的確，根據科學家和日本記者的現場調查，提出了種種否定它是鯊魚的根據：
首先，鯊魚的肉是白的，而怪獸則是赤紅的。
其次，當“瑞洋丸”船員們把它撈上來時，現場沒有一個人肯定它是鯊魚，為什麼呢？記者調查了這個問題。原來鯊魚沒有排尿器，體內積蓄的尿是利用海水的浸透壓力，從全身排出的。因此，鯊魚的肉有一種尿特有的臭味，有經驗的漁民都會聞出來。“瑞洋丸”的漁民們正是由於這一點而否定了它是鯊魚。
再次，如果真是鯊魚，那麼具有軟骨架的鯊魚在死了半年之後，是絕對不會被起重機吊起來的。因為屍體開始腐爛，軟骨也開始腐爛，屍體的軟骨架絕對經受不住大約兩噸的自重。對此，許多魚類學權威都認為這是否定鯊魚說的一個重要論據。
最後，怪獸有較厚的脂肪層包裹在全身的肌肉上，而鯊魚隻在肝髒裏才有脂肪。
於是，從鯊魚說又轉回到爬行類動物說。證明怪獸可能是爬行類動物還有一個重要的論據，即怪獸的頭部呈三角形，這是爬行類獨具的特點，日本著名科學漫畫家石森章太郎根據骨骼草圖，畫了一幅怪獸複原圖，如果照此圖來看，它可真像一個爬蟲類動物了。
1977年9月1日和19日，在日本東京召開了兩次有關怪獸身份問題的學術討論會，參加會議的人有魚類、化石、鯨魚、古生物學、比較解剖學、生物化學、血清等方麵的學者共19人。他們研究了照片、草圖和鰭須的組織切片，進行了認真地討論，寫出了9篇論文。綜合兩次座談會的討論意見，會議主持人、東京水產大學校長佐木忠義於同年12月15日下午向報界發表了日本學術界的研究結論：
第一，從怪獸鰭端須條的化學成分來看，得不出是鯊魚的結論；
第二，從怪獸的兩對腹鰭、長身體、長尾巴以及身體表麵都是脂肪等特點來看，是和迄今已知的魚類完全不同的一種動物；
第三，在分類學上，很可能是代表著全新的一種人類未認識的動物（海棲爬蟲類？）。
現在，人們都盼望在南緯43°，東經門48°曾經打撈上怪獸屍體的地方，有一天會再現怪獸的蹤影。或許它正是人們所期待的史前爬行動物。歐哥波哥怪物
一些深達200～300米的湖中，發現湖怪的事例很多，在未得出結論之前，暫且算做尼西的同類吧。於是有的生物學家說：“拜托了，請多注意深湖裏到底有什麼怪物吧。”如果說某些湖中確實有著人們不認識的龐然大物的話，那它們隻能是祖居在湖中的了。有意思的是發現怪獸的湖，雖然麵積不算大，卻都很深，而且是地質年代久遠的湖泊。這麼多的湖怪是不是都是人們的妄談或者神智錯亂的胡說呢？看來不像。不管怎麼說，尼西始終成為近代生物學上一個最大的謎。
就在最近，從新華社傳來一則報道怪獸的新消息。消息來自於挪威，一支新組織的國際探險隊準備揭開挪威南部泰勒馬克地區的塞爾尤爾湖怪獸之謎。據說這個湖中類似尼西的怪獸已困擾了當地居民達250年之久。從1998年8月4日起，探險隊將在這個深水湖展開搜查，探險隊隊長瑞典人鬆德貝裏對記者說：“如果湖中確實存在著一種至今人們還不認識的動物，那麼今年夏天我們就要把它找出來。”看來人們探索深水湖怪獸的工作遠沒有結束。他們在加拿大的既深又神秘的內陸水域中見過奇怪的生物，並且這些報告是經常不斷，而且是來自最近時期的。
遠在歐洲人到達這裏之前，土生土長的加拿大人就已在他們自己的曆史中對湖怪做了大量的解釋性陳述。尤其常常提到的是歐哥波哥怪物，據報告它是來自奧卡納貢湖。這個湖很深，全長有128公裏，在太平洋沿岸的英屬哥倫比亞。這個眾所周知的名字更像20世紀歌廳裏的一首曲名，而與奧卡納貢湖的關於那個怪物起源的真實傳說聯係不多。這個傳說未必是真實的，一個叫老肯海克的人在這湖的附近被謀殺，人們便用他的名字命名這個湖，借以紀念他。上帝將這個凶手變成一條巨大的水蛇來懲罰他，並且判決他永遠地以這種模樣留在他犯罪的現場。傳說中，這個怪物生活在響尾蛇島附近的“暴風角”海麵的深水岩洞中，當地的人們向水中投入小動物作為食物以平息這個怪物。
這很像芬蘭神話故事中的一段，在這個神話中，一個長得像巨大青蛙的動物稱之為“伏迪亞諾”的水怪，時常出沒於磨坊的水塘。磨坊主們往往把毫無戒備的旅行者扔進水中，喂食他們當地的“伏迪亞諾”，從而保護自己和他們的家人。
還有，根據古老的奧卡納貢傳說，在這個湖的兩端以及這個水蛇喜歡出沒的響尾蛇島和傳教河穀之間，人們都曾見過它。
加拿大和北美洲到處流傳著關於奇異水棲生物的民間傳說。上百個湖泊和河流有著它們自己的關於怪物棲息的故事。新斯科舍省的密克馬克族人有一個他們稱為大水蛇的傳說，居住在密克馬克族人西部的阿爾岡昆族人也有這樣的傳說。密克馬克人還有許多關於半人半魚動物的神秘傳說。在密克馬克人的一個古老的傳說中，英雄威斯蒂普拉娶了一位美麗而神秘的海婦人，她是虎鯨的妹妹。隻要他把她留有內陸上，她就能以人的模樣陪伴他。若是她再次來到海灘，她就將恢複原貌，並帶走他們的孩子，隨她返回海洋中的虎鯨家庭。在他們共同生活了多年以後，他們遇上了一次大的暴風雨，迷了路，他們沒有辦法，隻好回到了海邊。在海邊咒語靈驗了，他失去了她，她又一次回到了她在海裏的同類中間。
紐約州北部的艾麗奎人講述了一個叫“大水獸”的故事，而印第安納州的波塔瓦托米人也有怪物居住在“大神湖”的傳說。在19世紀中期，波塔瓦托米人強烈反對在當地建造一個磨坊，因為那將嚴重妨礙這個水獸的生活。
再往西部去，肖尼人有一個獨特的傳說，那就是很久以前他們的一個偉大的英雄巫師同一個半魚樣的怪物進行過決鬥。一個年輕的姑娘參與了此事，並且在使英雄打敗怪物的過程中起了決定性作用。這個故事與下麵的傳說有著非同尋常的相似之處：聖·喬治龍口救公主，宙斯的兒子伯爾修斯救安德洛墨達，底比斯的卡德摩斯在雅典女神的幫助下殺死了一個怪物，女巫美狄亞幫助賈森戰勝怪物，保護金羊毛。它甚至和關於凱瑟琳·德梅迪西的離奇的故事相似。這個故事講的是富有而又生活乏味的凱瑟琳·德梅迪西獲得了一個“水怪”，並在一次水節上用它來招待客人。
對於俄勒岡州威拉米河的卡拉布亞人，阿塔基是他們熟知的當地水怪的名字，但是關於“尚普”這個名字可能有些含混之處。“尚普”是尚普蘭湖裏著名怪物的名字，人們猜測這個湖是法國偉大的探險家塞纓爾·德尚普蘭於1609年發現的。這位可敬的法國航海家兼無所畏懼的冒險家的確提起到他曾遭遇過一個可怕的水怪，但這是在更遠處的聖勞倫斯河口東北方向上。
如果說多數的目擊情況都是真實的，或充其量是由誠實可敬的觀察者們所犯的誠實的錯誤，那麼，發生在紐約州銀湖旁邊佩裏地方的事件則是一樁露骨的騙局。
1855年，關於湖中有一怪物的報告在當地肆意流傳，並引起了極大的轟動。這些目擊情況持續了兩年多的時間，並且自然地吸引了許多遊客。之後，當地的一家旅店發生了一場火災，當消防隊趕來滅火時，他們在頂樓裏發現了這個“湖怪”。旅店店主製造了這個怪物，並用壓縮空氣來運轉它。店主希望它在銀湖上出現會吸引遊客並改善他的生意。是的，這兩個目的都達到了。在當初的憤怒和失望過去以後，現在佩裏的居民們每年都舉辦一個節日，以紀念這位大膽的旅店老板的獨出心裁。
關於龍王鯨、械齒鯨和歐哥波哥怪物的認真而又詳細的報告往往會同意，那就是這個怪物是體長21米的某種東西。它的身體大約有10米厚，它的頭被許多目擊者描繪為長得像馬、牛或羊的頭，而馬是被用來做比較次數最多的。
有位目擊者在奧卡納貢湖遊泳時，真的撞上了一個又大又重的東西，當時她是十幾歲的孩子。她向“國際隱居動物學學會”的小理查德·格林威爾做了全麵的報告。為了隱匿她的身份，就簡單稱她為“克拉克夫人”吧。她告訴格林威爾說，事情發生在1974年7月的一個溫暖的早晨，時間大約是8點，當時她正在湖中向一木筏遊去，那木筏被用作跳水平台，距湖邊有457米。在她幾乎觸到木筏的時候，這時她感到有什麼東西碰到了她的雙腿。無論它是什麼，都是龐大的、結實的和很重的東西。遇上這種意外的水下碰撞，她吃驚與恐懼的樣子是可想而知的，她盡其所能快速地爬上了木筏。那個怪物距離她不足6．1米，而且湖水是清澈的。據她的描述，那怪物有一個峰或一個盤狀的東西，就像來自蘇格蘭尼斯湖報告中常常提到的那個大怪物。根據“克拉克夫人”的描述，那個峰或盤狀的東西有2．7米或3米長，露出水麵將近0．5米。當她觀看時，它正在水中向前移動。她說它當時正在離開她，向北遊去。她看到的尾巴大約在隆峰後3米的地方，她說那尾巴就像鯨魚的尾巴，即那尾巴是水平狀的，並幾乎明顯地分為兩個部分。她估計大約有2．8米寬。這個怪物大部分的遊水方法是，當隆峰或盤狀物進到水裏時，它的尾巴便抬起來。“克拉克夫人”想起來，那尾巴曾有一度破出水麵幾英寸，也許接近0．3米。她看了這個怪物有四五分鍾，可是她發現很難將它歸類。在某種程度上，它讓她想起的是鯨魚而不是魚，但是她也覺得，它作為一條鯨魚又有點太苗條了。它身體的顏色是深灰色，給她的印象是沒有脖子，就像魚一樣，頭與身體是相連的。