烴氧化菌還可以為人類除弊興利。工業廢水中常常含有能汙染環境的有毒烴，人們利用烴氧化菌的食性，在廢水池中“放養”少量烴氧化菌，它們邊“吃”邊繁殖，最後，有毒烴被吃光了，廢水也就變成了有用的水。烴氧化菌本身又是優質飼料。甲烷菌
在泥濘的沼澤或水草茂密的池塘裏，生活著無數專愛“吹”氣泡的小生命，名叫甲烷菌。
甲烷菌是地球上最古老的生命林。在地球誕生初期，死寂而缺氧的環境造就了首批性情隨和的“生靈”，它們不需要氧氣便能呼吸，僅靠現成簡單的碳酸鹽、甲酸鹽等物質維持生計，然而它們具有生命實體——細胞，並開始自然繁殖。這就是生物的鼻祖——甲烷菌。時至今日，地球幾經滄桑，甲烷菌卻本性難移，仍保持著厭氧本色。當然，現代甲烷菌的“食物”來源更加廣泛，雜草、樹葉、秸稈，食堂裏的殘羹剩飯，動物糞尿，乃至垃圾等等都是甲烷菌的美味佳肴。沼澤和水草茂密的池塘底部極為缺氧，甲烷菌躲在這裏“飽餐”一頓之後，便舒心地呼出一口氣來，這便是沼氣泡。
沼氣泡中充滿沼氣。沼氣的主要成分是甲烷，另外還有氫氣、一氧化碳、二氧化碳等。它是廉價的能源，用於點燈做飯，既清潔又方便；還可以代替汽油、柴油，是一種理想的氣體燃料。
現在世界上大多數國家都在為燃料不足而發愁，開發利用新能源已成為世界性的緊迫問題。而小小微生物卻能為人類分憂，在解決能源危機的問題上作出了自己的貢獻。在國外，已有許多工廠使用沼氣作燃料開動機器。我國也有不少地區特別是農村興建了沼氣池，人工培養微生物製取沼氣。據估計，每立方米沼氣池可以生產6000千卡左右的熱量，可供一個馬力的內燃機工作24小時；供一盞相當於60-100瓦電燈亮度的沼氣燈照明5-6小時。還可以建成沼氣發電站把生物能變成電能。
甲烷菌的食料非常廣泛，幾乎所有的有機物都可以用作沼氣發酵的原料。沼氣池則為甲烷菌提供了一個缺氧的環境。在這裏，甲烷菌可以愉快地勞動，源源不斷地產生沼氣。一個年產2萬噸酒精的工廠，如將全部酒精廢液生產沼氣，每年可得沼氣1100萬立方米，相當於9000噸煤。而且，被甲烷菌“吞嚼”過的殘渣，還是莊稼的上等肥料，肥效比一般農家肥還高。蘇雲金杆菌
在微生物王國中，有一大批滅蟲勇士。千百年來，它們悄悄地幫助人類殺滅害蟲，保護莊稼。然而，它們的功績直到近百年來才被人們發現。
1911年，德國人貝爾奈在蘇雲金這個地方的一家麵粉廠裏，發現有一種寄生在昆蟲體內的細菌，有很強的殺蟲力，於是，人們稱這種細菌為蘇雲金杆菌。
蘇雲金杆菌長得像根棍棒，矮矮胖胖，身高不到千分之五毫米。當它長到一定階段，身體一端會形成一個卵圓形的芽孢，用來繁殖後代；另一端便產生一個菱形或近似正方形的結晶體，因為它與芽孢相伴而生，我們叫它伴孢晶體，有很強的毒性。當害蟲咬嚼莊稼時，同時把蘇雲金杆菌吃進肚去，這就像孫悟空鑽進鐵扇公主的肚子裏去一樣，在害蟲的肚子裏大顯威風。它的伴孢晶體含有的毒素可以破壞害蟲的消化道，引起食欲減退，行動遲緩，嘔吐、腹瀉；而芽孢能通過破損的消化道進入血液，在血液中大量繁殖而造成敗血症，最終使害蟲一命嗚呼。
蘇雲金杆菌的發現，為人們利用微生物消滅植物病蟲害提供了美好的前景。現在，人們已經用發酵罐大規模地生產蘇雲金杆菌，經過過濾、幹燥等過程製成粉劑或可濕劑、液劑，噴灑到莊稼上，對棉鈴蟲、菜青蟲、青蛾、鬆毛蟲以及玉米螟、高粱螟、三化螟等一百多種害蟲有不同的致病和毒殺作用。食用真菌
在家庭餐桌上，我們經常可以吃到味美可口的蘑菇、香菇一類食用菌，這就是微生物對人類的奉獻。
早在二三千年前，我國人民就已把菇菌作為珍貴的食用菌了，而且很早就懂得食用菌的栽培。食用菌類一般都是高等真菌的子實體，在我國發現的不下350多種，常見的有蘑菇、草菇、香菇、平菇、鳳尾菇、金針菇、黑木耳、鬆口蘑、竹蓀、羊肚菌、牛肝菌等多種。這些食用菌味道鮮美，營養豐富，含有豐富的蛋白質、脂肪、糖、維生素、礦物質等營養成分。而且某些食用菌對動植物病毒性疾病有免疫或抑製作用，還能抑製腫瘤發生和發展，並能溶解一定量的膽固醇，所以被人們稱為“保健食品”。
早先，這些食用真菌野生在山林、草地、田野裏。當你走進潮濕的林地上，揀起一塊潮濕的朽木或幾片腐葉，不用放大鏡也能看見許多絲狀物，這常常就是它們的菌絲體。發育良好的菌絲，能鑽進木材、落葉的組織裏，吸取養料。像蘑菇等的菌絲體上，會長出一把漂亮的“小傘”，這就是子實體。子實體上麵是平整的，而下麵密生著許多叫菌褶的薄膜，長著能繁殖後代的擔子或擔孢子，能隨風飛散，到它們喜歡的地方去“安家”。現在，人們掌握了它們的生長發育習性，可以采用人工栽培的方法，大量地生產了。
在高等真菌中，還有許多可以作為藥用的菌類。例如有補中、固腎、益脾、補肺、止血作用的靈芝、滋陰、補腎、潤肺、強精、補血提神的銀耳，滋補、助消化、退熱、利尿、消腫的茯苓。還有對消化道腫瘤有較好療效，又可治神經衰弱、消化不良等慢性疾病的猴頭，可以做止血外敷藥的馬勃等等。
琳琅滿目、奇妙誘人的真菌大家族中，蘊藏著豐富資源，等待我們去開發和利用。疫苗
許多細菌和病毒會給人類帶來疾病，造成死亡，然而，人們也正是利用這類細菌和病毒以毒攻毒，把它注射到正常人的身體裏，使人體在後天產生對某種疾病的抵抗力。這種用來注射的細菌和病毒，就是疫苗(或菌苗)。
疫苗的利用，可以追溯到10世紀我國宋朝時代，當時一些民間醫生就已知道用天花病人的豆痂，吹進健康人的鼻孔裏，使他在患輕微的天花病過程中，獲得對天花病毒的免疫力。