中國麵臨災難的深淵。在這種形勢下，毛於1967年9月5日命令軍隊用武力恢複秩序。這位曾經將造反權利授予群眾的領袖現在要把它收回來。毛開始了反對“極左派”的行動，最主要的犧牲者就是中央文革領導小組的幾個成員。他們被指責搞陰謀詭計，隨即被逮捕。江青公開表示要收回過去的言論，這才挽救了她自己。
1968年春夏之際，群眾最後一次奮起反對背叛革命的行為。然而軍隊毫不留情地向造反者開槍。6月，毛將紅衛兵頭目召集在一起，指責他們說：“你們欺騙了我，更主要的是，你們欺騙了工人和農民。”這就成了紅衛兵的終結。毛派遣了幾百萬中學生和大學生到中國的北部和西部那些偏遠的農村，讓他們接受農民的再教育。
1969年4月1日召開了第9次黨代會。毛宣布這是一次“團結的大會和勝利的大會”。林彪做了政治報告，慶祝“文化大革命”勝利結束。在新選出的中央委員會279位正式委員和候補委員中，軍隊的委員幾乎占了一半。軍隊統治了黨。林達到了他權力的高峰。新黨章給他帶上了“毛最親密的戰友和接班人”的桂冠。同時，黨代會指出了最緊迫的任務就是“重新建設黨並發揮它的領導作用”，這預示著下一個衝突的開始。
結局：“文化大革命”埋葬了文化
“文化大革命”是從對共產黨的攻擊開始的，要求重新變成一個革命的黨。它卻是以在古老的列寧主義的形式下重新建設共產黨而結束的。唯一變化了的是：黨的機器又重新掌握在了毛的手中，他是絕對的統治者。毛澤東思想又重新在黨章中確立，除了馬克思、列寧主義，毛澤東思想重新成為了黨的思想基礎。
在“文革”中，幾百萬人的生活遭到破壞，沒有人知道死了多少人，是50萬，還是最新猜測的幾百萬呢？幾百萬人因身體和心靈折磨遭受了嚴重的創傷，並將一直陪伴著他們度過餘生。最早的犧牲品是那些老師、教授、作家、藝術家和過去高階層的家庭成員。許多人被折磨致死或自殺身亡，例如老舍這位寫過《駱駝祥子》的世界知名作家就是其中一例。如果說普遍性的迫害隨著文化革命結束就停止了的話，那麼對知識分子的迫害還延續了十幾年，直到1976年才結束。
黨的幹部和城市裏的政府官員也遭受了不少苦難。約70%的幹部被趕下了台，大多數人活了下來，事後又重新恢複了職務。但也死了不少人，除劉少奇外還有兩位政治局委員也都遇害。1958年廬山會議後被解職的國防部長彭德懷被折磨致死，吳晗也同樣如此。鄧小平由於流放在農村躲過死難，但他的長子鄧樸方卻遭受了紅衛兵的嚴刑拷打，從北京大學的五層樓上跳下，造成下身癱瘓。
大多數死亡的人主要是那些來自紅衛兵和工人造反派隊伍中的人，他們在相互之間的流血衝突中死去，有的在1967年9月5日後被人民解放軍鎮壓或被群眾處決。1968至1969年間，紅衛兵解散後有400多萬高中生和大學生從城市來到農村，後來幾年又有幾百萬人到農村。大多數人在毛去世後又返回了城市，但他們的生活和事業卻受到了影響，成了“失去的一代”。
農村的6億人基本上沒有受到什麼損害。有諷刺意味的是，這些未參與的人是唯一得到“文化大革命”好處的人。劉少奇在1961年將“大躍進”期間建立的大多數集體企業關閉，其原因是沒有效益和浪費資源。毛又重新搞起了農村工業化發展綱要，直到他1976年去世建起了幾十萬家大隊和公社所屬的企業。
1969年，城裏的工廠又恢複了舊秩序，重新強調組織紀律，工人們又被束縛在了嚴格的等級製度中。盡管取消了對個人實行的物資刺激，但工資製度仍然差距很大。工人的工資分8級；技術人員的工資分15級；管理人員從基層到高層，一直到黨的監督幹部的工資分30級。沒有變化的還是兩部分工人，即固定的終生製工人和來自農村的臨時工。實行相對平均的工資待遇的要求被指責為“極左思想”，嚴格禁止。
高等學校的形勢直到毛的時代結束時仍然災難嚴重。1970年，大學重新恢複教學，但教學規模縮減。學生人數僅是“文化大革命”前的1/3。入學考試被取消，許多人上不了大學。沒有任何學術活動，書店空空如也，許多博物館都已關閉。中國陷入了危機的時期。有一尖刻的評論曾這樣寫道：“文化大革命所做的就是埋葬文化。”