鄱陽湖87種軟體動物中，腹足綱8科16屬40種，雙殼綱4科17屬47種，其中的40種為我國的特有物種。其中，腹足綱的種類主要以中國圓田螺、銅鏽環棱螺、方形環棱螺、長角涵螺、中華沼螺等分布較廣且數量較多，河圓田螺、包氏環棱螺、長河螺、色帶短溝蜷等數量稀少。
鄱陽湖底棲動物的分布因水深、水流、底質和水生植物生態類型的種類和數量有顯著的差異。在沉水植物區雙殼類占絕對優勢，其次是湖北釘螺、中華沼螺和紋沼螺。
在菰叢區則主要是腹足類的梨形棱螺、中國圓田螺和中華圓田螺。在河口、河道中有大量的刻紋蜆、背角無齒蚌、方格短鉤蜷、銅鏽環棱螺、背瘤麗蚌等。
底質有機質豐富的地帶，方形環棱螺和中華圓田螺的數量較多。湖中的消落區軟體動物貧乏。寡毛類和搖蚊幼蟲分布全湖，但菰叢區比沉水植物區大，湖西北的密度比湖東南大。
鄱陽湖蝦類有8種，占江西已知蝦類10種的80%，其中秀麗白蝦和日本沼蝦為優勢種。鄱陽湖有蟹類4種，占江西已知蟹類14種的28.57%。中華絨螯蟹分布在長江和鄱陽湖等地。
當然，鄱陽湖濕地還擁有豐富的魚類資源和鳥類資源。鄱陽湖已記載魚類有140種，主要優勢種為鯉、鯽、鯿、魴、鮊、鯇、青、鰱、鱅等。屬國家一級保護動物有白鱘和中華鱘，二級保護動物有胭脂魚。
為保護和合理利用鄱陽湖漁業資源，江西省政府在鄱陽湖劃定了休漁區和休漁期。每年3月20日至6月20日是休漁期，在冬季還實行輪換休港，以保護魚類越冬。
鄱陽湖已知鳥類310種，其中典型的濕地鳥類159種。按居留型分，留鳥45種，冬候鳥155種，夏候鳥107種，迷鳥3種，有13種為世界瀕危鳥類。屬國家保護動物的有54種，其中一級保護動物10種：白鶴、白頭鶴、大鴇、東方白鸛、黑鸛、中華秋沙鴨、白肩雕、金雕、白尾海雕和遺鷗；二級保護動物44種，如小天鵝、卷羽鵜鶘、白枕鶴、灰鶴、沙丘鶴、白額雁、白琵鷺等。
近年來，鄱陽湖又成為東方白鸛的重要棲息地，2800多隻東方白鸛在鄱陽湖越冬，約占世界總數的80%。
總體而言，鄱陽湖的東部餘幹、波陽一帶由過去以雁鴨類為主，擴展為鶴類、鸛類、小天鵝、白琵鷺以及雁鴨類的較重要越冬棲息地。
鄱陽湖南部南磯山、南昌、新建和進賢一帶由過去以小天鵝、雁鴨類為主，擴展為以保護區為中心的鶴類、鸛類、小天鵝、白琵鷺、猛禽和雁鴨類以及鷗類、鷸類等的重要棲息地。
鄱陽湖北部廬山區、湖口一帶以雁鴨類、鷺類、鸕鶿等為主，都昌新妙湖、三山、泗山、朱袍山等島嶼一帶由過去以雁鴨類為主，擴展為以白鶴、東方白鸛、小天鵝、雁鴨類、鷺類為主的較重要棲息地。
從鄱陽湖濕地係統的生態脆弱性方麵來看，水文、土壤和氣候形成了濕地生態係統環境主要素，進而影響生物群落結構，改變濕地生態係統。
鄱陽湖濕地還具有生產力高效性，濕地生態係統同其他任何生態係統相比，初級生產力較高。
鄱陽湖濕地的效益具有綜合性，具有調蓄水源、調節氣候、淨化水質、保存物種、提供野生動物棲息地等基本生態效益,也具有為工農業、能源、醫療業等提供經濟效益。
拓展閱讀
鄱陽湖原叫彭蠡湖，相傳在遠古時期，贛北有一位叫彭蠡的勇士，立誌要開鑿一個大的湖泊造福於民。彭蠡的善舉感動了天上司晨的酉星官，就派自己的兒子下凡幫助他。後人為紀念彭蠡，就將造成的湖取名“彭蠡湖”。