綱目》中也說：“騾大於驢，而健於馬。”方以智在《物理小識》中說：“騾耐走，不多病。”
有關雜交優勢利用的一個突出例子，是《天工開物》中所記載的明代關於家蠶雜交的工作。《天工開物·乃服篇》說：“凡繭色唯黃白兩種，以、陝、晉、豫有黃無白，嘉湖有白無黃。若將白雄配黃雌，則其嗣變為褐蠶。”又說：“今寒家有將早雄配晚雌者，幻出嘉種，此，一異也。”“幻”是變化的意思，“幻出嘉種”即變化產生了優良蠶種。從這兩則記載，可知當時蠶農做了兩組家蠶雜交工作。其一是，吐黃絲種的雄蠶和吐白絲的雌蠶雜交；其二是雄性的“早種蠶”與雌性的“晚種蠶”雜交。第一組雜交產生了吐褐色絲的雜種，第二組雜交產生了“嘉種”，即產生了優良品種。